用于检测与皮肤衰老相关易感基因SNP的成套引物及其应用制造技术

本发明专利技术涉及用于检测与皮肤衰老相关易感基因SNP的成套引物及其应用，所述的成套引物包括人基因组DNA的22个皮肤衰老相关易感基因的29个SNP位点的扩增引物对和延伸引物。每个位点分别设计一对多重PCR扩增引物，和一条单碱基延伸引物，并采用MALDI‑TOF MS（基质辅助激光解析电离飞行时间质谱）法检测待测样本SNP位点分型。本发明专利技术建立一种基于基因分子分型的皮肤衰老相关易感基因的检测方法，可以在同一个反应内同一时间完成多个SNP分型，准确高效且成本低。本发明专利技术的基因检测用以预测皮肤先天的抗衰老能力，从而为外部护肤方案提供科学依据。

Complete set of primers for detecting susceptibility genes SNP related to skin aging and their applications

The present invention relates to a set of primers for detecting the susceptibility gene SNP associated with skin senescence and its application. The set of primers includes amplification primers and extended primers for 29 SNP loci of 22 skin senescence related susceptibility genes of human genome DNA. A pair of multiple PCR primers, one single base extension primer, and MALDI TOF MS (matrix assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry) were designed for each loci, and the SNP loci of the samples were detected. The invention establishes a detection method for skin senescence related susceptible genes based on gene molecular typing, and can complete multiple SNP typing at the same time in the same reaction, which is accurate, efficient and low cost. The gene detection of the invention is used to predict the innate anti-aging ability of the skin, so as to provide scientific basis for the external skin care plan.

