使用MIRNA比率确定肺癌制造技术

本发明专利技术提供确定受试者中肺肿瘤的存在情况的方法。还提供确定受试者中侵袭性肺肿瘤的存在情况的方法。另外，提供确定受试者中出现肺肿瘤的风险的方法。还提供确定受试者中出现侵袭性肺肿瘤的风险的方法。还提供预测受试者中发展或具有肺肿瘤的风险的方法。另外提供确立肺癌治疗选项的方法。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】相关申请的交叉参考本申请要求2014年1月5日提交的美国临时申请号61/923,758和2014年1月12日提交的美国临时申请号61/926,323的优先权和权益，这两个申请均通过引用以其整体结合到本文中。
本申请总体上涉及诊断肺癌和确定肺癌的风险。更具体地，本申请涉及使用miRNA表达比率确定出现肺肿瘤或侵袭性肺肿瘤的风险，和确定肺肿瘤或侵袭性肺肿瘤的存在情况。专利技术背景肺癌是全世界癌症死亡的主要原因(Jemal等, CA Cancer J Clin, 61:69-9, 2011)。目前大多数肺癌在晚期被检出，这时治疗具有有限功效和存活率低。在早期检出肺癌可显著减少死亡率。欧洲随机化肺癌筛选试验，利用观察对照组但有限大小，迄今为止未证实死亡率减少(Infante等, Am J Respir Crit Care Med 180:445-453, 2009; Saghir等, Thorax 67:296-301, 2012; Pastorino等, Eur J Cancer Prev 21:308-315, 2012)；然而，来自大的NCI-发起的国家肺筛选试验(NSLT)的结果本文档来自技高网...

