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本发明提供一种用于异构集群环境中的自由能微扰计算调度方法，包括以下步骤：步骤A:通过预先构造好的分子/蛋白质等结构和输入文件，先进行npt系综动力学模拟过程，获得平衡态的结构；步骤B:运行基于哈密顿量的副本交换动力学计算，获得足够多的轨迹数...
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