本发明专利技术公开了一种用于在包含一个或多个核酸序列的样品中检测一种靶核苷酸序列的存在、不存在和/或量的盒体。所述盒体包含一个通用部件以及一或多个分离的应用特异性部件，所述应用特异性部件可以连接至所述通用部件。本发明专利技术还公开了一种在包含一个或多个核酸序列的样品中检测一种靶核苷酸序列的存在、不存在和/或量的系统。这个系统包含一个可重复使用的仪器，其中所述仪器设置为容纳一个盒体并控制在所述盒体中的样品中检测一种靶核苷酸序列的存在、不存在和/或量的过程。
【技术实现步骤摘要】
本申请为2007年12月21日提交的申请号为20068002M23. 7标题为“”的申请的分案申请。本专利技术涉及一种用于检测特定DNA或RNA序列的存在、不存在或量的盒体 (cartridge)。本专利技术还涉及一种用于检测特定DNA或RNA序列的存在、不存在或量的、任选地具有一个盒体的系统的应用。从发现DNA以来，涉及检测样品中特定DNA或RNA序列的存在、不存在或量的技术已经发生了巨大的飞跃。特别是PCR(聚合酶链反应)已经为开发所有类型的用于检测DNA 或RNA序列的存在或不存在的测试做出了巨大的贡献。目前，已经可以从生物体中收集含有DNA的样品并确定其中某些特定DNA序列(靶序列)的存在、不存在或量。已有同时针对多个靶序列进行这种分析的技术，称为靶序列多元检测(multiplex detection of target sequences),从而提高通量。目前，这种类型的分析还不能常规进行，例如在糖尿病情况下测量血糖含量。通常，需要设备非常好的实验室，并且采用小心翼翼的方案以避免交叉污染并确保获得的结果是可靠的，即将测定的假阳性或假阴性读数最小化。然而，由于许多手工工作要求受过充分训练和指导的人员，因此在本领域仍需克服现有DNA或RNA分析方法中的上述缺点。特别是已知RNA分析是非常困难的，这是因为在空气中和熟练的分析者手上存在的微量RNA 导致污染非常容易发生。另外，现有分析方法不仅耗力，它们还非常耗时。典型地，常规DNA 或RNA分析的一个有效过程需要大约6小时，这是由于例如在各种系统之间取样所进行的全部操作、从样品中分离DNA或RNA、为了分析样品中的靶序列的存在、不存在或量进行的后续测定、处理获得的任何结果以及对所述结果进行相应解释所导致的。之前已经公开了用于检测DNA的基于盒体的系统。例如US 5，882，903公开了一种用于检测DNA的系统。所述系统包含具有一或多个反应腔的第一组件(assembly)和包含多个液体腔(fluid chamber)的第二组件。所述液体腔中每一个容纳在检测DNA时使用的液体。这些液体包括漂洗液、裂解液、以及含有扩增缓冲液和适当引物的扩增溶液。所述反应腔用于进行所述检测的不同步骤，例如漂洗、裂解和扩增。本领域已知的用于检测DNA的其他基于盒体的系统例如公开于US 5，585，069,US 6，168，948 和 W097/27324。已知的基于盒体的系统的一个缺点是这些系统的盒体被设计为一个单一体 (single body)。已知的盒体不能根据希望使用所述盒体的应用提供任何可变性，所述应用例如用所述系统检测特异细菌或针对将要在所述盒体中引入的不同类型的样品。本专利技术的一个目的是为检测样品中靶核苷酸序列的存在、不存在或量提供一种盒体，并提供这种盒体更为灵活的应用。这个目的通过权利要求1中的盒体实现。通过提供可用于广泛应用的通用部件(generic part)和为了用于特定应用而特别设计的一或多个应用特异性部件(application-specific part)，所述盒体可以基于其将被使用的特定应用而组装。所述通用部件可以典型地包含液体操作装置(means)例如泵和阀、其应用可以与所述盒体的应用无关的多个处理腔、以及用于不同液体如裂解和漂洗缓冲液的液体贮存和废物收集室。所述盒体的这些部件将在下文进行更为详细的描述。在一个实施方案中，所述一或多个特异性部件中的一个是具有一或多个热循环腔的PCR体(PCR body)，并含有多个引物。所述盒体可用于不同组的细菌/抗性。通过提供含有多个引物的不同PCR体，可以基于使用所述盒体的应用而选择应用特异性PCR体。例如含有引物的PCR体可基于待检测的细菌/抗性组而选择，所述选择可以特异性地针对特定测试或针对特定地区例如欧洲、亚洲或非洲。