THSD7A基因序列及表达改变检测及其在冠心病预测中的应用制造技术

本发明专利技术涉及生物技术领域，一方面涉及冠心病易感基因THSD7A的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，SNP)位点，以及用于检测所述SNP位点的相应的组合物及试剂盒，尤其涉及所述SNP位点的核酸亲和配体在制备用于检测、筛查或预测汉族人群冠心病易感性的组合物中的应用。另一方面涉及检测THSD7A基因的相应组合物及试剂盒，还涉及该THSD7A基因的核酸亲和配体在制备用于检测、筛查或预测汉族人群冠心病易感性的组合物中的应用。本发明专利技术为研发针对性的冠心病基因治疗提供了新的进一步的科学依据，为发现新的冠心病分子机制、发展新的药物靶点以及冠心病的个性化治疗提供了新线索。

【技术实现步骤摘要】
THSD7A基因序列及表达改变检测及其在冠心病预测中的应用本申请是申请日为2015年1月21日、申请号为201510029413.7、专利技术名称为“THSD7A基因序列及表达改变检测及其在冠心病预测中的应用”的专利申请的分案申请。
本专利技术涉及生物
，特别涉及与冠心病易感性相关的THSD7A基因上的单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism，SNP)位点，以及用于检测所述SNP位点的相应的组合物及试剂盒，尤其涉及所述SNP位点的核酸亲和配体在制备用于检测、筛查或预测汉族人群冠心病易感性的组合物中的应用。
技术介绍
冠心病，又称冠状动脉性心脏病，是由冠状动脉血管壁粥样硬化引起的以冠状动脉狭窄甚至闭塞为形态学改变的缺血性心脏病。冠心病危害极大，根据世界卫生组织的数据，在世界范围内，以冠心病为主的缺血性心脏病是威胁人类健康的头号杀手。数据显示：在2008年，全球大约有多于730万人死于冠心病(WHO，2011)。虽然从死亡率上看中国目前并不是冠心病的重灾区，但是，由于人口基础大，我国的冠心病受累人数是十分惊人的。估计中国每年超过100万人死于冠心病。另外，随着我国经济水平的发展和人民生活水平的提高，专利技术人国家的冠心病发病率还在逐年升高。临床和流行病学研究证明，冠心病是常见的复杂多基因疾病，引起疾病的原因包括遗传因素、环境因素以及两者的交互作用。冠心病有家族聚集性，研究表明，冠心病的遗传度约为40％到60％。因此，冠心病易感基因和易感位点的鉴定将为发现新的冠心病分子机制、发展新的药物靶点以及冠心病的早期基因诊断和个性化治疗提供新线索。遗传学上，寻找多基因疾病的易感基因多利用关联分析。遗传关联分析分为两个策略：候选基因关联分析和全基因组关联分析(genomewideassociationstudy，GWAS)。得益于人类基因组计划和HapMap计划对人类遗传图谱的揭示，从全基因组水平寻找与疾病相关的变异成为可能。在过去的六年里，全基因组关联分析发展成为研究复杂多基因疾病遗传基础的重要方法之一，已有超过50个冠心病相关位点通过该方法被发现，其中绝大部分位点是在白种人的研究中发现。然而，由于遗传的异质性，这些结果并不能为黄种人，尤其是专利技术人中国汉族人群所用。另一方面，已发现的位点中仅有6个是基于中国汉族人群的研究所发现，这远不足以解释中国汉族人群的冠心病遗传基础。此外，已有的研究多仅关注了相关位点，而对于鉴定相关位点所指代的易感基因缺乏有效的方法。鉴于已知用来解释中国汉族人群的冠心病遗传基础的基因及位点的数量较少，为了提高汉族人群冠心病易感性检测、筛查或预测的准确度，从而更容易、更直接、更灵敏且更特异性地检测、筛查或预测汉族人群冠心病易感性，有必要寻找新的与冠心病易感性相关的易感基因和SNP位点。
技术实现思路
