基于16S rDNA的细菌核酸指纹特征谱的制备方法及其用途技术

本发明专利技术公开了一种用于细菌16S?rDNA核酸指纹图谱制备的方法，包括PCR扩增、SAP酶消化、转录和核酸酶切、纯化、质谱仪检测等步骤。基于该方法，建立常见细菌的核酸指纹图谱数据库。根据实验产生的质谱峰图，可对待检细菌进行分类与鉴定，结果可广泛运用于细菌分类和鉴定、遗传进化分析、耐药筛选用途以及进出口检验等领域。

【技术实现步骤摘要】

【技术保护点】
一种基于细菌16S?DNA的核酸指纹图谱制备方法。其特征在于，它至少包括如下步骤：（1）PCR反应：使用针对细菌16S?rDNA的PCR通用引物，分别扩增多个细菌的核酸模板，得到含扩增目标区域的PCR产物；（2）SAP酶消化：用碱性磷酸酶（SAP酶）处理步骤（1）得到的PCR产物；（3）转录和核酸酶切：使用特定的转录和内切酶，分别在一个反应体系中，对步骤（2）得到的各个细菌的消化产物进行转录和核酸酶切，获得一系列长度不一、丰度不一的核酸片段；（4）纯化：使用树脂处理步骤（3）得到的酶切产物；（5）质谱仪检测：将步骤（4）得到的纯化产物上点在含有基质的靶片上，上质谱仪进行检测，得到不同细菌的特征核酸指纹谱图。

【技术特征摘要】
...

【专利技术属性】
技术研发人员：张学记，马庆伟，赵洪斌，张海燕，赵艳梅，
申请(专利权)人：向华，
类型：发明
国别省市：