SNP RS12603226作为NAFLD的预测性标记物制造技术

本发明专利技术涉及用于预测个体中疾病的危险因子、发生和发展的方法，包括检测在来自接受检查的个体的核酸样品中一种或多种多态性的等位基因状态。本发明专利技术涉及特别是与发展已知为NAFLD(非酒精性脂肪性肝病)的疾病或更简单地非酒精性脂肪性肝炎的风险相关联的单核苷酸基因多态性(SNP，单核苷酸多态性)。在这种特定的情况下，SNP，rs12603226，存在于ZNF624人类基因中，从未被描述与NAFLD相关联和用于预测所述疾病，使得可能在一般群体中或者在已经处于风险的类别(例如肥胖个体)中，鉴定具有发展NAFLD和与其相关疾病的更高倾向性的个体。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】SNPRS12603226作为NAFLD的预测性标记物
本专利技术涉及用于预测发展非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)和与其相关联疾病的风险的用途或SNP(单核苷酸多态性)。现有技术在过去被认为是良性病况，实际上NAFLD现在被认为是器官损伤的更大原因之一并且据估计在未来几年中，它将是肝脏移植的主要指标之一(Dutkowski,P.等人,Gastroenterology2015Feb；148(2):307-23.)。NAFLD实际上遵循进展通过炎性阶段的发展过程，被称为非酒精性脂肪性肝炎(NASH)至纤维化、肝硬化以及可能地肝癌(Brunt,Nat.Rev.Gastroenterol.Hepatol.2010；7:195)。NAFLD的特征在于肝脏中甘油三酯的过量积聚，是一种包含不同形式的肝脏损伤的多因子疾病，所述肝脏损伤如单纯的脂肪变性或脂肪性肝炎或NASH(非酒精性脂肪性肝炎)，与纤维化相关联(Brunt,Nat.Rev.Gastroenterol.Hepatol.2010；7:195)。对于NAFLD的组织学特征的详细描述见Brunt,2010(如上)。许多临床研究已经表明环境因子(例如，不适当的生活方式)和遗传因子都是NAFLD的最大风险因子(Anstee,Q.M.,Day,C.P.,Nat.Rev.Gastroenterol.Hepatol.2013Nov；10(11):645-55)。NAFLD是西方国家中慢性肝病的主要原因，并且预期将成为肝硬化的主要原因，使得需要在未来二十年中求助于肝脏移植。具有NAFLD的大多数患者还存在代谢风险因子，例如肥胖、2型糖尿病和血脂异常。内脏脂肪的累积，代谢综合症和胰岛素抗性的存在是发展NAFLD的其它主要风险因子(Masuoka,H.C.和Chalasani,No.Ann.No.Y.Acad.Sci.(2013)1281:106-12)。只有一定比例的患肝脂肪变性的患者(20％左右)随时间发展NASH。后者具有发展肝硬化和肝癌的高风险(Masuoka,H.C.等人,(2013)如上)。在几乎所有情况下，NAFLD是无症状的和无声的疾病。其事实上经常通过存在异常的肝生物化学测试(通常作为例行检查执行)来得到诊断。由于这些特性，NAFLD经常被忽略或低估，并且在肝脏已经受到损害并且经常在肝活检后NASH的组织学特征明显的时候，发生偶然的诊断(Brunt,2010,参见上文；Masuoka,H.C.等人，2013，参见上文)。只能通过对肝脏活检的组织学分析保证对NASH以及存在肝硬化和炎症的适当诊断。然而，由于它的高成本以及最重要的是由于其侵入性，而难以付诸于活检；除了这一点之外，操作者的技术和经验是对于正确进行活检、取样和最终诊断的重要可变性因子(Masuoka,H.C.等人,(2013),参见上文)，并且只有微小部分(大约1/50,000)的肝脏通过活检取样而进行取样，有助于该程序的极端临界值。因此，近年来的研究已经集中于鉴定用于对NAFLD的早期诊断和预后的生物标志物(Fitzpatrick,E.和Dhawan,A.(2014)WorldJ.Gastroenterol.20:10851-10863)。通过定义，如果标记物对鉴定患病患者是足够灵敏的，如果标记物是足够特异性的以足够的效率将患病患者与健康患者区分开，如果标记物的存在与疾病发展的概率高度相关，如果对标记物水平的分析不是极其昂贵或难以实施，并且总之如果这样分析是可重复的，则是标记物。找到能够提供关于NAFLD以及与该疾病相关联的组织学特征的信息的非侵入的、诊断性的和预后性的标记物具有重大的临床意义(Fitzpatrick,E.和Dhawan,A.(2014),参见上文)。近来，出现了对临床实践具有重大影响的两种类型的非侵入性标记物：第一种是与所述疾病的发病机理严格相关的系统标记物(例如：透明质酸和细胞角蛋白18)(Fitzpatrick,E.