本发明专利技术涉及一种确定患者发生医院内感染的易感性的方法以及一种确立患者败血性综合征进展的预后的方法，其中：a.从患者获得生物样品，并从所述生物样品提取生物材料，b.制备对至少一种靶基因的表达产物特异的至少一种试剂，所述靶基因选自S100A9和S100A8靶基因；c.测定靶基因S100A9和S100A8中至少一种的表达，相对于指定阈值的过表达是发生医院内感染的易感性的指征和败血性综合征进展的较差预后的指征。
【技术实现步骤摘要】
用于确定患者发生医院内感染的易感性以及确立败血性综合征进展的预后的方法本申请为申请日为2010年1月18日、申请号为201080004721.X、专利技术名称为“用于确定患者发生医院内感染的易感性以及确立败血性综合征进展的预后的方法”的专利技术专利申请的分案申请。本专利技术涉及一种确定患者发生医院内感染的易感性的方法。本专利技术还涉及一种确立患者的败血性休克进展的预后的方法。医院内感染构成真正的公共卫生问题。在法国，每年发生医院内感染的患者数目据估计为500,000到800,000。医院内感染的发生与多种因素有关，诸如使用的医疗技术，以及患者发生医院内感染的易感性。因此，患有免疫系统缺陷的患者，营养不良的人，婴儿，老年人，患败血性综合征的人，大面积烧伤患者，以及处于创伤状态的人可能比其他人更容易发生医院内感染。败血性综合征(对感染的全身应答)代表了重症监护室的一种主要死亡原因。它可以源于细菌，病毒，真菌病或寄生虫感染。可以按照它们的严重性将败血性综合征分类。下面按照增加的严重性区分：SIRS(全身性炎性应答综合征)，败血症，严重败血症和败血性休克。因此，在2001年，专家组提出了确定这4种临床综合征的标准[1]：·SIRS是多种感染性或非感染性原因引发的炎性全身性应答。在非感染性原因引发的SIRS状态中，我们可以提及创伤状态，烧伤，胰腺炎，和急性呼吸综合征。炎性全身性应答显示为下列症状的至少两种：a)体温高于38℃或低于36℃；b)心率高于90次搏动每分钟；c)呼吸频率高于20次呼吸每分钟；d)白细胞计数高于12000/mm3或低于4000/mm3，·败血症是与感染有关的炎性全身性应答综合征，·严重败血症是与低动脉压和/或灌注不足和/或至少一种器官的功能异常有关的败血症，·败血性休克是与长期低血压有关的严重败血症，可由以下确定：·被鉴定的感染部位的存在，·尽管足够的灌注并用血管升压药治疗，仍长期低血压。通常，败血症、严重败血症和败血性休克的症状是非常类似的，这3种情况的差异主要在于所有生活机能紊乱的水平。在败血性休克期间，我们主要观察到血压降低，心动过速，呼吸急促，皮肤的纹理化，体温过低或体温过高，颤抖。这些症状还伴有“靶”器官的功能异常，以及远离感染病灶的器官(肾，肺，中枢神经系统，消化系统和凝血系统)的功能恶化，反映在少尿(<0.5ml/kg/h)，肾功能不全，低氧血，血小板减少，激动和精神混乱。败血性综合征患者对于医院内感染（即与待在卫生机构有关的感染)多多少少也是敏感的。这种敏感性对于这些患者的存活和良好恢复具有相当大的影响。败血性综合征从败血症阶段进展到严重败血症阶段，然后到败血性休克阶段不是系统性的，因为约64％的败血症患者发展成为严重败血症，23％的严重败血症患者进展到败血性休克。在败血性休克这个最终阶段之前，必须对患者进行治疗，以便终止并逆转病理生理过程。因此，必须恢复令人满意的血液动力学状态，并且必须提供有效通气量。还必须有同时的休克对症疗法和尽可能基于细菌学数据的抗生素治疗。看起来尽管可以通过标准控制(诸如在获得表明感染源的细菌学分析结果之前进行广谱抗生素治疗)使一些败血性综合征(尤其是败血性休克)患者恢复，但是其他患者(患有更加严重的败血性综合征)需要实施强化疗法，诸如活化的蛋白C。除了非常高的花费外，这种疗法将患者置于严重不良作用(凝血病症等等)的风险中。因此有效靶向很可能受益于这类治疗的患者是非常重要的。因此，了解炎性全身性应答的病因学和确定炎性全身性应答患者对发生医院内感染的易感性对于建议适于患者的治疗来说是非常重要的。对于患者来说非常重要的另一个因素是能够尽早确立败血性休克进展的预后。迄今为止，还没有确定患者患上医院内感染的易感性的检测，尤其是针对炎性全身性应答的患者，而无论所述炎性全身性应答是否与感染有关。本专利技术人出乎意料地证实，基因S100A9和/或S100A8的表达分析尤其适于确定所述易感性，此外它适合于确立败血性休克进展的预后。在下一步之前，给出下列定义用于更好的理解本专利技术。