用于检测人Pegivirus 2 (HPgV‑2)的组合物和方法技术

本文提供用于检测人Pegivirus 2 (HPgV‑2)的组合物、方法和试剂盒。在某些实施方案中，本文提供HPgV‑2特异性核酸探针和引物以及用于检测HPgV‑2核酸的方法。在其他实施方案中，本文提供HPgV‑2免疫原性组合物、治疗具有免疫原性HPgV‑2肽的个体的方法以及检测样品中HPgV‑2个体抗体的方法。

For the detection of Pegivirus 2 (HPgV 2) compositions and methods

This paper provides for the detection of human Pegivirus 2 (HPgV 2) compositions, methods and kits. In some embodiments, the HPgV 2 specific nucleic acid probes and primers for detection of HPgV and 2 nucleic acid method. In other embodiments, this method HPgV immunogenic HPgV 2 immunogenic compositions and methods of treating an individual 2 peptide and detection of HPgV in the sample of 2 individuals antibody.

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于检测人Pegivirus2(HPgV-2)的组合物和方法本申请要求享有于2014年6月27日提交的美国临时申请系列号62/018,282和于2015年1月26日提交的美国临时申请系列号62/107,782的权益，所述申请均以其整体通过引用并入本文。本专利技术得到美国政府拨款号R01-HL105704的支持由NationalInstitutesofHealth资助完成。政府在本专利技术中具有某些权利。专利
本文提供用于检测人Pegivirus2(HPgV-2)的组合物、方法和试剂盒。在某些实施方案中，本文提供HPgV-2特异性核酸探针和引物以及用于检测HPgV-2核酸的方法。在其他实施方案中，本文提供HPgV-2免疫原性组合物、用于治疗具有HPgV-2的免疫原性部分的个体的方法以及检测样品中HPgV-2特异性个体抗体的方法。背景在黄病毒科中，属于丙型肝炎病毒属的病毒已经被证明会引起肝炎（丙型肝炎病毒（HCV）和GB病毒（GBV-B））。新定义的属Pegivirus包含与丙型肝炎病毒在基因组组构中相似但在向性和相关致病性上不同的病毒(Stapleton等人,JGenVirol20本文档来自技高网...

