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lncRNA在胃腺癌诊断中的应用制造技术

技术编号:15740139 阅读:53 留言:0更新日期:2017-07-02 05:48
本发明专利技术公开了lncRNA在胃腺癌诊断中的应用,所述lncRNA选自LINC01234、HOTAIR和FEZF1‑AS1中的至少两种。本发明专利技术通过实验证明了LINC01234、HOTAIR和FEZF1‑AS1在胃腺癌患者中表达显著上调;ROC曲线分析显示,上述lncRNA联合应用具有较高的AUC值,提示LINC01234、HOTAIR和FEZF1‑AS1可以联合应用于胃腺癌的诊断中。

The application of lncRNA in the diagnosis of adenocarcinoma of stomach

The present invention discloses the application of lncRNA in the diagnosis of gastric cancer, at least two of the lncRNA, HOTAIR and FEZF1 from LINC01234 in AS1. The present invention is proved by the experiments of HOTAIR, up regulate the expression of LINC01234 and FEZF1 AS1 in gastric cancer patients; ROC curve analysis showed that the higher the combination of above lncRNA AUC, LINC01234 HOTAIR and FEZF1, suggesting the diagnosis of AS1 can be used in the United in gastric cancer.

【技术实现步骤摘要】
lncRNA在胃腺癌诊断中的应用
本专利技术属于生物医药领域,涉及lncRNA在胃腺癌诊断中的应用,具体的涉及LINC01234、HOTAIR和/或FEZF1-AS1在胃腺癌诊断中的应用。
技术介绍
胃癌(gastriccarcinoma,GC)是人类常见的恶性肿瘤,胃癌患者中90%以上为胃腺癌(gastricadenocarcinoma,GAC),同时,胃癌因其侵袭性和转移性强,而成为对人类健康危害较大的恶性肿瘤之一。在世界范围内,胃癌的发病率排在人类常见恶性肿瘤的第五位,但由于其早期症状不明显,常常被误认为慢性胃炎(chronicgastritis)而延误诊断,往往发现诊断较晚,治疗结果不让人满意,死亡率高。人类罹患的癌症肿瘤中,胃癌病死率排在第二位。亚洲是胃癌的高发区,我国属于胃癌高发的国家之一,在我国的东部沿海及西北部地区胃癌的发病率及死亡率高于中国的南方地区。尽管现在针对胃癌的手术方式和化疗方案已经相当规范,但总体的生存率和预后却仍不尽如人意。胃癌患者的不良预后可能与患者诊断时病程大部分在进展期有很大关系。胃癌的发生和发展是由多种内部和外部因素共同作用的结果,但对其分子生物学行为我们知之甚少,针对胃癌发生和发展分子机制方面的研究具有十分重要的意义。迄今为止,早期诊断、早期行手术根治切除对于胃癌患者的预后有重要临床意义。胃癌患者的早期症状不典型,临床表现较为隐匿,早期难以明确诊断,多数患者确诊时已处于疾病的中晚期,无法手术根治切除进一步降低了患者的5年生存率。目前,针对进展期胃癌的治疗方法主要包括手术切除、新辅助化疗和辅助放化疗等,但已侵犯腹腔脏器或多发淋巴结转移的患者,往往难以行手术根治性切除。因此胃癌的早期诊断对于胃癌患者的有效治疗具有重要的意义。长链非编码RNA(longnon-codingRNA,简称lncRNA)是最近备受瞩目的哺乳动物转录组重要成员。与蛋白编码基因相比,它具有明显的组织特异性及发育阶段特异性,更可从多个角度调节蛋白编码基因的表达及修饰,如对蛋白编码基因的表观遗传学调节等。因此,lncRNA失调成为多种癌症的特征之一。lncRNA的发现为研究恶性肿瘤的生物学行为、揭示恶性肿瘤化疗耐药本质提供了重要契机。研究胃腺癌lncRNA表达谱变化,并深入研究这些差异表达lncRNA分子与胃腺癌的发生发展的关系,为胃腺癌的机制研究提供新视角,为胃腺癌的治疗提供新靶点和新策略。
技术实现思路
为了弥补现有技术的不足,本专利技术的目的之一,在于提供与胃腺癌发生发展相关的分子标志物。本专利技术的目的之二,在于提供一种诊断胃腺癌的产品和手段,通过检测分子标志物的表达水平来判断患者是否患有胃腺癌或者患胃腺癌的风险,从而指导临床医生进行早期干预和治疗,提高患者的生存率和生存质量。为了实现上述目的,本专利技术采用如下技术方案:本专利技术提供了检测lncRNA的试剂在制备诊断胃腺癌的产品中的应用,所述lncRNA选自LINC01234、HOTAIR和FEZF1-AS1中的任意两种或三种。进一步,所述lncRNA为LINC01234、HOTAIR和FEZF1-AS1中的三种。使用三种lncRNA进行联合诊断,具有较高的准确性,以及特异性和敏感性。进一步,所述检测lncRNA的试剂选自:特异性识别LINC01234、HOTAIR或FEZF1-AS1的探针;或特异性扩增LINC01234、HOTAIR或FEZF1-AS1的引物。