本专利技术发现了一种新的能够解释中国汉族人群的冠心病遗传基础的与冠心病易感性相关的THSD7A基因，同时确证了THSD7A基因上与冠心病易感性密切相关的SNP位点rs17165136以及与17165136连锁的SNP位点。本专利技术具体技术方案如下：第一方面，本专利技术提供了分离的核酸分子，其代表THSD7A基因上的单核苷酸多态性(SNP)位点rs17165136，DNA序列如SEQIDNO:1所示，其中单核苷酸n为A的携带者患冠心病的风险高于等位基因G。第二方面，本专利技术提供了分离的核酸分子，其代表THSD7A基因上与SNP位点rs17165136连锁的SNP位点，所述连锁的SNP位点选自以下任一项：(1)rs6957230，其DNA序列如SEQIDNO:2所示，其中单核苷酸n为C的携带者患冠心病的风险高于等位基因T；(2)rs17165141，其DNA序列如SEQIDNO:3所示，其中单核苷酸n为T的携带者患冠心病的风险高于等位基因C；(3)rs17165148，其DNA序列如SEQIDNO:4所示，其中单核苷酸n为T的携带者患冠心病的风险高于等位基因C；(4)rs16877182，其DNA序列如SEQIDNO:5所示，单核苷酸n为C的携带者患冠心病的风险高于等位基因T；(5)rs10499406，其DNA序列如SEQIDNO:6所示，其中单核苷酸n为T的携带者患冠心病的风险高于等位基因C；(6)rs16877184，其DNA序列如SEQIDNO:7所示，其中单核苷酸n为A的携带者患冠心病的风险高于等位基因G；(7)rs7341453，其DNA序列如SEQIDNO:8所示，其中单核苷酸n为G的携带者患冠心病的风险高于等位基因A；(8)rs10499401，其DNA序列如SEQIDNO:9所示，其中单核苷酸n为T的携带者患冠心病的风险高于等位基因C。序列SEQIDNO:1-9构成新的与冠心病易感性相关的单核苷酸多态性(SNP)。它们允许灵敏、特异性、有效和简单的对冠心病易感性的检测、筛查或预测方法，例如通过采用广为流传且易于使用的技术如PCR或核酸杂交，其具有高适用性和利用率，特别是在世界的欠发达地区。由于上述SNP是在中国汉族人群中鉴定的，因此认为新的SNP可特别适用于中国汉族人群冠心病易感性检测、筛查或预测。第三方面，本专利技术提供了上述分离的核酸分子的任意组合。在本专利技术的优选实施方案中，所述组合至少包含SEQIDNO:1，以及任选的SEQIDNO:2-9的一或多个序列。在本专利技术的另一优选的实施方案中，任何上文提到的分离的核酸分子的组合还可以与额外的SNP组合，优选冠心病易感性的其他合适的SNP组合。在本专利技术的实施方案中，任意单一SNP可以用作冠心病易感性的生物标志物，优选任何可能的两个或更多个本专利技术的SNP的组合，尤其优选rs17165136和其他一或多个SNP的组合。第四方面，本专利技术提供了用于检测、筛查或预测汉族人群冠心病易感性的组合物，所述组合物包含如上文定义的一个或多个SNP位点的核酸亲和配体。在本专利技术的优选实施方案中，上文提到的核酸亲和配体可以是特异于上文定义的一个或多个SNP位点的寡核苷酸，或者是特异于上文定义的一个或多个SNP位点的探针。在本专利技术的另一优选的实施方案中，上文提到的亲和配体可以是具有与如上文定义的SNP位点的核苷酸互补的序列的寡核苷酸。第五方面，本专利技术提供了用于检测、筛查或预测汉族人群冠心病易感性的试剂盒，其包含特异于上文定义的一个或多个SNP位点的寡核苷酸，或者特异于上文定义的一个或多个SNP位点的探针。在本专利技术的另一优选的实施方案中，所述寡核苷酸具有与如上文定义的SNP位点的核苷酸互补的序列。第六方面，本专利技术提供了包含如上文定义的一个或多个SNP位点的核酸亲和配体在制备用于检测、筛查或预测汉族人群冠心病易感性的组合物中的应用。第七方面，本专利技术提供了一种检测、筛查或预测对象的冠心病易感性的方法，包括以下步骤：(1)从对象样品分离核酸；(2)确定在如上文定义的一个或多个SNP位点处存在的核苷酸序列，其中如上文定义的危险等位基因的存在指示有更大的可能性患冠心病。第八方面，本专利技术提供了用于检测、筛查或预测汉族人群冠心病易感性的组合物，所述组合物包含特异于THSD7A基因的核酸亲和配体。第九方面，本专利技术提供了用于检测、筛查或预测汉族人群冠心病易感性的试剂盒本文档来自技高网...

