邻居粒子对搜索、分子动力学计算方法及众核处理系统技术方案

技术编号:8366835 阅读:174 留言:0更新日期:2013-02-28 05:36
本发明专利技术提供一种邻居粒子对搜索方法,适用于配置成执行分子动力学计算的众核处理系统;该方法包括:分别以各粒子作为主粒子来建立各粒子的邻居粒子对;其中,对于各主粒子,均在其所处计算区域内的其余粒子中确定该主粒子的邻粒子;从而在各计算区域内建立该计算区域内所有粒子的邻居粒子对信息。本发明专利技术还提供一种采用该邻居粒子对搜索方法的分子动力学计算方法及其众核处理系统,本发明专利技术针对邻粒子所处不同区域进行区分的邻居搜索方法,从而有利于根据邻粒子所处的区域采用不同的计算方式,充分发挥众核处理系统的从核处理能力。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及数据处理领域,特别涉及面向众核处理器的邻居粒子对搜索、分子动力学计算方法及应用该方法的众核处理系统。
技术介绍
近年来多核设计逐渐成为高性能发展的趋势和学术研究的热点。多核处理器按照集成方式可以分为同构多核处理器和异构多核处理器。同构多核处理器在一个芯片内集成了多个同构的处理器核,所有处理器核都运行完整的操作系统,面向相同的工作负载。因此,基于同构处理器的程序其设计实现相对简单。目前这一类处理器已经全面推向市场。异构多核处理器在结构设计上与同构多核处理器相比具有完全不同的特性。异构多核处理器的一个芯片内集成了多个异构的处理器核,包括少数功能完备的处理器核,称之为主处理器核(又称主核,如Cell中的PPE,Godson中的Sync Node),主要完成控制密集的操作;以及大量功能受限的核心,我们称之为从处理器核(又称从核,如Cell中的SPE,Godson中的Tile Node),主要完成数据密集的操作。—般来说,一个主核和多个从核构成一个核组,多个核组构成一个完整的芯片。由于完整处理器核的逻辑复杂,受生产工艺的限制同构多核处理器能够集成的处理器核较少(一般为数十个),本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种邻居粒子对搜索方法,适用于配置成执行分子动力学计算的众核处理系统;其特征在于,该方法包括:分别以各粒子作为主粒子来建立各粒子的邻居粒子对;其中,对于各主粒子,均在其所处计算区域内的其余粒子中确定该主粒子的邻粒子;从而在各计算区域内建立该计算区域内所有粒子的邻居粒子对信息。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:张军刘桂英倪颖杰李祖华马飞李弢
申请(专利权)人:无锡江南计算技术研究所
类型:发明
国别省市:

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