一种DNA序列的可视化方法技术

本发明专利技术通过对Spectral模型的改进，提出一种二维空间的光谱可视化改进模型，用来表示一串DNA序列，特点是能够避免信息丢失，清晰直观，便于多条DNA序列的比较。DNA序列可视化图形使用计算机绘制，其中包含A,G,T,C四条平行线，并将其周期化显示。根据DNA序列出现的顺序通过跳转规则依次在图中标记连接成折线图，实现DNA序列的可视化。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种基因序列的可视化表示方法，属于生物信息学领域。
技术介绍
DNA序列由A (腺嘌呤)，T (胸腺嘧啶)，G (鸟嘌呤)，C (胞嘧啶)四个核苷酸组成。DNA数据可以以字符的形式储存于电脑中。这种方式虽便于保存，但是却不易于人们的观察。因此开发一种辅助工具来帮助观察和分析DNA数据并从中挖掘有价值的信息，具有重要的实际意义。 自第一个DNA序列可视化模型提出以来，DNA序列可视化技术蓬勃发展，大量学者做出了巨大努力和贡献，但是在同一模型中同时解决以下五个问题是相当困难的，分别是信息丢失问题，在高维空间难以观察的问题，退化问题，长DNA序列在二维空间难以观察的问题，需要反映有用信息的问题。因此，为解决以上问题，实现肉眼观察和分析DNA数据，亟待开发新型DNA序列可视化方法。
技术实现思路
本专利技术的目的本专利技术是一种改进的DNA序列可视化光谱模型，该模型将A，G, T, C四条平行线周期化显示，根据DNA序列出现的顺序通过跳转规则依次在图中标记连接成折线图，实现DNA序列的可视化。本专利技术提出的方法可以解决原有DNA序列可视化模型的退化问题，信息丢失问题，长DNA序本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种DNA序列可视化的方法，所述方法包括 等距离的画出四条平行线。2.复制A，G，T，C四条平行线，使其周期化。3.按照DNA序列中的核苷酸顺序，依照跳转规则在相应平行线上做标记。4.以直线连接相邻的点得到DNA序列表示图。5.如权利要求I所述的可视化方法，其中，四条平行线按A，G,T, C的顺序来标注。6.如权利要求I所述的可视化方法，其中，复制四条平行线，并在平面空间中的Y轴方向进行扩展，使其周期化。7.如权利要求I所述的可视化方法，其中，跳转规则是当一段DNA序列的核苷酸数量大于等于10时，...

【专利技术属性】
技术研发人员：曾湘祥，
申请(专利权)人：常熟市支塘镇新盛技术咨询服务有限公司，
类型：发明
国别省市：