本专利技术提供了一种诊断胃腺癌的产品,,所述产品包括检测LINC01234、HOTAIR和FEZF1-AS1中至少两种lncRNA表达水平的试剂。进一步,所述产品包括通过RT-PCR、实时定量PCR、原位杂交、芯片或高通量测序平台的方法检测所述lncRNA表达水平的试剂。本专利技术提供了一种诊断胃腺癌的芯片,所述产品包括固相载体,以及固定在固相载体上的寡核苷酸探针,所述寡核苷酸探针特异性识别LINC01234、HOTAIR和FEZF1-AS1中的至少两种。优选的,所述寡核苷酸探针特异性识别LINC01234、HOTAIR和EZF1-AS1三种lncRNA。所述固相载体包括无机载体和有机载体,所述无机载体包括但不限于有硅载体、玻璃载体、陶瓷载体等;所述有机载体包括聚丙烯薄膜、尼龙膜等。本专利技术提供了一种诊断胃腺癌的试剂盒,所述试剂盒包括特异性扩增lncRNA以及管家基因的引物对,所述lncRNA选自LINC01234、HOTAIR和FEZF1-AS1中至少两种。优选的,所述试剂盒包括特异性扩增LINC01234、HOTAIR和FEZF1-AS1三种lncRNA的引物对。进一步,所述试剂盒还包括逆转录体系、聚合酶链式反应体系以及使用说明书。具体的,试剂盒中还含有用于标记RNA样品的标记物,以及与所述标记物相对应的底物。此外,所述的试剂盒中还可包括用于提取RNA、PCR、杂交、显色等所需的各种试剂,包括但不限于:抽提液、扩增液、杂交液、酶、对照液、显色液、洗液等。此外,所述的试剂盒中还包括使用说明书和/或芯片图像分析软件。附图说明图1是QPCR检测五个lncRNA在胃腺癌组织和癌旁组织中的差异表达图;其中,图A是QPCR检测LINC01234在胃腺癌组织和癌旁组织中的差异表达图;图B是QPCR检测HOTAIR在胃腺癌组织和癌旁组织中的差异表达图;图C是QPCR检测FEZF1-AS1在胃腺癌组织和癌旁组织中的差异表达图;图D是QPCR检测LINC01105在胃腺癌组织和癌旁组织中的差异表达图;图E是QPCR检测LINC00982在胃腺癌组织和癌旁组织中的差异表达图。图2是利用TCGA数据库交叉验证五个lncRNA在为胃腺癌组织和癌旁组织中的差异表达图;其中,图A是图A是验证LINC01234在胃腺癌组织和癌旁组织中的差异表达图;图B是验证HOTAIR在胃腺癌组织和癌旁组织中的差异表达图;图C是验证FEZF1-AS1在胃腺癌组织和癌旁组织中的差异表达图;图D是验证LINC01105在胃腺癌组织和癌旁组织中的差异表达图;图E是验证LINC00982在胃腺癌组织和癌旁组织中的差异表达图。具体的实施方式本专利技术经过广泛而深入的研究,通过高通量测序方法,检测胃腺癌标本中lncRNA在肿瘤组织和癌旁组织的表达,发现其中具有明显表达差异的lncRNA片段,探讨其与胃腺癌的发生之间的关系,从而为胃腺癌的早期检测及靶向治疗寻找更好的途径和方法。通过筛选,本专利技术发现了胃腺癌中LINC01234、HOTAIR和FEZF1-AS1显著性上调。使用生物信息学方法证明,LINC01234、HOTAIR或FEZF1-AS1作为分子标志物应用于胃腺癌的早期诊断具有较高的准确性。分子标志物“分子标志物”是其在组织或细胞中的表达水平与正常或健康细胞或组织的表达水平相比发生改变的任何基因。“差异表达基因”或“基因差异表达”是指,与正常或对照用靶的表达相比,在患有胃腺癌的患者体内得到更高或更低水平的活化的基因。此外,“差异表达基因”或“差异基因表达”包括相同疾病的不同分期内得到更高或更低水平的活化的基因。这种差异可通过如多肽的mRNA水平、表面显示、分泌或其他分配上的变化而得以证明。从本专利技术的目的出发,将“差异基因表达”视为从正常的或患有疾病的受试本文档来自技高网
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lncRNA在胃腺癌诊断中的应用

【技术保护点】
检测lncRNA的试剂在制备诊断胃腺癌的产品中的应用,其特征在于,所述lncRNA选自LINC01234、HOTAIR和FEZF1‑AS1中的任意两种或三种。

【技术特征摘要】
1.检测lncRNA的试剂在制备诊断胃腺癌的产品中的应用,其特征在于,所述lncRNA选自LINC01234、HOTAIR和FEZF1-AS1中的任意两种或三种。2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述lncRNA为LINC01234、HOTAIR和FEZF1-AS1中的三种。3.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述检测lncRNA的试剂选自:特异性识别LINC01234、HOTAIR或FEZF1-AS1的探针;或特异性扩增LINC01234、HOTAIR或FEZF1-AS1的引物。4.一种诊断胃腺癌的产品,其特征在于,所述产品包括检测LINC01234、HOTAIR和FEZF1-AS1中至少两种lncRNA表达水平的试剂。5.根据权利要求4所述的产品,其特征在于,所述产品包括通过RT-PCR、实时定量PCR、原位杂交、芯片或高通量测序平台的方法检测所述lncRN...

【专利技术属性】
技术研发人员:谷建斌
申请(专利权)人:谷建斌
类型:发明
国别省市:河北,13

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