考察含鲤IGF2b基因慢病毒影响鲤鱼体格的聚类方法技术

本发明专利技术提供了一种用于考察含鲤IGF2b基因慢病毒影响鲤鱼体格的聚类方法，属于渔业养殖技术领域。包括如下步骤：第一步、对不同分组的鲤鱼样本注射不同浓度的含有鲤IGF2b基因的慢病毒，养殖；对养殖后的鲤鱼考察体格指标和体重指标，找到对体重指标有显著性影响的体格指标，将筛选得到的体格指标作为特征值进行聚类，考察不同注射量对于体格的影响。该方法可以避免体重指标对体格参数的干扰，从而能判断出含有鲤IGF2b基因的慢病毒注入量对鲤鱼体格指标影响，并且可以解决不同注入量的试验组之间多个指标相互干扰的问题。

【技术实现步骤摘要】
【专利摘要】本专利技术提供了一种用于，属于渔业养殖
。包括如下步骤：第一步、对不同分组的鲤鱼样本注射不同浓度的含有鲤IGF2b基因的慢病毒，养殖；对养殖后的鲤鱼考察体格指标和体重指标，找到对体重指标有显著性影响的体格指标，将筛选得到的体格指标作为特征值进行聚类，考察不同注射量对于体格的影响。该方法可以避免体重指标对体格参数的干扰，从而能判断出含有鲤IGF2b基因的慢病毒注入量对鲤鱼体格指标影响，并且可以解决不同注入量的试验组之间多个指标相互干扰的问题。【专利说明】
本专利技术提供了一种用于，属于渔业养殖
。
技术介绍
在科研试验和技术开发中，常常设置几个处理组，用来确定主要的试验影响因子，影响因子的剂量及影响程度等。这类试验中处理的指标往往不只一个，比如一个营养因素试验中，测定指标有血液指标、基因表达量指标、生长性状指标、免疫学指标等多个方面的指标。然而，对于这方面的数据处理主要通过方差分析和回归分析，而如何确定不同处理组之间对这些指标的综合影响，鲜见报道。以鲤鱼养殖为例，中国专利201210087621.9公开了一种利用含有鲤IGF2b基因的慢病毒来提高鲤鱼产肉量的方法，该方法结果显示:用已检测的含有鲤IGF2b基因的慢病毒感染鲤鱼幼体，3个月后，感染组相比对照组，鲤体重获得了显著增加，同时鲤鱼血液各项指标没有影响，安全性好。但是由于鲤鱼的生长指标不仅有体重，还有其它的例如体长、体高、体厚等，这些体格指标也在实际过程中有着重要的价值，但是这些指标在测量时又会受到体重的影响，导致采用常规的归类、回归等分析方法无法准确考察慢病毒注入量对于体格参数的影响。
技术实现思路
本专利技术的目的是:提供一种可以避免体重指标的干扰而能判断出含有鲤IGF2b基因的慢病毒注入量对鲤鱼体格`指标影响的方法，并且可以解决不同注入量的试验组之间多个指标相互干扰的问题，该方法可以用于通过调整慢病毒注射量来达到筛选不同体格鲤鱼样本的目的。技术方案如下:一种，其特征在于，包括如下步骤:第一步、准备鲤鱼样本，分组；在不同样本组的鲤鱼样本体内注射不同浓度的含有鲤IGF2b基因的慢病毒，养殖；第二步、对养殖后的鲤鱼样本测定以下7个指标:体重、体长、体高、体厚、鱼尾柄长、尾柄厚、背脊前距；第三步、以体重为因变量，以体长、体高、体厚、鱼尾柄长、尾柄厚、背脊前距为参变量，进行回归分析，找到对体重有显著性影响的体格指标；第四步、以第三步得到的对体重有显著性影响的体格指标作为特征值，对不同样本组进行聚类分析，根据不同剂量组的样本被聚类到不同类的结果来考察含鲤IGF2b基因慢病毒对于体格参数的影响。本专利技术中，所述的背脊前距是指鲤吻部到第一根背脊的距离；所述的体格指标是指体长、体高、体厚、鱼尾柄长、尾柄厚、背脊前距。作为本专利技术的优选，第三步中所述的对体重有显著性影响的体格指标是指体长、体厚和尾柄长。作为本专利技术的优选，第三步中所述的回归分析是指线性回归。作为本专利技术的优选，第三步中所述的回归分析中，判定是否具有显著性影响的标准是:相关性分析中当P ( 0.05，则认为是具有显著性影响。本专利技术的实现原理:在鲤鱼样本中注射慢病毒会对体重产生明显的影响，另外又由于体格指标会与体重相关性较大，而 且体重和体长、体高、体厚等存在共线性问题，因此在常规的分析方法中无法测定不同剂量组中注射剂量对于体格的影响；本专利技术通过找到对于体重有明显影响的指标，利用这些筛选出的指标作为特征值，可以避免体重对于体格结果判定的影响，接下来对这些筛选的体格指标作为特征值，对于不同注射剂量的样本进行聚类分析，就可以得到注射剂量是否能够对于体格产生影响。【专利附图】【附图说明】图1是背脊前距测量方法的示意。图2是实施例的第2步中进行聚类分析的结果示意图。