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基于合成生物学样本实体库的信息处理系统及方法技术方案

技术编号:15939722 阅读:84 留言:0更新日期:2017-08-04 22:10
本发明专利技术公开了一种基于合成生物学样本实体库的信息处理系统,所述合成生物学样本实体库用于存储至少一个样本对象;所述系统包括服务器和客户端,所述服务器包括精准存储单元;所述精准存储单元,用于模拟所述合成生物学样本实体库,生成三维形式的虚拟样本库;所述客户端,用于响应用户查询目标样本的请求,定位并显示所述目标样本在所述虚拟样本库中的空间位置,所述目标样本为所述合成生物学样本实体库中存储的一个样本对象。能够便于查找合成生物学样本实体库中的样本对象。

Information processing system and method based on synthetic biological sample entity library

The invention discloses an information processing system of synthetic biology sample entity library based on the synthetic biology sample entity library for storing at least one sample object; the system comprises a server and client, the server includes a precision storage unit; the precision storage unit is used to simulate the synthetic biology sample entity library virtual sample generation library of three-dimensional form; the client, in response to a user query target sample request, positioning and display of the target sample in the sample database in the virtual space position, the target sample is a sample of the objects stored in the library of synthetic biology sample entity. It is easy to find sample objects in the physical library of synthetic biological samples.