【技术实现步骤摘要】
用于检测与皮肤衰老相关易感基因SNP的成套引物及其应用
本专利技术涉及基因检测
，具体来说，涉及用于检测与皮肤衰老相关易感基因SNP的成套引物及其应用。
技术介绍
中国医师协会皮肤科医师分会开展了“国人皮肤状况大型网络调查”，近4万名网名在参与调查，其中45.45％为男性，54.55％为女性。29～39岁年龄段人数最多，占39.45％，结果表明约70％的人存在皮肤亚健康，仅有14％的人皮肤状况良好。25岁以上人体皮肤开始走入自然衰老的进程，皮肤的老化主要集中在三个方面：质地、色泽、细腻程度，具体在面部，皮肤老化可表现为皮肤松弛、缺乏弹性、皱纹、色泽暗淡、毛孔粗大、毛细血管孔张、各种色素斑点等。皮肤老化可有多种复杂的原因造成，大体概括为两大类就是内因和外因。外原性因素所造成的皮肤生理和功能性的改变如：长期紫外线辐射、恶劣的气候和环境、不良生活习惯和过度工作压力等。内部因素就是遗传因素。通过基因检测能够了解个体对各种皮肤问题的先天易感性，从而为有针对性的预防和护肤品或护肤方案的选择提供科学的参考依据。导致皮肤衰老的几个重要的问题与遗传基因有密不可分的关系，如：光老化是皮肤外在老化的最主要形式，紫外线辐射则是导致皮肤光老化的主要原因，黑色素的形成与酪氨酸酶的活性有关；水合作用决定了人类皮肤分子能否吸水保湿，存在基因缺陷的个体，控制水合作用的基因活性降低，皮肤保湿功能开始下降，储水能力逐渐变差，导致皱纹和衰老的出现；丝状的胶原蛋白纤维能使皮肤保持结实而有弹性的状态，当肌肤开始衰老时，负责降解胶原蛋白的基因过度活跃，过度降解胶原蛋白，导致支撑皮肤的胶原网状结构被打破，出现松弛和皱纹；人类的衰老和疾病都与自由基的形成有关，人体本身存在抗氧化机制对抗自由基，抗氧化主要由一些酶来进行，当这些酶的功能发生变异时，氧化-抗氧化平衡被打破，人体倾向更容易衰老；糖基化作用于胶原蛋白和弹性蛋白，导致皮肤出现皱纹，弹性下降，缺水，糖基化产物AGE的堆积导致皮肤出现色斑，所以个体对抗糖化的能力是延缓衰老的关键，且糖基化作用不仅与皮肤衰老有关系，他和很多疾病如糖尿病并发症、阿兹海默综合征都有密切关系。皮肤的衰老与特定人类基因的单核苷酸多态性有关，这一点已经得到确认。过去已经发展出多种检测基因多态性的方法，用来预测皮肤抵抗衰老的能力。其中比较全面的就是美白及老化基因芯片(201320009798.7)，涵盖了7个与美白相关的基因单核苷酸多态性位点，7个与皮肤氧化作用相关的基因单核苷酸多态性位点，将14个位点集成在一张芯片上进行检测。该专利采用的基因芯片法比较繁琐，只试用在研发阶段，无法实现大规模的商业转化。英国专利(GB20110021917)检测了与美容产品成分生物学途径相关的靶基因SNP位点，进而判断该产品是否适用于使用者，该专利设计的SNP位点有4个，主要与胶原蛋白降解，抗氧化作用相关的基因。专利技术专利(201610367682.9)公开了一种检测皮肤锁水情况的引物和探针，使用的方法的是荧光定量PCR的方法，检测的基因单核苷酸多态性位点是两个，检测基因不全面，且荧光定量PCR法适于检测5个左右的已知SNP位点，位点增加时，操作复杂，耗时长。
技术实现思路
针对相关技术中的上述技术问题，本专利技术提出用于检测与皮肤衰老相关易感基因SNP的成套引物及其应用，使用MALDI-TOFMS法，能够在同一个反应内同一时间完成29个SNP分型，提高检测效率并降低成本；利用生物技术中基因检测手段对皮肤光老化、抗氧化、锁水能力、糖基化作用、皱纹和胶原蛋白降解相关易感基因单核苷酸多态性位点进行检测，使用飞行时间质谱方法进行SNP分型，用以预测皮肤先天的抗衰老能力，从而为外部护肤方案提供科学依据。为实现上述技术目的，本专利技术的技术方案是这样实现的：用于检测与皮肤衰老相关易感基因SNP的成套引物包括人基因组DNA的22个皮肤衰老相关易感基因的29个SNP位点的PCR扩增引物对和单碱基延伸引物。进一步的，所述的人基因组DNA的22个皮肤衰老相关易感基因为BNC2、ASIP、STXBP5L、IFR4、MMP1、AGER、GLO1、SLC45A2、KITLG、TYR、DCT、MC1R、OCA2、SOD2、CAT、GPX1、NQO1、NFE2L2、GSTP1、AQP、HAS1、FLG。进一步的，所述的SNP位点为：rs10733310、rs62543565、rs1015362、rs4911414、rs322458、rs1540771、rs1799750、rs2070600、rs2071288、rs1130534、rs16891982、rs1834640、rs642742、rs1042602、rs2031526、rs885479、rs74653330、rs1800414、rs4880、rs1001179、rs1050450、rs1800566、rs35652124、rs1695、rs17553719、rs11084109、rs11084111、rs761789405、rs200519781。进一步的，所述的用于检测与皮肤衰老相关易感基因SNP的成套引物包括：rs10733310位点的PCR扩增引物序列SEQIDNO1和SEQIDNO2，单碱基延伸引物序列SEQIDNO59；rs62543565位点的PCR扩增引物序列SEQIDNO3和SEQIDNO4，单碱基延伸引物序列SEQIDNO60；rs1015362位点的PCR扩增引物序列SEQIDNO5和SEQIDNO6，单碱基延伸引物序列SEQIDNO61；rs4911414位点的PCR扩增引物序列SEQIDNO7和SEQIDNO8，单碱基延伸引物序列SEQIDNO62；rs322458位点的PCR扩增引物序列SEQIDNO9和SEQIDNO10，单碱基延伸引物序列SEQIDNO63；rs1540771位点的PCR扩增引物序列SEQIDNO11和SEQIDNO12，单碱基延伸引物序列SEQIDNO64；rs1799750位点的PCR扩增引物序列SEQIDNO13和SEQIDNO14，单碱基延伸引物序列SEQIDNO65；rs2070600位点的PCR扩增引物序列SEQIDNO15和SEQIDNO16，单碱基延伸引物序列SEQIDNO66；rs2071288位点的PCR扩增引物序列SEQIDNO17和SEQIDNO18，单碱基延伸引物序列SEQIDNO67；rs1130534位点的PCR扩增引物序列SEQIDNO19和SEQIDNO20，单碱基延伸引物序列SEQIDNO68；rs16891982位点的PCR扩增引物序列SEQIDNO21和SEQIDNO22，单碱基延伸引物序列SEQIDNO69；rs1834640位点的PCR扩增引物序列SEQIDNO23和SEQIDNO24，单碱基延伸引物序列SEQIDNO70；rs642742位点的PCR扩增引物序列SEQIDNO25和SEQIDNO26，单碱基延伸引物序列SEQIDNO71；rs1042602位点的PCR扩增引物序列SEQIDNO27和SEQIDNO28，单碱基延伸引物序列SEQIDNO72；rs2031526位点的PCR扩增引物序列SEQIDNO29和SEQI本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.用于检测与皮肤衰老相关易感基因SNP的成套引物，其特征在于：包括人基因组DNA的22个皮肤衰老相关易感基因的29个SNP位点的PCR扩增引物对和单碱基延伸引物。