败血性综合征表示对感染的全身应答。这种败血性综合征可以处于SIRS，败血症，严重败血症或败血性休克的阶段。优选地，败血性综合征是败血性休克。医院内感染表示在患者在卫生机构入院时不存在但在入院后48小时在所述机构发生的任何感染。术语靶基因表示S100A9基因和S100A8基因，尤其是参考GenBank中登录号为NM002965.3的S100A9基因和参考GenBank中登录号为NM002964.3的S100A8基因。S100A9基因和S100A8基因的表达产物表示信使RNA或mRNA的片段，cDNA或cDNA的片段，蛋白或蛋白片段。生物样品表示获自患者的任何材料，其可能含有能够检测基因表达的生物材料。它尤其可以是患者的血液，血清，唾液或组织或循环细胞的样品。这类生物样品可以通过本领域技术人员已知的任何取样方式获得，诸如尤其是血液样品。生物材料表示能够检测基因表达的任何材料，诸如尤其是核酸或蛋白，或其编码序列。核酸可以尤其是RNA(核糖核酸)诸如mRNA(信使RNA)。根据本专利技术优选的实施方案，生物材料是核酸，甚至更优选是mRNA。从生物样品提取生物材料可以通过本领域技术人员公知的提取核酸或蛋白的所有方案来实施。作为指导，核酸可以尤其是通过以下步骤提取：·生物样品中存在的细胞的裂解阶段，以便释放微生物的蛋白和/或脂质包膜(作为干扰后续反应的细胞碎片)中包含的核酸。作为实例，有可能使用下列专利申请描述的裂解方法：oWO-A-00/05338，关于混合型磁性和机械裂解，oWO-A-99/53304，关于电裂解，和oWO-A-99/15321，关于机械裂解。本领域技术人员可以使用公知的其他裂解方法，诸如热或渗透压休克或通过离液剂诸如胍盐的化学裂解(US-A-5,234,809)。·纯化阶段，允许将核酸与裂解阶段盐析的其它细胞组分分离。这个阶段通常能够浓缩核酸。举例来说，可以使用任选包被寡核苷酸(通过吸附或共价)的磁性颗粒(参考专利US-A-4,672,040和US-A-5,750,338)，从而通过洗涤阶段纯化与这些磁性颗粒附着的核酸。如果需要后续扩增所述核酸，这个阶段的核酸纯化是尤其有益的。这些磁性颗粒的尤其感兴趣的实施方案描述于专利申请WO-A-97/45202和WO-A-99/35500。核酸纯化方法另一个感兴趣的实例是使用柱形式或惰性颗粒[2]或磁性颗粒形式(Merck：MagPrepＴMSilica，Promega：MagneSilTMParamagnetic颗粒)的二氧化硅。其他广泛使用的方法基于柱或顺磁微粒形式(Whatman：DEAE-Magarose)的离子交换树脂(LevisonPReta1.，J.Chromatography,1998，p.337-344)。高度相关但非本专利技术专有的另一个方法是吸附到金属氧化支持物(来自公司Xtrana：Xtra-BindTM基质)。这个提取阶段可以在自动装置中进行。自动装置是尤其合适的。特异性试剂表示与生物材料反应以直接或间接证实靶基因表达(其可以通过分析得自这些基因的mRNA或通过分析该基因编码的蛋白来测定)的试剂。作为指导，当我们希望通过本文档来自技高网...
【技术保护点】
S100A9基因的表达产物的至少一种特异性试剂在制备建立患者的败血性综合征进展的预后的方法所用的试剂盒中的用途，其中所述方法包括：a)从患者获得生物样品，并从所述生物样品提取生物材料d)制备S100A9基因的表达产物的至少一种特异性试剂e)测定基因S100A9的表达，相对于指定阈值的低表达是败血性综合征进展的良好预后的指征，相对于指定阈值的过表达是败血性综合征进展的较差预后的指征。
【技术特征摘要】
2009.01.19 FR 0950305;2009.01.19 FR 09503061.S100A9基因的表达产物的至少一种特异性试剂在制备试剂盒中的用途，所述试剂盒用于通过测定获得自患者的生物样品中S100A9基因的表达来建立患者的败血性综合征进展的预后，其中所述S100A9基因相对于指定阈值的低表达是败血性综合征进展的良好预后的指征，相对于指定阈值的过表达是败血性综合征进展的较差预后的指征。2.如权利要求1...
【专利技术属性】
技术研发人员：MA·卡扎利斯，A·勒帕普，G·莫内雷，B·穆然，A·帕绍，
申请(专利权)人：生物梅里埃公司，里昂公立收容所，
类型：发明
国别省市：法国;FR
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