【技术实现步骤摘要】
基于合成生物学样本实体库的信息处理系统及方法
本专利技术涉及生物
,尤其涉及一种基于合成生物学样本实体库的信息处理系统及方法。
技术介绍
合成生物学是基于生物学工程化的思想,通过对生命体的设计、改造和重建的方法,以实现特定功能的目的的一门交叉学科。工程领域的元器件、装置和系统,即对应于合成生物学上的元件(Part)、模块(Module)、生命系统(System),合成生物学上各种元器件用于发挥其功能的细胞载体即为底盘(Chassis)。随着合成生物学的深入研究和广泛应用,针对各种元件、模块和底盘的需求日益增加。长久以来,生命科学领域各种各样的种源库或样本库提供了数以万计的生物资源,如菌种库、藻种库、细胞库和医学样本库等等。但由于其中很多属于非模式生物,遗传背景不清晰并缺乏有效的遗传操作手段,或者培养技术难度及成本高,因此,难以加以工程化地改造和利用。每种生命所携带的独特的遗传信息蕴含巨大的利用价值和潜力,如果以合成生物学的思想对其解耦,抽提出其中各种元件模块,并在新的可控的底盘背景下实现其功能的研究验证,则可以更好地利用这些遗传资源,同时来自于各种生命系统的经过解耦抽提的遗传资源则汇集构成完全不同于其起始来源的可被工程化利用的元件模块库。例如,国际遗传工程机器大赛(TheInternationalGeneticallyEngineeredMachineCompetition,简称iGEM)是学生组队参与的合成生物学比赛,该比赛通过收集参赛项目的结果形成标准生物元件注册库(RegistryofStandaryBiologicalParts)。该元件注册库由于主要通过收集学生们短时间内自由探索的多样的参赛项目形成,导致该元件注册库内容重复规模虚大,同时又内容繁杂,因此,对该元件注册库中存储的元件、模块等进行查询时,不利于查找到对应的元件。
技术实现思路
有鉴于此,本专利技术的主要目的在于提供一种基于合成生物学样本实体库的信息处理系统及方法,能够便于查找合成生物学样本实体库中的样本对象。本专利技术提供了一种基于合成生物学样本实体库的信息处理系统,所述合成生物学样本实体库用于存储至少一个样本对象;所述系统包括服务器和客户端,所述服务器包括精准存储单元;所述精准存储单元,用于模拟所述合成生物学样本实体库,生成三维形式的虚拟样本库;所述客户端,用于响应用户查询目标样本的请求,定位并显示所述目标样本在所述虚拟样本库中的空间位置,所述目标样本为所述合成生物学样本实体库中存储的一个样本对象。可选的,所述精准存储单元,还用于对所述合成生物学样本实体库中的存储设备按照分层进行唯一编号,并建立每一分层编号与对应分层存放的样本对象之间的关联关系;则,所述客户端,还用于根据所述关联关系查询与所述目标样本关联的分层编号,显示该分层编号对应的分层位置信息。可选的,所述服务器还包括以下一个或多个单元:实体库监控单元,用于获取监控设备对所述合成生物学样本实体库的监控图像;操作记录单元,用于存储所述合成生物学样本实体库中每个样本对象的被操作记录;物品管理单元,用于根据所述合成生物学样本实体库的当前库存信息,确定所述合成生物学样本实体库的库存是否欠缺,如果是,则向预设的客户端发送欠缺提示信息;则,所述客户端,还用于响应用户查询所述监控图像的请求,获取请求的监控图像;还用响应于用户查询所述被操作记录的请求,获取请求的被操作记录。可选的,当所述合成生物学样本实体库包括至少两个样本分库时,则其中一个样本分库中存储的样本对象用于正常使用,其它样本分库中存储的样本对象用于备份。可选的,所述合成生物学样本实体库中存储的元件之间、模块之间、以及元件与模块之间能够兼容适配。可选的,所述服务器还包括以下一个或多个单元:项目管理单元,用于存储所述合成生物学样本实体库中每一样本对象所属项目的项目信息;编码管理单元,用于根据预制编码规则,对所述合成生物学样本实体库涉及的所有项目、每一项目下的子课题以及每一子课题下的分任务进行逐层编号,并对各个所述分任务下入库的样本对象进行分类编号。信息更新单元,用于响应不同账户下的用户对负责样本对象的信息更新;管理员设置单元,用于响应管理员对所述不同账户的权限设定;信息查询单元,用于响应每一合法用户的样本信息查询请求。可选的,所述客户端,还用于通过互联网公开共享平台,展示所述合成生物学或所述合成生物学样本实体库的相关信息;所述客户端,还用于通过互联网公开共享平台,展示所述合成生物学样本实体库的参与人员规定。本专利技术还提供了一种基于合成生物学样本实体库的信息处理方法,所述合成生物学样本实体库用于存储至少一个样本对象;所述系统包括服务器和客户端,所述服务器包括精准存储单元;所述方法包括:所述精准存储单元模拟所述合成生物学样本实体库,生成三维形式的虚拟样本库;所述客户端响应用户查询目标样本的请求,定位并显示所述目标样本在所述虚拟样本库中的空间位置,所述目标样本为所述合成生物学样本实体库中存储的一个样本对象。可选的,所述方法还包括:所述精准存储单元对所述合成生物学样本实体库中的存储设备按照分层进行唯一编号,并建立每一分层编号与对应分层存放的样本对象之间的关联关系;所述客户端根据所述关联关系查询与所述目标样本关联的分层编号,显示该分层编号对应的分层位置信息。可选的,所述服务器还包括实体库监控单元、操作记录单元、物品管理单元中的一个或多个;所述方法还包括:所述实体库监控单元获取监控设备对所述合成生物学样本实体库的监控图像;所述客户端响应用户查询所述监控图像的请求,获取请求的监控图像;所述操作记录单元存储所述合成生物学样本实体库中每个样本对象的被操作记录;所述客户端,用于响应于用户查询所述被操作记录的请求,获取请求的被操作记录;所述物品管理单元,用于根据所述合成生物学样本实体库的当前库存信息,确定所述合成生物学样本实体库的库存是否欠缺,如果是,则向预设的客户端发送欠缺提示信息。可选的,当所述合成生物学样本实体库包括至少两个样本分库时,则其中一个样本分库中存储的样本对象用于正常使用,其它样本分库中存储的样本对象用于备份。可选的,所述合成生物学样本实体库中存储的元件之间、模块之间、以及元件与模块之间能够兼容适配。可选的,所述服务器还可以包括项目管理单元、编码管理单元、信息更新单元、管理员设置单元和信息查询单元中的一个或多个;则,所述方法还包括:所述项目管理单元存储所述合成生物学样本实体库中每一样本对象所属项目的项目信息;所述编码管理单元根据预制编码规则,对所述合成生物学样本实体库涉及的所有项目、每一项目下的子课题以及每一子课题下的分任务进行逐层编号,并对各个所述分任务下入库的样本对象进行分类编号;所述信息更新单元响应不同账户下的用户对负责样本对象的信息更新;所述管理员设置单元响应管理员对所述不同账户的权限设定;所述信息查询单元响应每一合法用户的样本信息查询请求。可选的,所述方法还可以包括:所述客户端通过互联网公开共享平台,展示所述合成生物学或所述合成生物学样本实体库的相关信息;所述客户端通过互联网公开共享平台,展示所述合成生物学样本实体库的参与人员规定。本专利技术提供的一种基于合成生物学样本实体库的信息处理系统,所述合成生物学样本实体库用于存储至少一本文档来自技高网
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基于合成生物学样本实体库的信息处理系统及方法

