玉米种质抗大斑病QTL的SNP分子标记及其应用制造技术

本发明专利技术涉及分子标记领域，具体地涉及玉米种质抗大斑病QTL的SNP分子标记及其应用。根据本发明专利技术的玉米种质抗大斑病QTL的SNP分子标记为：PZE-109053835PZE-103102855SYN12735SYN18302SYN30756PZE-103171599SYN30351PZE-104141072PZE-108071872PZE-110066840。上述SNP分子标记可以用于抗玉米大斑病的早期预测和筛选，还可以用于抗玉米大斑病型玉米的选育。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及分子标记领域，具体地涉及玉米种质抗大斑病QTL的SNP分子标记及其应用。
技术介绍
玉米作为C4植物的代表，光合作用效率高，在常见农作物中单产最高，被称为谷物之王，是世界和我国播种面积第一的作物。然而，随着玉米需求一步增加，耕地在减少，气候有进一步恶化的趋势；而全球人口以每年一亿人的速度爆炸式增长，能新开发的耕地极其有限，玉米供需关系很可能进一步趋紧。近几十年来，农业发达国家如美国的玉米育种发展极快，美国的玉米平均亩产为我国的近两倍，其中良种的贡献估计为百分之五十以上。先锋公司的品种先玉335等以其高产、优质等特性在我国春玉米区彻底击败国内所有品种，使美国种质成为东北地区的主要玉米种质。玉米大斑病为病原菌引起，是玉米的一种主要疾病，在全球玉米种植区域内发生。近年来在我国东北春玉米主产区发病率大幅上升，但先玉335等不抗大斑病，成为玉米产量的主要影响原因之一。所以用美国的高产、优质且抗大斑病种质改良适应东北地区的先玉335等玉米种质，建立抗大斑病、高产、优质且适应当地环境的种系是保障我国粮食安全的当务之急。近年来，随着玉米B73自交系全基因组测序的完成和高通量DNA测序技术的突飞猛进，国内外科学家已经成功地完成了许多玉米自交系的重测序。大量的玉米SNP分子标记被发现，相应的高通量玉米指纹芯片已被商业化。McMullen等运用高通量玉米指纹芯片和巢式关联作图(Nested Association Mapping),精确定位了玉米花期及叶片角度的主效QTL0严建兵等用全基因组扫描( GWS)定位了玉米油相关的主效QTL。虽然Poland等于2 011年用巢式关联作图精确定位一些抗大斑病QTL,但他们使用的主要是热带玉米资源，回交导入温带商业种质资源时，是否有效难以确定，即使有效，连锁的不利近等位基因需多代回交才能删除。本专利技术直接利用大量美国温带商业玉米自交系，使用全基因组扫描精确定位温带商业玉米群内的抗大斑病QTL并将其用于改良适应东北的美国商业玉米种质，则可成功解决以上难题。
技术实现思路
本专利技术的目的是提供玉米种质抗大斑病QTL的SNP分子标记。本专利技术的再一目的是提供上述玉米种质抗大斑病QTL的SNP分子标记的应用。根据本专利技术的玉米种质抗大斑病QTL的SNP分子标记为:PZE-109053835PZE-103102855SYN12735SYN18302SYN30756PZE-103171599SYN30351PZE-104141072PZE-108071872PZE-110066840。根据本专利技术的具体实施方式,上述玉米种质抗大斑病QTL的SNP分子标记通过包括以下步骤的方法获得:(I)以115个美国玉米自交系，检索美国农业部种质资源信息中心所有专利过期自交系的性状信息，有大斑病抗性记录的共有115个自交系，经试验鉴定，其中感大斑病的有64个自交系，抗大斑病的51个自交系；(2)使用Illumina公司开发的玉米Infinium50K高密度商业芯片(该芯片覆盖了遍布玉米全基因组的5万6千个SNP位点)测量115个玉米自交系的高密度指纹，使用TASSEL软件http://ww w.maizegenetics.net/index.php option=com content&task=view&id=89&Itemid=119对测得的115个自交系的高密度指纹进行了聚类分析;(3)玉米抗大斑病主效QTL的全基因组扫描(GWAS)定位，对步骤(I)所得的玉米抗大斑病性状结果和步骤(2)所得的基因型数据，使用TASSEL中的MLM算法进行了分析，检测到抗病相关QTL。(4)选取10个互不连锁的QTL，发现以下SNP位点与抗玉米大斑病有关，PZE-109053835PZE-103102855SYN12735SYN18302SYN30756PZE-103171599SYN30351PZE-104141072PZE-108071872PZE-110066840以上10个SNP位点详细信息如以下表I所示。表I本文档来自技高网...

【技术保护点】
玉米种质抗大斑病QTL的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记为：PZE?109053835PZE?103102855SYN12735SYN18302SYN30756PZE?103171599SYN30351PZE?104141072PZE?108071872PZE?110066840。

【技术特征摘要】
1.玉米种质抗大斑病QTL的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记为: PZE-109053835PZE-103102855SYN12735SYN18302SYN30756PZE-103171599SYN30351PZE-104141072PZE-108071872PZE-1100668402.根据权利要求1所述的玉米种质抗大斑病QTL的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP标记的等位基因位点如下 所示: PZE-109053835 C PZE-103102855 C SYN12735A SYN18302G SYN30756T PZE-103171599 T SYN30351G PZE-104141072 G PZE-108071872 G PZE-110066840 C3.—种获得玉米种质抗大斑病QTL的SNP分子标记的方法，其特征在于，所述方法包括步骤: (1)以115个大斑病抗性记录的美国玉米自交系作为材料，经试验鉴定，其中感大斑病的有64个自交系，抗大斑病的51个自交系； (2)使用Illumina公司开发的玉...

【专利技术属性】
技术研发人员：李平，关义新，巫永春，程仑，刘依群，汪保华，
申请(专利权)人：南通新禾生物技术有限公司，
类型：发明
国别省市：