The invention relates to the field of molecular computing, in particular to DNA strand replacement technology, in particular to a remote DNA strand replacement method for magnesium ion-induced E6 -type DNA ribozyme mutagenesis. In DNA strand replacement, the foothold and branch migration domain are separated, and they need not be adjacent to each other in DNA sequence design. A new DNA strand replacement regulation method is provided by using metal ions to induce DNA strand replacement. Remote DNA strand replacement is realized, which increases the flexibility of DNA strand replacement.
【技术实现步骤摘要】
一种镁离子诱导E6-typeDNA核酶变构的远程DNA链置换方法
本专利技术涉及分子计算领域，尤其涉及DNA链置换技术，具体涉及一种镁离子诱导E6-typeDNA核酶变构的远程DNA链置换方法。
技术介绍
分子计算是一种以生物大分子为存储媒介，通过生物大分子之间的可控生化反应实现信息处理的一种新的计算模式。在分子计算中，DNA计算以DNA分子为媒介，充分利用DNA分子的碱基互补特性及碱基序列的可编程性，实现信息在DNA分子上的存储与处理，当前DNA计算是一种引起广泛关注的分子计算模式。DNA链置换利用DNA分子杂交过程中自由能趋于稳定的规律，以立足点为入口，通过在立足点处的碱基互补，实现对分支迁移域上互补DNA单链的置换，即用长DNA单链，通过立足点的诱导，实现对短DNA单链的替代与置换。目前，链置换技术通过与荧光检测、纳米颗粒、自组装等技术相结合，获得了迅速发展，在DNA计算乃至分子计算中得到了广泛的应用，如用于DNA逻辑门构建、神经网络构造、蛋白质计算、纳米结构、金属离子检测等等。DNA核酶是一段特定的DNA序列，兼具DNA序列和酶催化的双重特点，作为DNA序...
【技术保护点】
1.一种镁离子诱导E6‑type DNA核酶变构的远程DNA链置换方法，其特征在于，该方法包括以下步骤：步骤1：将E6‑type DNA核酶的底物结合臂t和d分别作为远程链置换的立足点t和分支迁移域d，构造DNA片段t和d的DNA碱基序列；步骤2：基于DNA片段t和d的碱基序列，构造DNA双链[d,t*xd*]；步骤3：将DNA双链[d,t*xd*]和E6‑type DNA核酶混合，此时由于没有镁离子，E6‑type DNA核酶与DNA双链[d,t*xd*]不发生链置换反应；步骤4：在步骤3的混合物中加入镁离子Mg2+，E6‑type DNA核酶和DNA双链[d,t*xd*...
【技术特征摘要】
1.一种镁离子诱导E6-typeDNA核酶变构的远程DNA链置换方法，其特征在于，该方法包括以下步骤：步骤1：将E6-typeDNA核酶的底物结合臂t和d分别作为远程链置换的立足点t和分支迁移域d，构造DNA片段t和d的DNA碱基序列；步骤2：基于DNA片段t和d的碱基序列，构造DNA双链[d,t*xd*]；步骤3：将DNA双链[d,t*xd*]和E6-typeDNA核酶混合，此时由于没有镁离子，E6-typeDNA核酶与DNA双链[d,t*xd*]不发生链置换反应；步骤4：在步骤3的混合物中加入镁离子Mg2+，E6-typeDNA核酶和DNA双链[d,t*xd*]发生链置换反应，置换出DNA单链d。2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：...
【专利技术属性】
技术研发人员：郑学东，张强，魏小鹏，范纯龙，
申请(专利权)人：沈阳航空航天大学，
类型：发明
国别省市：辽宁,21
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