【技术保护点】
确定受试者中肺肿瘤的存在情况的方法，所述方法包括：(a) 测定来自受试者的生物样品中的miRNA对的表达比率；(b) 比较来自步骤(a)的表达比率与自多个对照样品的多个相应的miRNA对的平均比率测定的截止值；(c) 如果步骤(a)的miRNA对的表达比率超过步骤(b)的截止值，则对所述比率分配正评分，或如果步骤(a)的miRNA对的表达比率未超过步骤(b)的截止值，则对所述比率分配非正评分；(d) 对另外的miRNA对重复步骤(a)至(c)，直到(1) 至少9个miRNA对表达比率被分配了正评分，或(2) 在比较27个miRNA对的表达比率后，少于9个miRNA对表达比率被分配了正评分，其中...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2014.01.05 US 61/923758;2014.01.12 US 61/9263231.确定受试者中肺肿瘤的存在情况的方法，所述方法包括：(a) 测定来自受试者的生物样品中的miRNA对的表达比率；(b) 比较来自步骤(a)的表达比率与自多个对照样品的多个相应的miRNA对的平均比率测定的截止值；(c) 如果步骤(a)的miRNA对的表达比率超过步骤(b)的截止值，则对所述比率分配正评分，或如果步骤(a)的miRNA对的表达比率未超过步骤(b)的截止值，则对所述比率分配非正评分；(d) 对另外的miRNA对重复步骤(a)至(c)，直到(1) 至少9个miRNA对表达比率被分配了正评分，或(2) 在比较27个miRNA对的表达比率后，少于9个miRNA对表达比率被分配了正评分，其中所述miRNA对包括106a/140-5p、106a/142-3p、126/140-5p、126/142-3p、133a/142-3p、140-5p/17、142-3p/148a、142-3p/15b、142-3p/17、142-3p/21、142-3p/221、142-3p/30b或320/660，或其反比；和(e) 按以下将肺肿瘤的存在情况分类：(i) 如果至少9个miRNA对表达比率被分配了正评分，则为阳性；或(ii) 如果少于9个miRNA对表达比率被分配了正评分，则为阴性。2.权利要求1的方法，其中所述miRNA对包括106a/140-5p、106a/142-3p、126/140-5p、126/142-3p、133a/142-3p、140-5p/17、142-3p/148a、142-3p/15b、142-3p/17、142-3p/21、142-3p/221、142-3p/30b和320/660，或其反比。3.权利要求1的方法，其中所述miRNA对进一步包括106a/660、106a/92a、126/660、140-5p/197、140-5p/28-3p、142-3p/145、142-3p/197、142-3p/28-3p、17/660、17/92a、197/660、197/92a、19b/660或28-3p/660，或其反比。4.权利要求2的方法，其中所述miRNA对进一步包括106a/660、106a/92a、126/660、140-5p/197、140-5p/28-3p、142-3p/145、142-3p/197、142-3p/28-3p、17/660、17/92a、197/660、197/92a、19b/660和28-3p/660，或其反比。5.确定受试者中侵袭性肺肿瘤的存在情况的方法，包括：(a) 测定来自受试者的生物样品中的miRNA对的表达比率；(b) 比较来自步骤(a)的表达比率与自多个对照样品的多个相应的miRNA对的平均比率测定的截止值；(c) 如果步骤(a)的miRNA对的表达比率超过步骤(b)的截止值，则对所述比率分配正评分，或如果步骤(a)的miRNA对的表达比率未超过步骤(b)的截止值，则对所述比率分配非正评分；(d) 对另外的miRNA对重复步骤(a)至(c)，直到(1) 至少14个miRNA对表达比率被分配了正评分，或(2) 在比较28个miRNA对的表达比率后，少于14个miRNA对表达比率被分配了正评分，其中所述miRNA对包括106a/16、106/660、16/17、16/320、17/660、197/30b、197/30c、320/451、320/486-5p或320/660，或其反比；和(e) 按以下将侵袭性肺肿瘤的存在情况分类：(i) 如果至少14个miRNA对表达比率被分配了正评分，则为阳性；或(ii) 如果少于14个miRNA对表达比率被分配了正评分，则为阴性。6.权利要求5的方法，其中所述miRNA对包括106a/16、106/660、16/17、16/320、17/660、197/30b、197/30c、320/451、320/486-5p和320/660，或其反比。7.权利要求5的方法，其中所述miRNA对进一步包括106a/451、106a/486-5p、126/451、126/486-5p、126/660、140-5p/197、16/197、17/451、17/486-5p、197/451、197/486-5p、197/660、197/92a、19b/451、19b/486-5p、19b/660、28-3p/451或28-3p/486-5p，或其反比。8.权利要求6的方法，其中所述miRNA对进一步包括106a/451、106a/486-5p、126/451、126/486-5p、126/660、140-5p/197、16/197、17/451、17/486-5p、197/451、197/486-5p、197/660、197/92a、19b/451、19b/486-5p、19b/660、28-3p/451或28-3p/486-5p，或其反比。9.确定受试者中出现肺肿瘤的风险的方法，所述方法包括：(a) 测定来自受试者的生物样品中的miRNA对的表达比率；(b) 比较来自步骤(a)的表达比率与自多个对照样品的多个相应的miRNA对的平均比率测定的截止值；(c) 如果步骤(a)的miRNA对的表达比率超过步骤(b)的截止值，则对所述比率分配正评分，或如果步骤(a)的miRNA对的表达比率未超过步骤(b)的截止值，则对所述比率分配非正评分；(d) 对另外的miRNA对重复步骤(a)至(c)，直到(1) 至少10个miRNA对表达比率被分配了正评分，或(2) 在比较27个miRNA对的表达比率后，少于10个miRNA对表达比率被分配了正评分，其中所述miRNA对包括133a/92a、15b/21、15b/30b、15b/30c、16/197或28-3p/451，或其反比；和(e) 按以下将出现肺肿瘤的风险分类：(i) 如果至少10个miRNA对表达比率被分配了正评分，则为阳性；或(ii) 如果少于10个miRNA表达比率被分配了正评分，则为阴性。10.权利要求9的方法，其中所述miRNA对包括133a/92a、15b/21、15b/30b、15b/30c、16/197和28-3p/451，或其反比。11.权利要求9的方法，其中所述miRNA对进一步包括101/140-3p、106a/451、106a/660、106a/92a、126/660、133a/451、133a/660、140-3p/660、142-3p/15b、15b/451、15b/660、17/451、17/660、17/92a、197/19b、197/451、197/660、197/92a、19b/660、28-3p/660或320/660，或其反比。12.权利要求10的方法，其中所述miRNA对进一步包括101/140-3p、106a/451、106a/660、106a/92a、126/660、133a/451、133a/660、140-3p/660、142-3p/15b、15b/451、15b/660、17/451、17/660、17/92a、197/19b、197/451、197\...

【专利技术属性】
技术研发人员：G索兹，M贝里，U帕斯托里诺，
申请(专利权)人：拜奥米尔纳控股有限公司，
类型：发明
国别省市：爱尔兰;IE