图3是实施例的第4步中进行聚类分析的结果示意图。【具体实施方式】1.将鲤鱼样本随机分为5组，每组200尾，根据专利号为201210087621.9的方法进行含鲤IGF2b基因慢病毒的注射，阴性对照不做任何处理，阳性对照制作注射处理，3个处理组的注射剂量分别是10 μ L、20 μ L、40 μ L ;再养殖5个月后，进行第二次数据测量，测量指标为体重、体长、体高、体厚，增加测量鱼尾柄长、尾柄厚，并且首次测量鲤吻部到第一根背脊的距离(命名为背脊前距)，见图1。2.a)，通过软件R 2.14.0的ward方法对所有处理组的7个指标作为特征值进行聚类，聚类图见图2中A部分；b)，再将体重这个指标删除，用剩下的6个体格指标作为特征值进行聚类分析，聚类图见图2中B部分，可以看出，将体重指标删除之后，聚类的结果没有发生变化，这主要是由于体重与体格的多个指标之间存在有共线性的问题，而且一些体格指标对体重的影响较大，导致了保留或者删除掉体重指标对于聚类的结果影响不大。c)根据公知，由于体重和体长、体高、体厚等存在共线性问题，因此，为了解决体重与体格指标相互存在关系而无法分类的问题，将6个体格指标分别除以体重(即将6个体格参数标准化)，这样可以避免由于共线性造成的重复，同时也可以将二者的关系考虑进来，对这6个标准化的体格参数作为特征值进行聚类分析，如图2中C部分所示，可以看出，聚类的结果发生了变化，B部分中是10 μ L和40 μ L先聚为一组，而C部分中是10 μ L和20 μ L先聚为一组，说明体重的标准化处理与否影响到了不同处理组之间的处理效果评估，体重的标准化与否，得到处理效果的聚类评价不同，也就是说该步中的结果并不能真正反映出不同处理组之间确定的处理效果。3.接下来，为了克服体重对于体格指标的影响，需要找到对显著影响体重的指标，采用的是多元逐步回归的方法，通过软件SAS8.0做出3个处理组的多元逐步回归方程，6个指标全部进行了多元逐步回归，但只有3个因子达到显著性水平，分别是:体长、体厚和尾柄长，其它3个指标不具有显著性(显著性的判定标准是P <0.05)。回归方程结果如下:-50.07+0.64x^1.35x2-0.55x3(I):_39.41+0.31x^1.94x2(2):-62.46+0.65x^1.37x2(3)式中，(I)式是表示10 μ L处理组；(2)式是表示20 μ L处理组；(3)式是表示40 μ L处理组。Y表示体重，X1表示体长，X2表示体厚，X3表示尾柄长。4.最后，通过R软件2.14.0对(3)中筛选的指标体长、体厚和尾柄长进行聚类分析，见图3的A和B部分。结果显示，不论体重是否标准化，都难以改变聚类的结果，在此例中，10 μ L和20 μ L处理组先聚为一类,然后再和40 μ L处理组聚为一类,可以说含有IGF2b慢病毒处理鲤鱼，随着处理浓度的增加，在40 μ L处理时，体型发生了改变。综合以上步骤，我们可以得到，此方法从含有IGF2b慢病毒处理鲤试验中，对影响指标进行了聚类，并通过主要指标和非主要指标之间的关系，找出了聚类分析中存在的不足，以及方差分析、相关分析中不能发现的问题，然后通过建立多元逐步回归方差确定了影响体重的显著性因子，通过这些因子的聚类，最终确定了不同处理组的处理效果和它们之间的关联，这就可以避开了体重的干扰而去考察慢病毒注射量对于体格指数的影响。【权利要求】1.一种本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种考察含鲤IGF2b基因慢病毒影响鲤鱼体格的聚类方法，其特征在于，包括如下步骤：第一步、准备鲤鱼样本，分组；在不同样本组的鲤鱼样本体内注射不同浓度的含有鲤IGF2b基因的慢病毒，养殖；第二步、对养殖后的鲤鱼样本测定以下7个指标：体重、体长、体高、体厚、鱼尾柄长、尾柄厚、背脊前距；第三步、以体重为因变量，以体长、体高、体厚、鱼尾柄长、尾柄厚、背脊前距为参变量，进行回归分析，找到对体重有显著性影响的体格指标；第四步、以第三步得到的对体重有显著性影响的体格指标作为特征值，对不同样本组进行聚类分析，根据不同剂量组的样本被聚类到不同类的结果来考察含鲤IGF2b基因慢病毒对于体格参数的影响。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员：苏胜彦，董在杰，袁新华，
申请(专利权)人：中国水产科学研究院淡水渔业研究中心，
类型：发明
国别省市：