用于四种常用品系大鼠鉴定的SNP标记及其应用制造技术

技术编号:19832907 阅读:32 留言:0更新日期:2018-12-19 18:03
本发明专利技术公开一种用于四种常用品系大鼠鉴定的SNP标记及其应用。该SNP标记包括13个SNP位点,为SNP1~SNP13,并分别表示其位于SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:13所示的核苷酸序列的第201位。本发明专利技术采用高通量测序及生物信息分析等技术的优势开发出能用于快速鉴定四种常用品系(Wistar、GK、BN、SD)大鼠的SNP标记,SNP标记的应用可大大降低大鼠遗传检测成本并简化操作。

【技术实现步骤摘要】
用于四种常用品系大鼠鉴定的SNP标记及其应用
本专利技术涉及利用高通量测序技术、生物信息学分析技术、一代测序技术及DNA混合池法筛选并验证了大鼠的13个SNP标记,用以快速鉴定四种常用品系(Wistar、GK、BN、SD)大鼠。
技术介绍
在生物医学研究中,实验动物的遗传质量是衡量其品质好坏的重要因素,利用遗传特性稳定的实验动物才能保证实验结果更加具有参考价值与可比性。因此在实验动物的饲养过程中,对其进行定期的遗传检测是必不可少的环节。生化标记基因检测、免疫标记基因检测以及毛色基因检测等传统的遗传质量检测方法存在着精确度不高以及检测位点少等局限性,这些检测方法已不再满足科学发展的需要。随着基因组学研究的不断进步,SNP标记开始逐渐被应用于各种实验动物的鉴定及遗传检测中,相比于传统的遗传质量检测方法,利用SNP标记具有操作简单快速、能鉴别出同源品系以及能进行大规模高通量检测等显著优点。大鼠具有体型较大易于研究以及在某些生理特性方面更接近人类等优点,是多种生物医学实验的首选动物模型。然而,在国内外的研究中,应用于大鼠遗传检测的SNP标记的研究却并不多。目前筛查到国内外广泛认可的有效遗传标本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种用于四种常用品系大鼠鉴定的SNP标记,其特征在于:所述的SNP标记包括13个SNP位点,为SNP1、SNP2、SNP3、SNP4、SNP5、SNP6、SNP7、SNP8、SNP9、SNP10、SNP11、SNP12、SNP13;所述的SNP1表示该SNP位点位于SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列的第201位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基D;所述的SNP2表示该SNP位点位于SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列的第201位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基V;所述的SNP3表示该SNP位点位于SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列的第201位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基V...

【技术特征摘要】
1.一种用于四种常用品系大鼠鉴定的SNP标记,其特征在于:所述的SNP标记包括13个SNP位点,为SNP1、SNP2、SNP3、SNP4、SNP5、SNP6、SNP7、SNP8、SNP9、SNP10、SNP11、SNP12、SNP13;所述的SNP1表示该SNP位点位于SEQIDNO:1所示的核苷酸序列的第201位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基D;所述的SNP2表示该SNP位点位于SEQIDNO:2所示的核苷酸序列的第201位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基V;所述的SNP3表示该SNP位点位于SEQIDNO:3所示的核苷酸序列的第201位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基V;所述的SNP4表示该SNP位点位于SEQIDNO:4所示的核苷酸序列的第201位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基B;所述的SNP5表示该SNP位点位于SEQIDNO:5所示的核苷酸序列的第201位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基H;所述的SNP6表示该SNP位点位于SEQIDNO:6所示的核苷酸序列的第201位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基H;所述的SNP7表示该SNP位点位于SEQIDNO:7所示的核苷酸序列的第201位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基B;所述的SNP8表示该SNP位点位于SEQIDNO:8所示的核苷酸序列的第201位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R;所述的SNP9表示该SNP位点位于SEQIDNO:9所示的核苷酸序列的第201位,并且该位置处核苷酸序列为—/G;所述的SNP10表示该SNP位点位于SEQIDNO:10所示的核苷酸序列的第201位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R;所述的SNP11表示该SNP位点位于SEQIDNO:11所示的核苷酸序列的第201位,并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R;所述的SNP12表示该SNP位点位于SEQIDNO:12所示的核苷酸序列的第201位,并且该...

【专利技术属性】
技术研发人员:杜红丽曾玉琳蒙裕欢
申请(专利权)人:华南理工大学
类型:发明
国别省市:广东,44

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