一种病原体感染损伤机理解析方法及装置制造方法及图纸

本发明专利技术实施例提供的一种病原体感染损伤机理解析方法及装置，属于基因数据处理领域。该方法包括：获取多个基因沉默后的全基因组表达数据；获取所述全基因组表达数据所对应的基因表达秩序列；获取多种不同病原体感染后的全基因组表达谱数据；基于所述全基因组表达谱数据构建所述病原体感染的印记基因集；获取所述基因表达秩序列与所述印记基因集的富集分数；根据所述富集分数确定所述病原体感染的损伤机理，从而融合了海量各类跨平台的转录组大数据，无需从头培养病原体并感染细胞，做大规模的实验，进而降低了研发低成本、缩短了检测周期。并且减少了实验误差，使得对病原体感染的损伤机理的分析更加精确。

An Analytical Method and Device for Pathogen Infection Damage Mechanism

The embodiment of the invention provides an analytical method and device for pathogen infection damage mechanism, which belongs to the field of gene data processing. The method includes: acquiring genome-wide expression data after silencing multiple genes; acquiring the sequence of gene expression corresponding to the genome-wide expression data; acquiring genome-wide expression data after infection by various pathogens; constructing the imprinted gene set of the pathogen infection based on the genome-wide expression data; acquiring the sequence of gene expression and the imprinting. According to the enrichment fraction, the damage mechanism of the pathogen infection is determined, which integrates a large amount of transcriptome data of various cross-platforms. It does not need to cultivate the pathogen from scratch and infect the cells to carry out large-scale experiments, thus reducing the cost of research and development and shortening the detection cycle. The experimental error is reduced, which makes the analysis of the damage mechanism of pathogen infection more accurate.

【技术实现步骤摘要】
一种病原体感染损伤机理解析方法及装置
本专利技术涉及基因数据处理领域，具体而言，涉及一种病原体感染损伤机理解析方法及装置。
技术介绍
目前现有的差异表达基因分析通过分析未知病原体感染造成的基因表达差异，然后针对差异表达倍数变化最大的基因来解析未知病原体感染的损伤机理，然而需要从头培养病原体并感染细胞，做大规模的实验，费时费力，并且单个基因的分析可能会遗漏一些重要的通路，或者是不同的研究机构关于相同的生物系统得出的差异表达基因只有很少的重复。
技术实现思路
本专利技术实施例提供的一种病原体感染损伤机理解析方法及装置，可以解决现有技术中存在的解析未知病原体感染的损伤机理时需要费时费力的技术问题。为了实现上述目的，本专利技术实施例采用的技术方案如下：第一方面，本专利技术实施例提供的一种病原体感染损伤机理解析方法，包括：获取多个基因沉默后的全基因组表达数据；获取所述全基因组表达数据所对应的基因表达秩序列；获取多种不同病原体感染后的全基因组表达谱数据；基于所述全基因组表达谱数据构建所述病原体感染的印记基因集；获取所述基因表达秩序列与所述印记基因集的富集分数；根据所述富集分数确定所述病原体感染的损伤本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种病原体感染损伤机理解析方法，其特征在于，包括：获取多个基因沉默后的全基因组表达数据；获取所述全基因组表达数据所对应的基因表达秩序列；获取多种不同病原体感染后的全基因组表达谱数据；基于所述全基因组表达谱数据构建所述病原体感染的印记基因集；获取所述基因表达秩序列与所述印记基因集的富集分数；根据所述富集分数确定所述病原体感染的损伤机理。

【技术特征摘要】
1.一种病原体感染损伤机理解析方法，其特征在于，包括：获取多个基因沉默后的全基因组表达数据；获取所述全基因组表达数据所对应的基因表达秩序列；获取多种不同病原体感染后的全基因组表达谱数据；基于所述全基因组表达谱数据构建所述病原体感染的印记基因集；获取所述基因表达秩序列与所述印记基因集的富集分数；根据所述富集分数确定所述病原体感染的损伤机理。2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述获取多个基因沉默后的全基因组表达数据，包括：从LINCS数据库获取多个基因沉默后的全基因组表达数据。3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述基于所述全基因组表达谱数据构建所述病原体感染的印记基因集，包括：获取所述全基因组表达谱数据所对应的差异表达量；按照所述差异表达量从高到低将所述全基因组表达谱数据所对应的基因从上到下排列，得到秩序列；从所述秩序列顶部与底部获取多个基因；将所述多个基因作为所述病原体感染的印记基因集。4.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述根据所述富集分数确定所述病原体感染的损伤机理，包括：确定所述富集分数是否为正数；若是，根据所述富集分数确定所述基因沉默的细胞反应和所述病原体感染损伤的细胞反应一致。5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，所述确定所述富集分数是否为正数，包括：确定所述印记基因集中的目标基因子集合是否位于所述基因沉默下的所述基因表达秩序列的对应位置；若是，则确定所述富集分数为正数。6.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述根据所述富集分数确定所述病原体感染的损伤...

【专利技术属性】
技术研发人员：伯晓晨，何松，文昱琦，宋欣雨，刘祯，杨晓曦，
申请(专利权)人：中国人民解放军军事科学院军事医学研究院，
类型：发明
国别省市：北京,11