本发明专利技术公开了一种基于高光谱透射成像的雨生红球藻色素含量可视化方法，包括步骤：1)采用高光谱透射成像系统，对雨生红球藻藻液进行透射高光谱图像的采集；2)对透射高光谱图像进行白板校正，选取雨生红球藻藻液的若干个像素点作为感兴趣区域，并提取该感兴趣区域内的平均光谱曲线；3)在预处理后的平均光谱曲线中提取λ个特征波段，并利用各特征波段的平均光谱曲线与藻液色素的化学值，建立预测模型；4)在透射高光谱图像中，选出特征波段下的感兴趣区域光谱；5)选取各种藻液色素对应的最优预测模型，计算每个像素点对应的藻液色素单位体积含量化学指标；6)根据各种藻液色素的化学指标范围，调整显示值的范围，输出可视化图像。
【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及雨生红球藻色素含量可视化领域，尤其涉及一种基于高光谱透射成像的雨生红球藻色素含量可视化方法。
技术介绍
色素作为一种着色剂，被广泛应用在食品、纺织和医药等领域。而微藻作为一种天然色素的来源，有必要在其培养过程中进行色素检测和监控。从以往的研究中发现，从微藻中提取的色素主要有叶绿素、类胡萝卜素、虾青素和藻蓝素等，其中叶绿素是微藻进行光合作用的基础，经常作为大部分绿藻的生命特征指标之一，而类胡萝卜素则是工业界从微藻中提取的常见色素，可以被广泛运用到各个领域。在以往的研究中，大部分是改变微藻内在和外在的因素来促进相关色素的积累，过程中需要对色素进行频繁检测。而传统检测色素需要通过复杂的化学手段对微藻色素进行提取然后再检测，通常而言比较费时费力，且对原有藻液造成了破坏性影响。另外，雨生红球藻被公认为自然界中生产天然虾青素的最好生物，而虾青素也是类胡罗素之一，同时，其积累对叶绿素也有一定的影响，是一种具有代表性的藻类。
技术实现思路
本专利提供了一种基于高光谱透射成像的雨生红球藻色素含量可视化方法，通过化学计量学方法建立预测模型，旨在探索稳定的微藻色素含量的快速无损检测方法，为今后光谱技术应用于微藻色素检测领域提供了有力的基础研究和技术支持，解决了现有检测方法操作相对繁琐、耗时、耗力的问题。本专利技术的具体技术方案如下：一种基于高光谱透射成像的雨生红球藻色素含量可视化方法，包括以下步骤：(1)搭建高光谱透射成像系统；整个样品载物台有木板钉制而成，最上方中间镂一圆孔，将光源安置固定在圆孔下方，且灯泡中心和圆孔中心相互对准，然后将样品放置在圆孔上方即可扫描收集样品的透射光谱。(2)取不同生长周期的雨生红球藻藻液加入到培养皿中进行透射高光谱图像的采集。(3)采用ENVI4.7软件选取雨生红球藻藻液的8500个像素点作为感兴趣区域(ROI)，然后取该感兴趣区域内的平均光谱曲线。(4)采用上述得到的平均光谱曲线与藻液色素的化学值建立基于化学量学方法的预测模型。(5)对白板校正后的透射高光谱法采集的各100个样本图像512个波段选取感兴趣区域ROI；(6)计算ROI得到各样本平均光谱曲线；(7)对平均光谱曲线使用不同的预处理方法建模预测，选出最优预处理方法；(8)用特征提取算法选取λ个有效波长，根据上述结果分析，λ为4或者6。然后使用PLS、MLR、LS-SVM三种不同建模方法建模预测，选出最优模型算法；(9)将高光谱图像输入Matlab，选出特征波段下的感兴趣区域光谱，ROI区域为a*b大小的矩形，每个像素点都包含λ个波长信息；(10)将其展开成a*b*λ的矩阵，结合上述最优的模型算法公式，计算预测每个像素点对应的叶绿素a、叶绿素b、类胡萝卜素单位体积含量化学指标；(11)根据对应的化学指标范围，调整对应显示值的范围，通过matlab输出可视化图像。步骤(1)中搭建的高光谱透射成像系统，其中光源为2900Lightsource，由美国Illumination Technology公司生产，配备150W石英卤素灯，光线性
灯，色温2800K，使用寿命200～8000h，可以提供380～2000nm波段连续平滑的光源。为了使得获得的光源更加均匀，在圆孔上方安置一片磨砂毛玻璃。通过两个分支光纤组成一对相互对称的线光源，强度大小可以通过光源发射器可调。步骤(2)中使用可见/近红外波段高光谱成像系统(ImSpector V10E)进行扫描，扫描的光谱范围为380～1030nm，共计512个波段，光谱分辨率为2.8nm，曝光时间为90ms，输送带速度为2.30mm/s。步骤(3)中去掉首部噪声部分82个波长，保留480～1030nm(共430个波段)范围内的平均光谱。步骤(4)中藻液的色素主要包括叶绿素a，叶绿素b，类胡萝卜素等；涉及的化学计量学方法主要有偏最小二乘法(PLS)，多元线性回归(MLR)，最小二乘支持向量机(LS-SVM)等。步骤(7)中涉及的预处理方法主要包括基线校正(Baseline offset，BO)、卷积平滑(Savitzky-Golay，SG)、多元散射校正(MSC)和变量标准化(SNV)等。步骤(8)中涉及的特征提取算法为连续投影算法(SPA)。步骤(8)中针对叶绿素a，叶绿素b，类胡萝卜素选出的最优模型分别为SPA-PLS，SPA-MLR，SPA-MLR。