【技术实现步骤摘要】
自动获取HER2荧光原位杂交结果的方法、设备及介质
本专利技术属于图像处理
，特别是涉及FISH图片图像处理
，具体为一种自动获取HER2荧光原位杂交结果的方法、设备及介质。
技术介绍
HER2是原癌基因人类表皮生长因子受体2基因，定位于染色体17q12-21.32上，是乳腺癌极为重要的提示预后和指导治疗的临床标志物。目前临床已有的检测方法包括免疫组化、FISH、CISH等。对于HER2免疫组化阳性结果不确定的情况，尤其是HER2免疫组化阳性表达为2+的情况下，应由FISH方法检测确定HER2基因扩增状态。FISH技术被认为是目前检测HER2基因是否扩增的“金标准”。临床现已有针对乳腺癌HER2基因扩增阳性的靶向药物赫赛汀。FISH检测结果判读，需要医生计数至少20个细胞核中HER2基因信号总数和CEP17基因(17号染色体的标志性特征)信号总数，从而计算出每个肿瘤细胞中两种信号的平均值以及HER2和CEP17比值来判断HER2基因是否扩增。在这个过程中，医生需要耗费大量时间去做重复性计数，一方面如果计数的肿瘤细胞数量不足或者计数出现失误，会影响检测结...
【技术保护点】
1.一种自动获取HER2荧光原位杂交结果的方法，其特征在于，所述自动获取HER2荧光原位杂交结果的方法包括：分别获取使用荧光显微镜在红色滤光片下拍摄的FISH图片、绿色滤光片下拍摄的FISH图片及蓝色滤光片下拍摄的FISH图片；从所述红色滤光片下拍摄的FISH图片中检测出HER2基因信号，从所述绿色滤光片下拍摄的FISH图片中检测出CEP17基因信号，从所述蓝色滤光片下拍摄的FISH图片中检测出肿瘤细胞；根据检测出的所述肿瘤细胞获取所述红色滤光片下拍摄的FISH图片中与所述肿瘤细胞位置对应的HER2基因信号，形成HER2基因判断信号，获取所述绿色滤光片下拍摄的FISH图片中...
【技术特征摘要】
1.一种自动获取HER2荧光原位杂交结果的方法，其特征在于，所述自动获取HER2荧光原位杂交结果的方法包括：分别获取使用荧光显微镜在红色滤光片下拍摄的FISH图片、绿色滤光片下拍摄的FISH图片及蓝色滤光片下拍摄的FISH图片；从所述红色滤光片下拍摄的FISH图片中检测出HER2基因信号，从所述绿色滤光片下拍摄的FISH图片中检测出CEP17基因信号，从所述蓝色滤光片下拍摄的FISH图片中检测出肿瘤细胞；根据检测出的所述肿瘤细胞获取所述红色滤光片下拍摄的FISH图片中与所述肿瘤细胞位置对应的HER2基因信号，形成HER2基因判断信号，获取所述绿色滤光片下拍摄的FISH图片中与所述肿瘤细胞位置对应的CEP17基因信号，形成CEP17基因判断信号；根据所述HER2基因判断信号、所述CEP17基因判断信号以及HER2基因是否为阳性的判断标准获取HER2荧光原位杂交结果。2.根据权利要求1所述的自动获取HER2荧光原位杂交结果的方法，其特征在于，所述从所述红色滤光片下拍摄的FISH图片中检测出HER2基因信号的一种实现方式包括：对所述红色滤光片下拍摄的FISH图片抽取红色通道并抑制其他通道的干扰，形成红色通道图片；对所述红色通道图片进行信号边缘检测，确定所述红色通道图片中信号区域；计算所述信号区域内的平均灰度值，并将所述平均灰度值作为阈值进行阈值化处理，得到所述HER2基因信号。3.根据权利要求1所述的自动获取HER2荧光原位杂交结果的方法，其特征在于，所述从所述绿色滤光片下拍摄的FISH图片中检测出CEP17基因信号的一种实现方式包括：对所述绿色滤光片下拍摄的FISH图片抽取绿色通道并抑制其他通道的干扰，形成绿色通道图片；对所述绿色通道图片进行信号边缘检测，确定所述绿色通道图片中信号区域；计算所述信号区域内的平均灰度值，并将所述平均灰度值作为阈值进行阈值化处理，得到所述CEP17基因信号。4.根据权利要求1所述的自动获取HER2荧光原位杂交结果的方法，其特征在于，所述从所述蓝色滤光片下拍摄的FISH图片中检测出肿瘤细胞的一种实现方式包括：通过预设的肿瘤细胞检测模型从所述蓝色滤光片下拍摄的FISH图片中检测出肿瘤细胞。5.根据权利要求4所述的自动获取HER2荧光原位杂交结果的方法，其特征在于，所述肿瘤细胞检测模型的一种获取过程包括：将多个蓝色滤光片下拍摄的FISH图片中的肿瘤细胞通过标注框进行标注，获得训练图片集；通过所述训练图片集对目标检测神经网络模型进行训练，得到肿瘤细胞检测模型。6.根据权利要求4或5所述的自动获取HER2荧光原位杂交结果的方法，其特征在于，根据检测出的所述肿瘤细胞获取所述红色滤...
【专利技术属性】
技术研发人员：叶德贤，
申请(专利权)人：上海杏脉信息科技有限公司，
类型：发明
国别省市：上海,31
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