【技术保护点】
分离的核酸分子，其代表THSD7A基因上与单核苷酸多态性(SNP)位点rs17165136连锁的SNP位点，具有所述SNP位点rs17165136的DNA序列如SEQ ID NO:1所示，其中单核苷酸n为A的携带者患冠心病的风险高于等位基因G；所述连锁的SNP位点选自以下任一项：(1)rs6957230，具有所述rs6957230的DNA序列如SEQ ID NO:2所示，其中单核苷酸n为C的携带者患冠心病的风险高于等位基因T；(2)rs17165141，具有所述rs17165141的DNA序列如SEQ ID NO:3所示，其中单核苷酸n为T的携带者患冠心病的风险高于等位基因C；(3)rs17165148，具有所述rs17165148的DNA序列如SEQ ID NO:4所示，其中单核苷酸n为T的携带者患冠心病的风险高于等位基因C；(4)rs16877182，具有所述rs16877182的DNA序列如SEQ ID NO:5所示，单核苷酸n为C的携带者患冠心病的风险高于等位基因T；(5)rs10499406，具有所述rs10499406的DNA序列如SEQ ID NO:6所示，其中单核苷酸n为T的携带者患冠心病的风险高于等位基因C；(6)rs16877184，具有所述rs16877184的DNA序列如SEQ ID NO:7所示，其中单核苷酸n为A的携带者患冠心病的风险高于等位基因G；(7)rs7341453，具有所述rs7341453的DNA序列如SEQ ID NO:8所示，其中单核苷酸n为G的携带者患冠心病的风险高于等位基因A；(8)rs10499401，具有所述rs10499401的DNA序列如SEQ ID NO:9所示，其中单核苷酸n为T的携带者患冠心病的风险高于等位基因C。...

【技术特征摘要】
1.分离的核酸分子，其代表THSD7A基因上与单核苷酸多态性(SNP)位点rs17165136连锁的SNP位点，具有所述SNP位点rs17165136的DNA序列如SEQIDNO:1所示，其中单核苷酸n为A的携带者患冠心病的风险高于等位基因G；所述连锁的SNP位点选自以下任一项：(1)rs6957230，具有所述rs6957230的DNA序列如SEQIDNO:2所示，其中单核苷酸n为C的携带者患冠心病的风险高于等位基因T；(2)rs17165141，具有所述rs17165141的DNA序列如SEQIDNO:3所示，其中单核苷酸n为T的携带者患冠心病的风险高于等位基因C；(3)rs17165148，具有所述rs17165148的DNA序列如SEQIDNO:4所示，其中单核苷酸n为T的携带者患冠心病的风险高于等位基因C；(4)rs16877182，具有所述rs16877182的DNA序列如SEQIDNO:5所示，单核苷酸n为C的携带者患冠心病的风险高于等位基因T；(5)rs10499406，具有所述rs10499406的DNA序列如SEQIDNO:6所示，其中单核苷酸n为T的携带者患冠心病的风险高于等位基因C；(6)rs16877184，具有所述rs16877184的DNA序列如SEQIDNO:7所示，其中单核苷酸n为A的携带者患冠心病的风险高于等位基因G；(...

【专利技术属性】
技术研发人员：田小利，李扬，
申请(专利权)人：田小利，李扬，
类型：发明
国别省市：北京,11