【技术保护点】
检测个体中的人Pegivirus 2 (HPgV‑2)感染的方法，其包括：a）将来自疑似含有针对HPgV‑2的个体抗体的个体的样品与肽接触，其中所述肽特异性结合所述个体抗体以形成复合物；和b）检测所述复合物的存在，从而检测在所述个体中过去或目前的HPgV‑2感染的存在。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2014.06.27 US 62/018282;2015.01.26 US 62/1077821.检测个体中的人Pegivirus2(HPgV-2)感染的方法，其包括：a）将来自疑似含有针对HPgV-2的个体抗体的个体的样品与肽接触，其中所述肽特异性结合所述个体抗体以形成复合物；和b）检测所述复合物的存在，从而检测在所述个体中过去或目前的HPgV-2感染的存在。2.权利要求1的方法，其中所述肽与SEQIDNO:2-11、76-85或304-353中任一者的部分具有至少75%同一性，且其中所述部分长度为至少10个氨基酸。3.权利要求1的方法，其中所述肽是经标记的，且其中所述肽选自SEQIDNO:86-99和100-218。4.权利要求1的方法，其中所述肽包含选自以下的所述HPgV-2的至少一部分：S蛋白、E1蛋白、E2蛋白、X蛋白、NS2蛋白、NS3蛋白、NS4A蛋白、NS4B蛋白、NS5A蛋白和NS5B蛋白。5.权利要求1的方法，其中所述肽包含标记，且所述方法还包括使所述样品与包含结合所述标记的部分的固体支持物接触。6.权利要求5的方法，其还包括在这样的条件下温育所述样品，使得：i）所述肽特异性结合所述患者抗体以形成复合物，和ii）所述复合物经由所述标记结合至少一种所述部分而结合至所述固体支持物。7.权利要求6的方法，其还包括洗涤所述固体支持物。8.权利要求7的方法，其还包括向所述样品添加能够结合所述复合物中的所述患者抗体的经可检测标记的二级抗体。9.组合物，其包含基本纯化的重组肽，其中所述重组肽包含以下中的至少一种：a）第一氨基酸序列，其包含来自HPgV-2NS3蛋白的至少17个连续氨基酸；b）第二氨基酸序列，其包含来自HPgV-2NS5B蛋白的至少13个连续氨基酸；c）第三氨基酸序列，其包含来自HPgV-2NS2蛋白的至少11个连续氨基酸；d）第四氨基酸序列，其包含来自HPgV-2NS4B蛋白的至少8个连续氨基酸；e）第五氨基酸序列，其包含来自HPgV-2NS4a蛋白的至少5个连续氨基酸；f）第六氨基酸序列，其包含来自HPgV-2S蛋白的至少6个连续氨基酸；g）第七氨基酸序列，其包含来自HPgV-2E1蛋白的至少6个连续氨基酸；h）第八氨基酸序列，其包含来自HPgV-2X蛋白的至少8个连续氨基酸；i）第九氨基酸序列，其包含来自HPgV-2E2蛋白的至少8个连续氨基酸；j）第十氨基酸序列，其包含来自HPgV-2NS5A蛋白的至少8个连续氨基酸。10.组合物，其包含基本纯化的重组肽，其中所述重组肽包含与SEQIDNO:2-11、76-85或304-353中任一者的部分具有至少75%同一性的氨基酸序列，其中所述部分长度为至少10个氨基酸。11.权利要求10的组合物，其还包含磁珠。12.权利要求10的组合物，其中所述部分长度为至少15个氨基酸。13.组合物，其包含合成的核酸分子，其中所述合成的核酸分子包含在严格条件下与：i）SEQIDNO:299-303、或ii）人Pegivirus2(HPgV-2)的基因组序列的区域1、区域2、区域3或区域4或其互补序列杂交的长度为至少12个核苷酸的核苷酸序列，其中所述HPgV-2的基因组序列显示于SEQIDNO:1或75中，且其中区域1为SEQIDNO:1或75的核苷酸1-1401，区域2为SEQIDNO:1或75的核苷酸1431-4777，区域3为SEQIDNO:1或75的核苷酸4818-8134，且区域4为SEQIDNO:1或75的核苷酸8167-9778。14.权利要求13的组合物，其中所述合成的核酸分子：i）包含可检测标记；ii）包含至少一个经修饰的碱基；iii）包含DNA；和/或iv）与异源核酸序列连接。15.权利要求13的组合物，其中所述合成的核酸分子与选自以下的所述HPgV-2基因组的部分杂交：5'UTR、S基因、E1基因、E2基因、X基因和NS2基因。16.组合物，其包含合成的核酸分子，其中所述合成的核酸分子包含长度为至少12个核苷酸的核苷酸序列，其：i）在严格条件下不与SEQIDNO:1或75的选自1402-1430、4778-4817和8135-8166的三个区域杂交，且ii）在严格条件下不与以下杂交：a）人Pegivirus2(HPgV-2)的5'非翻译区（5'UTR）或其互补序列，其中所述5'UTR具有如SEQIDNO:1的核苷酸1-103、SEQIDNO:75的核苷酸1-110、SEQIDNO:299-301中的核苷酸1-327、SEQIDNO:302中的核苷酸12-327、或SEQIDNO:303中的核苷酸24-327中所示的核酸序列；b）第一核酸序列或其互补序列，其中所述第一核酸序列编码具有SEQIDNO:2、76、304、314、324、334或344中所示的氨基酸序列的HPgV-2S蛋白；c）第二核酸序列或其互补序列，其中所述第二核酸序列编码具有SEQIDNO:3、77、305、315、325、335或345中所示的氨基酸序列的HPgV-2E1蛋白；d）第三核酸序列或其互补序列，其中所述第三核酸序列编码具有SEQIDNO:4、78、306、316、326、336或346中所示的氨基酸序列的HPgV-2E2蛋白；e）第四核酸序列或其互补序列，其中所述第四核酸序列编码具有SEQIDNO:5、79、307、317、327、337或347中所示的氨基酸序列的HPgV-2X蛋白；f）第五核酸序列或其互补序列，其中所述第五核酸序列编码具有SEQIDNO:6、80、308、318、328、338或348中所示的氨基酸序列的H...

【专利技术属性】
技术研发人员：M弗兰克尔，K富尔伯格，C秋，D李，M伯格，G道森，K科勒，K程，J哈克特，
申请(专利权)人：雅培制药有限公司，加州大学评议会，
类型：发明
国别省市：美国,US