The invention discloses a primer composition for rapid detection of rice false smut fungus LAMP and its application. The primer composition of the invention is composed of the following primers: F3, B3, BIP, FIP, Loop F and Loop B. The primer composition is used for rapid detection of the LAMP of rice rice, which has high specificity and high sensitivity. Therefore, the primer composition described in the present invention can be applied to the detection and / or identification of rice rice Oryza Oryza. It provides a simple, rapid and low cost detection technique for scientific research and production practice. It provides theoretical basis and technical guidance for early warning and rational drug use of rice koji, and has a realistic and far-reaching significance for increasing the ecological and economic benefits.
【技术实现步骤摘要】
一种用于水稻稻曲病病菌LAMP快速检测的引物组合物及其应用
本专利技术涉及农作物病害检测鉴定技术和分子生物学
,具体涉及一种用于水稻稻曲病病菌LAMP快速检测的引物组合物及其应用。
技术介绍
稻曲病(Ustilaginoideavirens)是一种世界性的水稻穗部病害,又称伪黑穗病、绿黑穗病、谷花病、青粉病,俗称“丰产果”。该病只发生于穗部,为害部分谷粒。受稻曲病菌为害的水稻表现为谷粒内形成菌丝块渐膨大,内外颖裂开,露出淡黄色块状物,即孢子座,后包于内外颖两侧,呈黑绿色,初外包一层薄膜,后破裂,散生墨绿色粉末,即病菌的厚垣孢子,有的两侧生黑色扁平菌核,风吹雨打易脱落。河北、长江流域及南方各省稻区时有发生。在我国多个省份均有发生,严重影响我国水稻生产和粮食安全。为了阻止稻曲病传播范围的不断扩大,对其进行快速、准确的检测鉴定尤为重要。近年来随着分子生物学相关技术的发展,基于PCR的方法已经成功用于检测水稻稻曲病病菌,尽管以PCR为基础的分子鉴定方法一定程度上克服了传统形态鉴定上的缺陷,但由于检测需要PCR仪、凝胶电泳和成像系统仪等昂贵的专业仪器设备,同时需要操作人员具有一定的分子生物学专业技能,并且只能在实验室条件下完成,需要较长的时间,检测过程复杂,不能满足快速检测的需求,限制了PCR检测方法在生产中的推广应用。环介导等温扩增技术(Loop‐mediatedisothermalamplification,LAMP)是Notomi等开发的一种恒温扩增方法,该方法针对靶基因的6个位点设计出4条引物,利用一种具有链式置换活性的DNA聚合酶(BstDNApol ...
【技术保护点】
1.一种用于水稻稻曲病病菌LAMP快速检测的引物组合物,其特征在于,由一对外引物F3、B3、一对内引物FIP、BIP和一对环引物Loop F、Loop B组成,所述的F3、B3、FIP、BIP、Loop F和Loop B的核苷酸序列分别如下所示:F3:5'‑GCTCCTGGGATTCTTTGGTG‑3';B3:5'‑GCTCGATCGGGACAACCA‑3';FIP:5'‑TTGTCGCGTTGCAAGGACACGGGCATTCGACTCGGAACAG‑3';BIP:5'‑TTCACTGACATGTGCGCTGACCCGGTTTCGTGGAACGGATT‑3';Loop F:5'‑CGATTACCGTGCGTGTTGGA‑3’Loop B:5'‑TCCGCAGTTGAAAATATGG‑3'。
【技术特征摘要】
1.一种用于水稻稻曲病病菌LAMP快速检测的引物组合物,其特征在于,由一对外引物F3、B3、一对内引物FIP、BIP和一对环引物LoopF、LoopB组成,所述的F3、B3、FIP、BIP、LoopF和LoopB的核苷酸序列分别如下所示:F3:5'-GCTCCTGGGATTCTTTGGTG-3';B3:5'-GCTCGATCGGGACAACCA-3';FIP:5'-TTGTCGCGTTGCAAGGACACGGGCATTCGACTCGGAACAG-3';BIP:5'-TTCACTGACATGTGCGCTGACCCGGTTTCGTGGAACGGATT-3';LoopF:5'-CGATTACCGTGCGTGTTGGA-3’LoopB:5'-TCCGCAGTTGAAAATATGG-3'。2.权利要求1所述的LAMP引物组合物在制备水稻稻曲病病菌检测试剂中的应用。3.权利要求1所述的LAMP引物组合物在检测和/或鉴定水稻稻曲病病菌中的应用。4.一种用于检测水稻稻曲病病菌的...
【专利技术属性】
技术研发人员:陈雨,杨雪,谷春艳,臧昊昱,
申请(专利权)人:安徽省农业科学院植物保护与农产品质量安全研究所,
类型:发明
国别省市:安徽,34
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