【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于微生物检测,具体而言,涉及一种基于医院本地化微生物mngs平台的金黄色葡萄球菌mlst分型的引物组及方法。
技术介绍
1、院内感染也称为医院获得性感染,是指患者在医院接受治疗或护理期间感染引发的疾病。医院应积极采取措施预防和控制院内感染的发生,以保障患者的健康安全。其中,早发现、早处理是关键环节,只有及时识别感染迹象并迅速采取有效措施,才能最大程度地减少感染对患者的影响,防止其进一步扩散。为了判定是否发生院内感染,需要对细菌进行“分型”,根据细菌是否为同样的型别来判断是否出现院内感染事件,为后续的隔离、溯源等措施提供依据。
2、目前,用于微生物分型的方法有多种,主要包括:脉冲场凝胶电泳(pulsed-fieldgel electrophoresis,pfge)、多位点序列分型(multilocus sequence typing,mlst)和全基因组测序(wgs,whole genome sequencing)等。其中,mlst 技术具有精度高、标准统一等优点,是目前比较常用的方法。mlst是基于多个保守基因位
...【技术保护点】
1.一种基于医院本地化微生物mNGS平台的金黄色葡萄球菌MLST分型的引物组,其特征在于,包括扩增yqiL基因的引物对、扩增pta基因的引物对、扩增tpi基因的引物对、扩增gmk基因的引物对、扩增glpF基因的引物对、扩增aroE基因的引物对以及扩增arcC基因的引物对;
2.一种基于医院本地化微生物mNGS平台的金黄色葡萄球菌MLST分型的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1所述的引物组,且各引物的浓度各自独立的为10 µM。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括2X TaqMan FastqPCR Maste
...【技术特征摘要】
1.一种基于医院本地化微生物mngs平台的金黄色葡萄球菌mlst分型的引物组,其特征在于,包括扩增yqil基因的引物对、扩增pta基因的引物对、扩增tpi基因的引物对、扩增gmk基因的引物对、扩增glpf基因的引物对、扩增aroe基因的引物对以及扩增arcc基因的引物对;
2.一种基于医院本地化微生物mngs平台的金黄色葡萄球菌mlst分型的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1所述的引物组,且各引物的浓度各自独立的为10 µm。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括2x taqman fastqpcr master mix。
4.权利要求1所述引物组或权利要求2或3所述试剂盒在金黄色葡萄球菌mlst分型的金黄色葡萄球菌mngs测序建库中的应用。
5.一种金黄色葡萄球菌mlst分型的mngs测序建库方法,其特征在于,包括以下步骤:
6.根据权利要求5所述的方法...
【专利技术属性】
技术研发人员:刘畅,周万青,孟玲宁,李佳,王世聪,
申请(专利权)人:南京鼓楼医院,
类型:发明
国别省市:
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