与现有技术相比，本专利技术的有益效果为：本专利技术实现了雨生红球藻色素含量的可视化研究，不需要配制任何溶液或采用显微技术等，大大简化了操作步骤，缩短了检测时间，也避免了由于操作人员操作不熟练或者主观因素带来的测量结果不准确等后果。附图说明图1为实施例中高光谱成像透射系统的结构示意图。图2为实施例中透射高光谱图像反演可视化过程示意图。图3为实施例中基于透射高光谱图像的雨生红球藻色素反演可视化图像。具体实施方式下面结合具体实施例进一步阐释本专利技术。搭建如图1所示的高光谱透射成像系统，包括暗箱1，暗箱1的底部为载物台，载物台上摆放有投射装置3，卤素灯光源4位于投射装置3内，且光源中心与其正上方的圆孔中心对准，圆孔上方覆盖一具有磨砂面的毛玻璃9，微藻样本5放置于毛玻璃9上。暗箱1内的顶部设有CCD相机7和高光谱仪2，其中高光谱仪2的镜头6位于微藻样本5的正上方。载物台由步进电机8驱动，步进电机8和CCD相机7均连接至计算机10，由计算机10通过步进电机8控制载物台，以及对CCD相机7所采集的高光谱图像进行处理。其中光源为2900Lightsource，由美国Illumination Technology公司生产，配备150W石英卤素灯，光线性灯，色温2800K，使用寿命200～8000h，可以提供380～2000nm波段连续平滑的光源。通过两个分支光纤组成一对相互对称的线光源，强度大小可以通过光源发射器可调。取不同生长周期的雨生红球藻藻液2ml、4ml、6ml、8ml、10ml分别加入8ml、6ml、4ml、2ml、0ml蒸馏水稀释藻液，共计5个不同浓度梯度的藻液，分别取4ml加入到培养皿中，重复20次，共计100个样本。本实施例中使用可见/近红外波段高光谱成像系统(ImSpector V10E)进行扫描，扫描的光谱范围为380～1030nm，共计512个波段，光谱分辨率为2.8nm，曝光时间为90ms，输送带速度为2.30mm/s。因为高光谱摄像头中存在一定的暗电流和噪声，同时，光源的强度在各波段下的分布也不均匀，会容易造成高光谱图像在光源强度分布较弱的波段下含有较大的噪声，所以有必要对高光谱图像进行黑白校正。在相同的采集环境下，反射光谱扫描标准白色板，透射光谱由于没有标准透射白板，固使用培养皿中放蒸馏水作为全透射白板，扫描两者后得到标定图像Wλ，关闭相机镜头进行图像采集得到全黑的标定图像Bλ，然后按照式(1)对原始光谱进行校正。Rλ=Iλ-BλWλ-Bλ---(1)]]>其中，Rλ为校正后的高光谱图像，Iλ为直接采集到的高光谱图像。所有高光谱图像数据的采集都是基于Spectral Cube软件平台完成的，需要使用ENVI4.7(Research System I本文档来自技高网...
【技术保护点】
一种基于高光谱透射成像的雨生红球藻色素含量可视化方法，其特征在于，包括以下步骤：1)采用高光谱透射成像系统，对处于不同生长周期的雨生红球藻藻液进行透射高光谱图像的采集；2)对所述的透射高光谱图像进行白板校正，选取雨生红球藻藻液的若干个像素点作为感兴趣区域，并提取该感兴趣区域内的平均光谱曲线；3)在预处理后的平均光谱曲线中提取λ个特征波段，并利用各特征波段的平均光谱曲线与藻液色素的化学值，使用PLS、MLR、LS‑SVM三种不同方法建立预测模型；4)在所述的透射高光谱图像中，选出特征波段下的感兴趣区域光谱，感兴趣区域为a*b大小的矩形，每个像素点均包含λ个波长信息；5)选取各种藻液色素对应的最优预测模型，并利用展开得到的a*b*λ的矩阵，计算每个像素点对应的叶绿素a、叶绿素b或类胡萝卜素单位体积含量化学指标；6)根据各种藻液色素的化学指标范围，调整显示值的范围，通过matlab输出可视化图像。
【技术特征摘要】
1.一种基于高光谱透射成像的雨生红球藻色素含量可视化方法，其特征在于，包括以下步骤：1)采用高光谱透射成像系统，对处于不同生长周期的雨生红球藻藻液进行透射高光谱图像的采集；2)对所述的透射高光谱图像进行白板校正，选取雨生红球藻藻液的若干个像素点作为感兴趣区域，并提取该感兴趣区域内的平均光谱曲线；3)在预处理后的平均光谱曲线中提取λ个特征波段，并利用各特征波段的平均光谱曲线与藻液色素的化学值，使用PLS、MLR、LS-SVM三种不同方法建立预测模型；4)在所述的透射高光谱图像中，选出特征波段下的感兴趣区域光谱，感兴趣区域为a*b大小的矩形，每个像素点均包含λ个波长信息；5)选取各种藻液色素对应的最优预测模型，并利用展开得到的a*b*λ的矩阵，计算每个像素点对应的叶绿素a、叶绿素b或类胡萝卜素单位体积含量化学指标；6)根据各种藻液色素的化学指标范围，调整显示值的范围，通过matlab输出可视化图像。2.如权利要求1所述的雨生红球藻色素含量可视化方法，其特征在于，所述的高光谱透射成像系统包括中部设有圆孔的载物台，光源位于圆孔下方，且圆孔...
【专利技术属性】
技术研发人员：邵咏妮，周宏，潘健，何勇，
申请(专利权)人：浙江大学，
类型：发明
国别省市：浙江;33
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