还可以基于待检测的细菌/抗性而选择热循环腔的大小或数目。在一个优选的实施方案中所述热循环腔仅用于热循环步骤。在这个实施方案中，所述处理腔特别是引物不受在所述盒体中进行的任何其他步骤的影响。在一个实施方案中，有两个或更多个热循环腔。在每一个热循环腔中可以引入一定量的处理液，其使得可以进行有效的平行处理。在一个实施方案中，在所述一或多个热循环腔中的每一个内放置一个引物。通过将引物放置在所述一或多个热循环腔中，所述引物不需要在进行热循环步骤开始前被转移。通过这种方式可以更有效地使用所述引物。另外，这使得可以更简单地设计所述PCR 体。在一个实施方案中，引物被点样在所述PCR体上。所述点样可以通过任何已知的点样技术例如喷墨打印进行。优选地，在所述一或多个热循环腔中提供所述被点样的引物， 但是它们也可以在任何其他适当的位置例如在引导样品进入所述一或多个热循环腔的入口通道中。在一个实施方案中，所述一或多个应用特异性部件中的一个是一个检测设备 (device)。可以使用一些不同的检测方法在DNA/RNA扩增之后检测样品中的扩增子。这些检测方法可以包括光学、电化学、磁性毛细管(magnetic capillary)和凝胶电泳检测方法。 根据针对一个特定样品所要使用的检测方法，可以选择所述检测设备或其至少一部分并连接至所述盒体的所述通用部件。在一个实施方案中，基于为了检测特定细菌/抗性而使用的PCR体选择所述检测设备。特定检测方法典型地与要检测的特异性细菌/抗性相关，并从而与在所述检测方法中使用的引物相关。由此，含有引物的PCR体与检测设备可作为一对选择，即在选择PCR体时也选择检测设备。也可以仅仅所述检测设备的一个特定部分例如底物和/或底物容器是特异性针对检测特定DNA/RNA的。因此意味着所述应用特异性检测设备可以仅仅是在所述盒体中为了使检测特定DNA/RNA成为可能而使用的实际检测系统的一部分。在本专利技术的一个实施方案中，所述一或多个应用特异性部件中的一个是样品导入设备。基于所需样品的量、样品类型、其提供时的状态，可用不同的样品导入设备将样品导入所述盒体中。样品导入设备的应用进一步提供了与所述盒体的容易及安全的连接，并由此容易及可靠地将样品导入所述盒体中。在一个实施方案中，所述样品导入设备是一个预裂解(pre-lysis)设备，其设置为将样品制备为一种特定状态。所述盒体的通用部件被设计为在特定样品状态例如液态下处理样品。预裂解设备可将样品从其可得的但不能在所述盒体中使用的特定状态处理为所述盒体被设计的可以处理其的状态。这种状态可以是干燥后的液体、存在于固体容器中的液体等等。预裂解中的过程可以在所述预裂解设备与所述通用部件连接之前进行，也可以在这一连接已经建立之后进行。在一个实施方案中，所述一或多个应用特异性部件中的至少一个具有识别设备。 为了避免在选择应用特异性部件中出现错误，对所述应用特异性部件进行识别是有用的， 从而可以容易地检查是否正确的应用特异性部件或一组部件与所述通用部件组合。这种识别设备可以包括标签、条形码、色码、磁性码等等。优选地，使用自动识别系统例如RF标签识别系统。也可以使用更加先进的识别设备追踪所述通用部件和/或应用特异性部件的位置历史。例如一个特定应用特异性部件被冷却可能是重要的。通过使用位置历史追踪系统，可以检查是否所述应用特异性部件尚未离开冷却设备太长时间。在一个优选的本文档来自技高网...
【技术保护点】
１．一种用于在包含一个或多个核酸序列的样品中检测靶核苷酸序列的存在、不存在和／或量的盒体，特征在于所述盒体包含一个通用部件以及一或多个分离的应用特异性部件，所述应用特异性部件可以连接至所述通用部件，并且其中所述一或多个应用特异性部件中的至少一个可由卡扣配合连接而连接到主体上。
【技术特征摘要】
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【专利技术属性】
技术研发人员：C·范哈格，M·J·容格里乌斯，D·G·A·谢弗，A·W·D·M·范登·比加特，R·C·德·吉尔，M·德容，G·普罗斯，J·巴赫尔，A·博斯，G·吕德克，JP·泽埃尔，
申请(专利权)人：拜欧卡蒂斯股份公司，
类型：发明
国别省市：CH
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