和Dhawan,A.(2014),参见上文)；第二种是遗传标记物。实际上，一种用于评估个体中NAFLD的发生和发展的风险的方法包括检测核酸样品中的一个或多个多态性的等位基因状态(Nobili,V,等人；J.Pediatr.Gastroenterol.Nutr.；2014May；58(5):632-6)。多态性是以大于1％的频率存在于群体中的DNA序列中的变化；特别地单核苷酸多态性或SNP定义为在群体中存在的单一DNA碱基的“变体”(Gusella,J.F.；AnnualReviewofBiochemistry；July1986；Vol55:831-854)。这些可以在基因组中的任何点找到，在编码和非编码部分都可以，但仍然具有保护和调节的作用。这些变体涉及疾病的发展、对药物的应答、对感染的应答、暴露于化学试剂等。当被单独考虑时，SNP通常具有与其与疾病的统计相关性相关联的可变预测性“权重”，但是通过分析一个个体的基因组中的几个SNP，它们可以提供更大的预测价值，其特征在于更高的特异性和灵敏度，尤其在复杂疾病如NAFLD和心血管疾病中(Vasan,R.S.,Circulation2006May16；113(19):2335-62)。流行病学、家族和双胞胎研究已经证明一些SNP(遗传变体)在疾病的严重程度和从NAFLD到NASH的进展中都起到一定的作用(Dongiovanni,P等人GeneticPredispositioninNAFLDandNASH:ImpactofSeverityofLiverDiseaseandResponsetoTreatment；Curr.Pharm.Des.2013Sept.；19(29):521495238)。目前用于预测NAFLD的SNP，KLF-6rs3750861、PNPLA-3rs738409、LIPIN-1rsl3412852、SOD-2rs4880(Nobili.V.等人J.Pediatr.Gastroenterol.Nutr.2014May；58(5):632-6)和TM6SF2rs58542926(Sookoian,S.等人,Hepatology,2015Feb；61(2):515-25)与所述疾病具有可变的相关性，相关性仍然不足够严格，还需要找到以与所述疾病具有更强相关性而对NAFLD具有预测性的其他SNP，从而改善现有的预测工具。迄今为止，对用于倾向于NAFLD的相关SNP的搜索已经针对在功能上涉及所述疾病的分子发病机理的基因。但是，如从其它疾病中已知的那样，在外显子或内显子区域中可能存在变体等位基因，其仍未知的，但能够促进NAFLD表型的发生。最近，已经证明了一种被称为ZNF267的属于“Kruppel样锌指”蛋白的蛋白质的功能(Schnabl,B.等人Int.J.Clin.Exp.Pathol.2011；4(7):661-6)。该研究报道了与具有健康肝脏的患者相比，在患NAFLD的患者肝脏中蛋白质ZNF267的表达增加。至今还很少地描述ZNF蛋白质在NAFLD中的作用，这部分地是因为其一般功能也是知之甚少。当对报道在遭受NAFLD的肥胖患者中的基因表达谱的数据库进行搜索时(Www.ncbi.nlm本文档来自技高网...

【技术保护点】
包含SNP rs12603226的核苷酸片段，用于确定非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)，其中患NAFLD的个体中的T碱基具有比健康患者更高的频率，并且A碱基具有比健康患者更低的频率。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2015.08.05 IT 1020150000423621.包含SNPrs12603226的核苷酸片段，用于确定非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)，其中患NAFLD的个体中的T碱基具有比健康患者更高的频率，并且A碱基具有比健康患者更低的频率。2.用于预测在个体中非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)的风险增加的方法，其包括在从来自个体的生物样品中获得的核酸上对SNPrs12603226进行基因分型的阶段，并且其中存在等位基因纯合性TT表明发展NAFLD的风险增加。3.根据权利要求2所述的方法，其进一步包括对与NAFLD相关联的...

【专利技术属性】
技术研发人员：P·罗萨蒂，D·罗萨蒂，R·玛里尼，
申请(专利权)人：奥尔加生物人类有限责任公司，
类型：发明
国别省市：意大利,IT