【技术特征摘要】
1.用于检测与皮肤衰老相关易感基因SNP的成套引物，其特征在于：包括人基因组DNA的22个皮肤衰老相关易感基因的29个SNP位点的PCR扩增引物对和单碱基延伸引物。2.根据权利要求1所述的用于检测与皮肤衰老相关易感基因SNP的成套引物，其特征在于：所述的人基因组DNA的22个皮肤衰老相关易感基因为BNC2、ASIP、STXBP5L、IFR4、MMP1、AGER、GLO1、SLC45A2、KITLG、TYR、DCT、MC1R、OCA2、SOD2、CAT、GPX1、NQO1、NFE2L2、GSTP1、AQP、HAS1、FLG。3.根据权利要求2所述的所述的用于检测与皮肤衰老相关易感基因SNP的成套引物，其特征在于：所述的皮肤衰老相关易感基因的29个SNP位点为rs10733310、rs62543565、rs1015362、rs4911414、rs322458、rs1540771、rs1799750、rs2070600、rs2071288、rs1130534、rs16891982、rs1834640、rs642742、rs1042602、rs2031526、rs885479、rs74653330、rs1800414、rs4880、rs1001179、rs1050450、rs1800566、rs35652124、rs1695、rs17553719、rs11084109、rs11084111、rs761789405、rs200519781。4.根据权利要求3所述的用于检测与皮肤衰老相关易感基因SNP的成套引物，其特征在于：所述的rs10733310位点的PCR扩增引物序列为SEQIDNO1和SEQIDNO2所示的核苷酸序列，单碱基延伸引物序列为SEQIDNO59所示的核苷酸序列；所述的rs62543565位点的PCR扩增引物序列为SEQIDNO3和SEQIDNO4所示的核苷酸序列，单碱基延伸引物序列为SEQIDNO60所示的核苷酸序列；所述的rs1015362位点的PCR扩增引物序列为SEQIDNO5和SEQIDNO6所示的核苷酸序列，单碱基延伸引物序列为SEQIDNO61所示的核苷酸序列；所述的rs4911414位点的PCR扩增引物序列为SEQIDNO7和SEQIDNO8所示的核苷酸序列，单碱基延伸引物序列为SEQIDNO62所示的核苷酸序列；所述的rs322458位点的PCR扩增引物序列为SEQIDNO9和SEQIDNO10所示的核苷酸序列，单碱基延伸引物序列为SEQIDNO63所示的核苷酸序列；所述的rs1540771位点的PCR扩增引物序列为SEQIDNO11和SEQIDNO12所示的核苷酸序列，单碱基延伸引物序列为SEQIDNO64所示的核苷酸序列；所述的rs1799750位点的PCR扩增引物序列为SEQIDNO13和SEQIDNO14所示的核苷酸序列，单碱基延伸引物序列为SEQIDNO65所示的核苷酸序列；所述的rs2070600位点的PCR扩增引物序列为SEQIDNO15和SEQIDNO16所示的核苷酸序列，单碱基延伸引物序列为SEQIDNO66所示的核苷酸序列；所述的rs2071288位点的PCR扩增引物序列为SEQIDNO17和SEQIDNO18所示的核苷酸序列，单碱基延伸引物序列为SEQIDNO67所示的核苷酸序列；所述的rs1130534位点的PCR扩增引物序列为SEQIDNO19和SEQIDNO20所示的核苷酸序列，单碱基延伸引物序列为SEQIDNO68所示的核苷酸序列；所述的rs16891982位点的PCR扩增引物序列为SEQIDNO21和SEQIDNO22所示的核苷酸序列，单碱基延伸引物序列为SEQIDNO69所示的核苷酸序列；所述的rs1834640位点的PCR扩增引物序列为SEQIDNO23和SEQIDNO24所示的核苷酸序列，单碱基延伸引物序列为SEQIDNO70所示的核苷酸序列；所述的rs642742位点的PCR扩增引物序列为SEQIDNO25和SEQIDNO26所示的核苷酸序列，单碱基延伸引物序列为SEQIDNO71所示的核苷酸序列；所述的rs1042602位点的PCR扩增引物序列为SEQIDNO27和SEQIDNO28所示的核苷酸序列，单碱基延伸引物序列为SEQIDNO72所示的核苷酸序列；所述的rs2031526位点的PCR扩增引物序列为SEQIDNO29和SEQIDNO30所示的核苷酸序列，单碱基延伸引物序列为SEQIDNO73所示的核苷酸序列；所述的rs885479位点的PCR扩增引物序列为SEQIDNO31和SEQIDNO32所...

【专利技术属性】
技术研发人员：张影，
申请(专利权)人：北京天平永达科技发展有限公司，
类型：发明
国别省市：北京,11