本发明专利技术公开结球甘蓝叶球发育基因
【技术实现步骤摘要】
结球甘蓝叶球发育基因BoACS4分子标记及应用
[0001]本专利技术涉及分子育种
,具体地涉及用于鉴定结球甘蓝叶球发育基因
BoACS4
的分子标记及应用
。
技术介绍
[0002]结球甘蓝
(Brassica oleracea L.var.capitata L.)
,简称甘蓝,又名:包心菜
、
洋白菜
、
卷心菜
、
莲花白
、
包菜,是一种重要的十字花科蔬菜作物
。
甘蓝富含优质蛋白
、
纤维素
、
矿物质
、
维生素等,在世界各地普遍栽培
。
据统计,我国甘蓝的种植面积约
90
万
hm2(
杨丽梅
,
方智远
,
张扬勇
,
等
.
中国结球甘蓝抗病抗逆遗传育种近年研究进展
[J].
园艺学报
,2020,47(9):11.DOI:10.16420/j.issn.0513
‑
353x.2020
‑
0494.)
,居世界第一位,在全国蔬菜周年供应及出口贸易中占有十分重要的地位
。
[0003]叶球是甘蓝重要的农艺性状,叶球质量的好坏直接影响着甘蓝的经济价值,研究其及近缘物种的亲缘关系和遗传多样性对资源评价和创制以及新品种培育具有重要意义
。
分子标记分型技术因具有不受环境影响
、
测试周期短
、
供选择的标记数量多
、
可以进行高通量测序分析的优势,已经广泛用于遗传多样性和亲缘关系分析,新品种鉴定
、
种子纯度及品种真实性检测,分子标记辅助育种等研究和应用中
。
[0004]例如,中国专利申请
CN113528698A
公开了一种鉴定和
/
或区分甘蓝类蔬菜的
InDel
分子标记及其应用
。
该专利技术在甘蓝
C09
染色体的
WUSCHEL(WUS)
基因的第二个外显子上筛选到一个
InDel
位点
。
在该
InDel
位点,结球甘蓝
、
球茎甘蓝和芥兰序列与野生甘蓝保持一致,而青花菜
、
花椰菜中存在
12bp
的缺失,从而开发了一种
InDel
分子标记
。
[0005]目前仍需要开发一种针对结球甘蓝的准确
、
稳定可靠的分子标记
。
技术实现思路
[0006]为了解决现有技术中的至少部分技术问题,本专利技术提供了一种用于鉴定结球甘蓝的分子标记
、
引物组
、
方法及应用,从而为结球甘蓝分子辅助育种提供理论依据
。
具体地,本专利技术包括以下内容
。
[0007]本专利技术的第一方面,提供一种与结球甘蓝叶球发育相关的分子标记,其能够用于鉴定结球甘蓝,所述分子标记为结构变异分子标记,其位于
BoACS4
基因上游
2186bp
处
(
或在基因组上的位置
)。
[0008]在某些实施方案中,根据本专利技术所述的与结球甘蓝发育相关的分子标记,其中,所述分子标记具有
SEQ ID NO.1
所示的序列
。
[0009]本专利技术的第二方面,提供一种引物组合,其用于扩增第一方面所述的分子标记
。
[0010]在某些实施方案中,根据本专利技术所述的引物组合,其包括正向引物和反向引物,所述正向引物具有
SEQ ID NO.2
所示的序列
。
[0011]在某些实施方案中,根据本专利技术所述的引物组合,其中,所述反向引物具有
SEQ ID NO.3
所示的序列
。
[0012]本专利技术的第三方面,提供一种用于鉴定结球甘蓝的试剂盒,其包括上述的引物组合
。
[0013]本专利技术的第四方面,提供本专利技术所述的分子标记
、
所述的引物组合,或所述的试剂盒在结球甘蓝遗传学分析中的应用
。
[0014]在某些实施方案中,根据本专利技术所述的应用,其中,所述遗传学分析包括遗传多样性分析
、
种质鉴定或辅助育种
。
[0015]本专利技术的第五方面,提供一种用于鉴定植物是否包含结球甘蓝的方法,其包括在待鉴定植物的
DNA
中检测是否存在位于
BoACS4
基因上游
2186bp
的分子标记的步骤
。
[0016]在某些实施方案中,根据本专利技术所述的用于鉴定植物是否包含结球甘蓝的方法,其包括以下步骤:
[0017](1)
从待鉴定植物样品中提取样品
DNA
的步骤;
[0018](2)
利用正向引物
、
反向引物通过
PCR
从所述样品
DNA
中扩增含有所述分子标记的核酸的步骤,其中所述正向引物具有
SEQ ID NO.2
所示的序列,所述反向引物具有
SEQ ID NO.3
所示的序列;和
[0019](3)
通过电泳检测样品
PCR
产物的长度来鉴定所述植物
。
[0020]本专利技术基于结球甘蓝和其他甘蓝类蔬菜
BoACS4
基因上的结构变异位点开发出的一种
SV
分子标记,其是结球甘蓝中特异的结构变异,通过对检测甘蓝类蔬菜是否存在该
SV
分子标记,可快速鉴定检测材料是否为结球甘蓝
。
此外,本专利技术还验证了该
SV
分子标记与结球甘蓝的叶球发育具有相关性
。
附图说明
[0021]图1为结球甘蓝和其他甘蓝类蔬菜的示意图
。
[0022]图2示出了具有
SV
的结球甘蓝和没有
SV
的其他材料的区分效果
。
具体实施方式
[0023]现详细说明本专利技术的多种示例性实施方式,该详细说明不应认为是对本专利技术的限制,而应理解为是对本专利技术的某些方面
、
特性和实施方案的更详细的描述
。
[0024]应理解本专利技术中所述的术语仅仅是为描述特别的实施方式,并非用于限制本专利技术
。
另外,对于本专利技术中的数值范围,应理解为具体公开了该范围的上限和下限以及它们之间的每个中间值
。
在任何陈述值或陈述范围内的中间值以及任何其他陈述值或本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.
一种与结球甘蓝叶球发育相关的分子标记,其特征在于,所述分子标记为结构变异分子标记,其位于
BoACS4
基因上游
。2.
根据权利要求1所述的与结球甘蓝叶球发育相关的分子标记,其特征在于,所述分子标记具有
SEQ ID NO.1
所示的序列
。3.
一种引物组合,其特征在于,其用于扩增权利要求1或2所述的分子标记
。4.
根据权利要求3所述的引物组合,其特征在于,包括正向引物和反向引物
。5.
根据权利要求4所述的引物组合,其特征在于,所述正向引物具有
SEQ ID NO.2
所示的序列,所述反向引物具有
SEQ ID NO.3
所示的序列
。6.
一种用于鉴定结球甘蓝的试剂盒,其特征在于,包括权利要求3‑5任一项所述的引物组合
。7.
根据权利要求1或2所述的分子标记
、
权利要求3‑5任一项所述的引物组合,或权利要求6所述的试剂盒在结球甘蓝遗传学分析中的应用
。8.
【专利技术属性】
技术研发人员:季家磊,程锋,吕红豪,张扬勇,李幸,杨丽梅,张磊,王勇,庄木,张亢,唐琪,
申请(专利权)人:中国农业科学院蔬菜花卉研究所,
类型:发明
国别省市:
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