【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于生物学领域中的构建方法,特别是涉及一种TALE聚体库的构建方法。
技术介绍
TALEN(Transcription Activator-Like(TAL)Effector Nucleases)靶向基因敲除技术是一项崭新的分子生物学工具,是基因功能研究领域的一项重大技术突破。该技术利用TAL序列模块,构建针对任意核酸靶序列的重组核酸酶,可以实现在特异的位点打断目标基因,从而敲除该基因。TALE蛋白N端和C端分别是核定位信号(Nuclear localization signal,NLS)和转录激活结构域(Activation domain,AD),而中部则是介导其与DNA特异识别与结合的结构域。TALE蛋白的中部包含一段很长的、串联排列的重复序列,其序列重复的部分由长度为33~35个氨基酸残基的重复单位(或称重复单元)构成,在每个重复单位中,+12和+13位的氨基酸残基是实现靶向识别特异DNA碱基的关键位点,随靶点核苷酸序列的不同而异,被称作重复可 ...
【技术保护点】
一种TALE聚体库的构建方法,其特征在于,包括如下步骤:(1)TALE单体扩增:分别以pTALE‑NI,pTALE‑NG,pTALE‑NH,pTALE‑HD载体为模板,使用引物对TALE‑Fn/TALE‑Rn进行扩增,分别得到第一类至第十五类单体的混合物和第十六类单体N16,其中,所述n为1至16;(2)构建酶切连接产物:分别将所述第一类至第十五类单体进行酶切和连接,得到第一至第八酶切连接产物;(3)酶切连接产物扩增:分别以所述第一至第八酶切连接产物和第十六类单体N16为模板,使用引物对attB1‑F/attB1‑R进行扩增,分别得到第一类至第六类五聚体混合物、三聚体混合物 ...
【技术特征摘要】
1.一种TALE聚体库的构建方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)TALE单体扩增:分别以pTALE-NI,pTALE-NG,pTALE-NH,pTALE-HD载
体为模板,使用引物对TALE-Fn/TALE-Rn进行扩增,分别得到第一类至第十五类
单体的混合物和第十六类单体N16,其中,所述n为1至16;
(2)构建酶切连接产物:分别将所述第一类至第十五类单体进行酶切和连
接,得到第一至第八酶切连接产物;
(3)酶切连接产物扩增:分别以所述第一至第八酶切连接产物和第十六类
单体N16为模板,使用引物对attB1-F/attB1-R进行扩增,分别得到第一类至第
六类五聚体混合物、三聚体混合物、二聚体混合物和第十六类单体N16扩增产物;
(4)TALE聚体克隆:分别将所述第一类、第二类、第三类、第四类、第五
类、第六类五聚体混合物、三聚体、二聚体混合物以及第十六类单体N16扩增产
物,与pDonr221载体(Kana+)进行BP反应,将BP反应产物进行转化并进行测序;
(5)TALE聚体库构建:根据确定的五聚体、三聚体、二聚体和单体序列信
息,得到第一类至第五类五聚体库、三聚体库、二聚体库和单体库。
2.根据权利要求1所述的TALE聚体库的构建方法,其特征在于,所述TALE
单体扩增包括如下步骤:
分别以pTALE-NI,pTALE-NG,pTALE-NH,pTALE-HD为模板,
使用引物对TALE-F1/TALE-R1,进行扩增,得到第一类单体的混合物,即
NI1,NG1,NH1和HD1;
使用TALE-F2/TALE-R2引物对进行扩增,得到第二类单体的混合物,即NI2,
NG2,NH2和HD2;
使用TALE-F3/TALE-R3引物对进行扩增,得到第三类单体的混合物,即NI3,
NG3,NH3和HD3;
使用TALE-F4/TALE-R4引物对进行扩增,得到第四类单体的混合物,即NI4,
NG4,NH4和HD4;
使用TALE-F5/TALE-R5引物对进行扩增,得到第五类单体的混合物,即NI5,
\tNG5,NH5和HD5;
使用TALE-F6/TALE-R1引物对进行扩增,得到第六类单体的混合物,即NI6,
NG6,NH6和HD6;
使用TALE-F5/TALE-R7引物对进行扩增,得到第七类单体的混合物,即NI7,
NG7,NH7和HD7;
使用TALE-F8/TALE-R1引物对进行扩增,得到第八类单体的混合物,即NI8,
NG8,NH8和HD8;
使用TALE-F5/TALE-R9引物对进行扩增,得到第九类单体的混合物,即NI9,
NG9,NH9和HD9;
使用TALE-F10/TALE-R1引物对进行扩增,得到第十类单体的混合物,即
NI10,NG10,NH10和HD10;
使用TALE-F5/TALE-R11引物对进行扩增,得到第十一类单体的混合物,即
...
【专利技术属性】
技术研发人员:王文忠,施金秀,张玮,蒙伟能,李春园,温华杰,
申请(专利权)人:赛业广州生物科技有限公司,
类型:发明
国别省市:广东;44
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