【技术保护点】
一种基于合成生物学样本实体库的信息处理系统,其特征在于,所述合成生物学样本实体库用于存储至少一个样本对象;所述系统包括服务器和客户端,所述服务器包括精准存储单元;所述精准存储单元,用于模拟所述合成生物学样本实体库,生成三维形式的虚拟样本库;所述客户端,用于响应用户查询目标样本的请求,定位并显示所述目标样本在所述虚拟样本库中的空间位置,所述目标样本为所述合成生物学样本实体库中存储的一个样本对象。

【技术特征摘要】
1.一种基于合成生物学样本实体库的信息处理系统,其特征在于,所述合成生物学样本实体库用于存储至少一个样本对象;所述系统包括服务器和客户端,所述服务器包括精准存储单元;所述精准存储单元,用于模拟所述合成生物学样本实体库,生成三维形式的虚拟样本库;所述客户端,用于响应用户查询目标样本的请求,定位并显示所述目标样本在所述虚拟样本库中的空间位置,所述目标样本为所述合成生物学样本实体库中存储的一个样本对象。2.根据权利要求1所述的系统,其特征在于,所述精准存储单元,还用于对所述合成生物学样本实体库中的存储设备按照分层进行唯一编号,并建立每一分层编号与对应分层存放的样本对象之间的关联关系;则,所述客户端,还用于根据所述关联关系查询与所述目标样本关联的分层编号,显示该分层编号对应的分层位置信息。3.根据权利要求1所述的系统,其特征在于,所述服务器还包括以下一个或多个单元:实体库监控单元,用于获取监控设备对所述合成生物学样本实体库的监控图像;操作记录单元,用于存储所述合成生物学样本实体库中每个样本对象的被操作记录;物品管理单元,用于根据所述合成生物学样本实体库的当前库存信息,确定所述合成生物学样本实体库的库存是否欠缺,如果是,则向预设的客户端发送欠缺提示信息;则,所述客户端,还用于响应用户查询所述监控图像的请求,获取请求的监控图像;还用响应于用户查询所述被操作记录的请求,获取请求的被操作记录。4.根据权利要求1至3任一项所述的系统,其特征在于,当所述合成生物学样本实体库包括至少两个样本分库时,则其中一个样本分库中存储的样本对象用于正常使用,其它样本分库中存储的样本对象用于备份。5.根据权利要求1至3任一项所述的系统,其特征在于,所述合成生物学样本实体库中存储的元件之间、模块之间、以及元件与模块之间能够兼容适配。6.根据权利要求1至3任一项所述的系统,其特征在于,所述服务器还包括以下一个或多个单元:项目管理单元,用于存储所述合成生物学样本实体库中每一样本对象所属项目的项目信息;编码管理单元,用于根据预制编码规则,对所述合成生物学样本实体库涉及的所有项目、...

【专利技术属性】
技术研发人员:周晓李飞飞李炳志元英进
申请(专利权)人:天津大学
类型:发明
国别省市:天津,12

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