用于IHC图像分析的空间索引创建制造技术

本发明专利技术涉及一种用于分析IHC组织样本(100)的图像分析方法。该方法包括：‑为数字图像(106.1‑106‑4；106.5‑106.7)的一个或多个集合(112；113)中的每一个在空间DBMS(316)的空间数据库(318)中存储(702)集合ID，每个数字图像集的数字图像描绘IHC组织样本的相同(102)或相邻层(102；110；108)；‑为每个数字图像在空间数据库中存储(704)与集合ID相关联的多个空间数据对象，每个空间数据对象是点，线，多边形或其组合并表示组织样本的生物医学特征；‑通过空间DBMS创建(706)至少一个空间索引，该空间索引覆盖包含在一个或多个集合中的数字图像的空间数据对象；‑选择(708)数字图像的一个或多个集合中的一个；‑通过空间DBMS对至少一个空间索引应用(710)空间数据库操作，以确定所选数字图像集的两个或更多个数字图像的空间数据对象的相对位置；‑提供(712)相对位置作为输入，用于确定由两个或更多个数字图像的空间数据对象表示的组织样本的生物医学特征的距离和/或相对位置。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于IHC图像分析的空间索引创建描述专利
本专利技术涉及一种用于分析IHC组织样本的图像的图像分析系统。背景和相关技术存在多种病理学数字成像解决方案，旨在生成大量组织样本的数字图像和/或生成全切片(wholeslide)的高分辨率图像。用于诊断，教育和研究目的的大量数字图像，特别是高分辨率全切片图像的处理可能非常复杂并且可能消耗大量计算资源，特别是CPU和内存。计算机处理能力，数据传输速度和云存储解决方案的增益使得数字图像在病理学中用于更广泛的目的，但是处理和分析大量数字图像，特别是全切片图像，仍然是一个通常无法以合理的成本使用现有图像处理技术充分解决的技术挑战。本专利技术的目的是提供一种改进的图像分析系统和相应的图像分析方法。专利技术概述本专利技术提供了用于分析IHC组织样本的图像分析系统，相应的图像分析方法和数据库管理系统，如各个独立权利要求所述。在从属权利要求中给出了本专利技术的实施方案。本专利技术的实施方案可以彼此自由组合，只要它们不相互排斥。在一个方面，本专利技术涉及用于分析IHC组织样本的图像分析方法。该方法包括：-为数字图像的一个或多个集合中的每一个在空间DBMS的本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种用于分析IHC组织样本(100)的图像分析方法，该方法包括：‑为数字图像(106.1‑106‑4；106.5‑106.7)的一个或多个集合(112；113)中的每一个在空间DBMS(316)的空间数据库(318)中存储(702)集合ID，每个数字图像集的数字图像描绘IHC组织样本的相同(102)或相邻层(102；110；108)；‑为每个数字图像在空间数据库中存储(704)与集合ID相关联的多个空间数据对象，每个空间数据对象是点，线，多边形或其组合并表示组织样本的生物医学特征；‑通过空间DBMS创建(706)至少一个空间索引，该空间索引覆盖包含在一个或多个集合中的数字图像的空间数据对象...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2016.04.06 EP 16164102.21.一种用于分析IHC组织样本(100)的图像分析方法，该方法包括：-为数字图像(106.1-106-4；106.5-106.7)的一个或多个集合(112；113)中的每一个在空间DBMS(316)的空间数据库(318)中存储(702)集合ID，每个数字图像集的数字图像描绘IHC组织样本的相同(102)或相邻层(102；110；108)；-为每个数字图像在空间数据库中存储(704)与集合ID相关联的多个空间数据对象，每个空间数据对象是点，线，多边形或其组合并表示组织样本的生物医学特征；-通过空间DBMS创建(706)至少一个空间索引，该空间索引覆盖包含在一个或多个集合中的数字图像的空间数据对象；-选择(708)一个或多个数字图像集中的一个；-通过空间DBMS对至少一个空间索引应用(710)空间数据库操作，以确定所选数字图像集的两个或更多个数字图像的空间数据对象的相对位置；-提供(712)所述相对位置作为输入，用于确定由两个或更多个数字图像的空间数据对象表示的组织样本的生物医学特征的距离和/或相对位置。2.根据权利要求1所述的图像分析方法，其中每个空间数据对象作为数据记录存储在空间数据库的表的相应行中。3.根据前述权利要求中任一项所述的图像分析方法，其中所述空间索引选自包括以下各项的组：-R树索引；-R+树索引；-R*树索引；-希尔伯特R树索引；-四叉树索引；-网格空间索引；-Z阶指数；-UB树索引；-X树索引；-Kd树索引；-m树索引；-二进制空间分区(BSP树)索引。4.根据前述权利要求中任一项所述的图像分析方法，其中由所分析的两个或更多个数据对象表示的组织样本的生物医学特征属于至少两种不同类型的生物医学特征。5.根据权利要求4所述的图像分析方法，其中所述至少两种类型选自包括特定细胞类型，特定细胞器类型，特定簇类型的细胞簇，跨越多个细胞的特定解剖结构，特定组织类型，肿瘤组织的组。6.根据前述权利要求中任一项所述的图像分析方法，还包括：-自动识别一个或多个集合的一些或所有数字图像中的一个或多个生物特征，该识别包括自动执行斑点提取和斑点分类操作，用于自动分类表示特定类型生物特征的数字图像的像素区域；和/或-由空间DBMS(316)接收一个或多个集合的一些或所有数字图像中的一个或多个其他生物特征，所接收的其他生物特征为手动分类的代表特定类型生物特征的数字图像的像素区域；-从自动识别和/或手动分类的生物医学特征中自动提取空间数据对象，并在提取的空间数据对象上执行空间数据对象的存储。7.根据前述权利要求中任一项所述的图像分析方法，还包括：-对于一个或多个数字图像集中每一个的每个数字图像，创建相应的空间索引或创建至少一个空间索引的分区。8.根据权利要求4-7中任一项所述的图像分析方法，还包括：-对于一个或多个数字图像集中每一个的至少两种不同类型生物医学特征中的每一种，创建相应的空间索引或至少一个空间索引的分区。9.根据前述权利要求中任一项所述的图像分析方法，所述方法还包括在执行所述空间数据对象的相对位置的分析之前执行预处理操作，所述预处理包括：-通过空间DBMS自动预先计算数字图像的空间数据对象的区域大小，几何中心和/或最小边界矩形；和-使用预先计算的区域大小，几何中心和/或最小边界矩形来确定生物医学特征的距离和/或相对位置。10.根据前述权利要求中任一项所述的图像分析方法，所述方法还包括：-通过图像分析应用程序生成每个数字图像集，该生成包括执行图像配准操作，用于将描绘IHC组织样本的相同或相邻层的多个数字图像配准到公共坐标系中。11.根据权利要求10所述的图像分析方法，其中至少一个数字图像集的生成包括：-执行光谱分离操作以产生描绘IHC组织样本的相同层的多个数字图像，所述至少一个集合的每个数字图像对应于不同的颜色。12.根据前述权利要求中任一项所述的图像分析方法，其中多个数字图像集的集合ID和从所述多个数字图像集导出的空间数据对象存储在空间数据库中，-其中一个或多个第一个数字图像集分别包括治疗前肿瘤活组织检查样本...

【专利技术属性】
技术研发人员：F·梅奇，A·富赫斯，J·金策尔，O·胡贝尔，A·科恩，E·古特赫莱恩，
申请(专利权)人：豪夫迈·罗氏有限公司，
类型：发明
国别省市：瑞士,CH