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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物,尤其是涉及m6a识别蛋白yth结构域相关基因的sirna及其在疾病治疗方面的应用。
技术介绍
1、m6a(6-甲基腺嘌呤,n6-methyladenosine)甲基化,即在rna腺苷酸(a)第六位的n上发生甲基化修饰,是真核生物rna中最常见的一种转录后修饰,约占rna甲基化修饰的80%左右。
2、m6a rna甲基化是一个动态可逆的修饰过程,该过程需要在m6a甲基转移酶复合物(编码器,writers)、m6a去甲基化酶(消码器,erasers)和m6a识别蛋白(读码器,readers)的参与下催化形成。
3、m6a识别蛋白可以将不同的调节或功能因子募集到含m6a修饰的mrna上,影响靶mrna的命运。含yth结构域的蛋白有保守的m6a结合口袋,是主要的m6a识别蛋白,包括ythdc1-2和ythdf1-3。ythdc1是yth家族蛋白的核心成员,位于细胞核中,识别m6a后可选择性地募集或抑制不同的剪接因子,影响rna的可变剪接。ythdc1还能与剪接因子srsf3、核rna输出因子nxf1相互作用,调控mrna从细胞核向细胞质的输出。ythdc2含多个解旋酶结构域和两个锚蛋白重复序列,优先结合m6a,能提高转录物的翻译效率,同时降低靶mrna的丰度。ythdf1的分布模式与mrna上m6a位点总体一致,可与真核起始因子、核糖体共同作用,增强mrna的翻译效率。ythdf2通过直接募集去腺苷化酶和脱帽酶复合物,将处于翻译池的mrna导向至加工小体,加速m6a修饰转录物的衰变和降解。yt
4、sirna(小干扰rna)是一段与靶基因序列同源的、长度在20-25nt的双链rna,可以特异性地引起具有相同序列的mrna的降解,从而阻断相应基因的表达,进而治疗该基因引起的各类疾病。
5、现有的技术中,目前并没有针对m6a识别蛋白yth结构域相关基因的靶向治疗药物。本专利技术针对m6a识别蛋白yth结构域相关基因设计sirna并有效干扰基因表达,有望突破m6a识别蛋白yth结构域相关基因引起的疾病治疗方面的瓶颈。
技术实现思路
1、针对现有技术存在的不足,本专利技术的目的是提供m6a识别蛋白yth结构域相关基因的sirna及其在疾病治疗方面的应用,其针对m6a识别蛋白yth结构域相关基因设计特异性sirna作为靶向治疗药物,sirna寡聚核酸组合可以有效抑制包含ythdc1、ythdc2、ythdf1、ythdf2、ythdf3在内的m6a识别蛋白yth结构域相关基因的表达,抑制其生物学功能的发挥。
2、本专利技术的上述专利技术目的是通过以下技术方案得以实现的:
3、m6a识别蛋白yth结构域相关基因的sirna,包含ythdc1、ythdc2、ythdf1、ythdf2、ythdf3在内的m6a识别蛋白的sirna寡聚核酸组合。
4、作为本专利技术的进一步的技术方案:所述sirna为一种核酸分子,包括gp-ythdc1-2、gp-ythdc1-3、gp-ythdc1-8、gp-ythdc2-3、gp-ythdc2-5、gp-ythdc2-10、gp-ythdf1-1、gp-ythdf1-9、gp-ythdf1-10、gp-ythdf2-1、gp-ythdf2-3、gp-ythdf2-4、gp-ythdf2-8、gp-ythdf3-1、gp-ythdf3-8、gp-ythdf3-9。
5、作为本专利技术的进一步的技术方案:所述核酸分子为双链rna分子。
6、作为本专利技术的进一步的技术方案:所述gp-ythdc1-2由如下序列的正义链和反义链组成:
7、正义链:5’-gucauaugcagguucagaatt-3’,
8、反义链:5’-uucugaaccugcauaugactt-3’;
9、所述gp-ythdc1-3由如下序列的正义链和反义链组成:
10、正义链:5’-caaaccaguaaacucaaautt-3’,
11、反义链:5’-auuugaguuuacugguuugtt-3’;
12、所述gp-ythdc1-8由如下序列的正义链和反义链组成:
13、正义链:5’-gguccuacaaugauuaugutt-3’,
14、反义链:5’-acauaaucauuguaggacctt-3’。
15、作为本专利技术的进一步的技术方案:所述gp-ythdc2-3由如下序列的正义链和反义链组成:
16、正义链:5’-guuaucagauccgauuagatt-3’,
17、反义链:5’-ucuaaucggaucugauaactt-3’;
18、所述gp-ythdc2-5由如下序列的正义链和反义链组成:
19、正义链:5’-gaagaccauuugaaguaaatt-3’,
20、反义链:5’-uuuacuucaaauggucuuctt-3’
21、所述gp-ythdc2-10由如下序列的正义链和反义链组成:
22、正义链:5’-aguugcuccaguuaugggatt-3’,
23、反义链:5’-ucccauaacuggagcaacutt-3’。
24、作为本专利技术的进一步的技术方案:所述gp-ythdf1-1由如下序列的正义链和反义链组成:
25、正义链:5’-ccagagaacaaaaggacaatt-3’,
26、反义链:5’-uuguccuuuuguucucuggtt-3’;
27、所述gp-ythdf1-9由如下序列的正义链和反义链组成:
28、正义链:5’-caguaucagagcccucagctt-3’,
29、反义链:5’-gcugagggcucugauacugtt-3’;
30、所述gp-ythdf1-10由如下序列的正义链和反义链组成:
31、正义链:5’-cuggagaauaacgacaacatt-3’,
32、反义链:5’-uguugucguuauucuccagtt-3’。
33、作为本专利技术的进一步的技术方案:所述gp-ythdf2-1由如下序列的正义链和反义链组成:
34、正义链:5’-ccuacuuacccaguuacuatt-3’,
35、反义链:5’-uaguaacuggguaaguaggtt-3’;
36、所述gp-ythdf2-3由如下序列的正义链和反义链组成:
37、正义链:5’-cagugggauugacuucucatt本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.m6A识别蛋白YTH结构域相关基因的siRNA,其特征在于,包含YTHDC1、YTHDC2、YTHDF1、YTHDF2、YTHDF3在内的m6A识别蛋白的siRNA寡聚核酸组合。
2.根据权利要求1所述的m6A识别蛋白YTH结构域相关基因的siRNA,其特征在于,所述siRNA为一种核酸分子,包括GP-YTHDC1-2、GP-YTHDC1-3、GP-YTHDC1-8、GP-YTHDC2-3、GP-YTHDC2-5、GP-YTHDC2-10、GP-YTHDF1-1、GP-YTHDF1-9、GP-YTHDF1-10、GP-YTHDF2-1、GP-YTHDF2-3、GP-YTHDF2-4、GP-YTHDF2-8、GP-YTHDF3-1、GP-YTHDF3-8、GP-YTHDF3-9。
3.根据权利要求1或2任一项所述的m6A识别蛋白YTH结构域相关基因的siRNA,其特征在于,所述核酸分子为双链RNA分子。
4.根据权利要求2所述的m6A识别蛋白YTH结构域相关基因的siRNA,其特征在于,所述GP-YTHDC1-2由如下序列的正义链和反义链组成
5.根据权利要求2所述的m6A识别蛋白YTH结构域相关基因的siRNA,其特征在于,所述GP-YTHDC2-3由如下序列的正义链和反义链组成:
6.根据权利要求2所述的m6A识别蛋白YTH结构域相关基因的siRNA,其特征在于,所述GP-YTHDF1-1由如下序列的正义链和反义链组成:
7.根据权利要求2所述的m6A识别蛋白YTH结构域相关基因的siRNA,其特征在于,所述GP-YTHDF2-1由如下序列的正义链和反义链组成:
8.根据权利要求2所述的m6A识别蛋白YTH结构域相关基因的siRNA,其特征在于,所述GP-YTHDF3-1由如下序列的正义链和反义链组成:
9.如权利要求1-8任一项所述的m6A识别蛋白YTH结构域相关基因的siRNA在疾病治疗方面的应用。
10.如权利要求1-8任一项所述的m6A识别蛋白YTH结构域相关基因的siRNA的检测试剂盒,其特征在于,包含YTHDC1、YTHDC2、YTHDF1、YTHDF2、YTHDF3的引物。
11.根据权利要求10所述的m6A识别蛋白YTH结构域相关基因的siRNA的检测试剂盒,其特征在于,所述YTHDC1由如下序列的上游引物和下游引物组成:
12.根据权利要求10所述的m6A识别蛋白YTH结构域相关基因的siRNA的检测试剂盒,其特征在于,所述YTHDC2由如下序列的上游引物和下游引物组成:
13.根据权利要求10所述的m6A识别蛋白YTH结构域相关基因的siRNA的检测试剂盒,其特征在于,所述YTHDF1由如下序列的上游引物和下游引物组成:
14.根据权利要求10所述的m6A识别蛋白YTH结构域相关基因的siRNA的检测试剂盒,其特征在于,所述YTHDF2由如下序列的上游引物和下游引物组成:
15.根据权利要求10所述的m6A识别蛋白YTH结构域相关基因的siRNA的检测试剂盒,其特征在于,所述YTHDF3由如下序列的上游引物和下游引物组成:
16.如权利要求1-8任一项所述的m6A识别蛋白YTH结构域相关基因的siRNA在检测试剂盒方面的应用。
...【技术特征摘要】
1.m6a识别蛋白yth结构域相关基因的sirna,其特征在于,包含ythdc1、ythdc2、ythdf1、ythdf2、ythdf3在内的m6a识别蛋白的sirna寡聚核酸组合。
2.根据权利要求1所述的m6a识别蛋白yth结构域相关基因的sirna,其特征在于,所述sirna为一种核酸分子,包括gp-ythdc1-2、gp-ythdc1-3、gp-ythdc1-8、gp-ythdc2-3、gp-ythdc2-5、gp-ythdc2-10、gp-ythdf1-1、gp-ythdf1-9、gp-ythdf1-10、gp-ythdf2-1、gp-ythdf2-3、gp-ythdf2-4、gp-ythdf2-8、gp-ythdf3-1、gp-ythdf3-8、gp-ythdf3-9。
3.根据权利要求1或2任一项所述的m6a识别蛋白yth结构域相关基因的sirna,其特征在于,所述核酸分子为双链rna分子。
4.根据权利要求2所述的m6a识别蛋白yth结构域相关基因的sirna,其特征在于,所述gp-ythdc1-2由如下序列的正义链和反义链组成:
5.根据权利要求2所述的m6a识别蛋白yth结构域相关基因的sirna,其特征在于,所述gp-ythdc2-3由如下序列的正义链和反义链组成:
6.根据权利要求2所述的m6a识别蛋白yth结构域相关基因的sirna,其特征在于,所述gp-ythdf1-1由如下序列的正义链和反义链组成:
7.根据权利要求2所述的m6a识别蛋白yth结构域相关基因的sirna,其特征在于,所述gp-ythdf2-1由如下序列...
【专利技术属性】
技术研发人员:张珮琢,
申请(专利权)人:上海吉玛制药技术有限公司,
类型:发明
国别省市:
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