一种基于医院本地化微生物mNGS平台的金黄色葡萄球菌MLST分型的引物组及方法技术

技术编号:46627195 阅读:1 留言:0更新日期:2025-10-14 21:24
本发明专利技术属于微生物检测技术领域,具体而言,涉及一种基于医院本地化微生物mNGS平台的金黄色葡萄球菌MLST分型的引物组及方法。所述的引物组包括扩增yqiL基因、pta基因、tpi基因、gmk基因、glpF基因、aroE基因以及arcC基因的引物对,对应的核苷酸序列如SEQ ID NO:1~14所示。本发明专利技术根据医院内二代测序平台短测序读长(50 bp)、单端测序的技术特点,重新设计了用于金黄色葡萄球菌MLST管家基因扩增引物组,通过优化扩增子长度和位置,使扩增子适配于医院现有的二代测序平台测序工作原理。利用本发明专利技术的引物组、试剂盒或方法能够快速(24小时内)、准确地判定院内感染病原菌之间的亲缘关系,显著提升感染防控的时效性和科学性,具有广阔的临床应用前景。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于微生物检测,具体而言,涉及一种基于医院本地化微生物mngs平台的金黄色葡萄球菌mlst分型的引物组及方法。


技术介绍

1、院内感染也称为医院获得性感染,是指患者在医院接受治疗或护理期间感染引发的疾病。医院应积极采取措施预防和控制院内感染的发生,以保障患者的健康安全。其中,早发现、早处理是关键环节,只有及时识别感染迹象并迅速采取有效措施,才能最大程度地减少感染对患者的影响,防止其进一步扩散。为了判定是否发生院内感染,需要对细菌进行“分型”,根据细菌是否为同样的型别来判断是否出现院内感染事件,为后续的隔离、溯源等措施提供依据。

2、目前,用于微生物分型的方法有多种,主要包括:脉冲场凝胶电泳(pulsed-fieldgel electrophoresis,pfge)、多位点序列分型(multilocus sequence typing,mlst)和全基因组测序(wgs,whole genome sequencing)等。其中,mlst 技术具有精度高、标准统一等优点,是目前比较常用的方法。mlst是基于多个保守基因位点的核酸序列进行分型本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基于医院本地化微生物mNGS平台的金黄色葡萄球菌MLST分型的引物组,其特征在于,包括扩增yqiL基因的引物对、扩增pta基因的引物对、扩增tpi基因的引物对、扩增gmk基因的引物对、扩增glpF基因的引物对、扩增aroE基因的引物对以及扩增arcC基因的引物对;

2.一种基于医院本地化微生物mNGS平台的金黄色葡萄球菌MLST分型的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1所述的引物组,且各引物的浓度各自独立的为10 µM。

3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括2X TaqMan FastqPCR Master Mix。

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【技术特征摘要】

1.一种基于医院本地化微生物mngs平台的金黄色葡萄球菌mlst分型的引物组,其特征在于,包括扩增yqil基因的引物对、扩增pta基因的引物对、扩增tpi基因的引物对、扩增gmk基因的引物对、扩增glpf基因的引物对、扩增aroe基因的引物对以及扩增arcc基因的引物对;

2.一种基于医院本地化微生物mngs平台的金黄色葡萄球菌mlst分型的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1所述的引物组,且各引物的浓度各自独立的为10 µm。

3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括2x taqman fastqpcr master mix。

4.权利要求1所述引物组或权利要求2或3所述试剂盒在金黄色葡萄球菌mlst分型的金黄色葡萄球菌mngs测序建库中的应用。

5.一种金黄色葡萄球菌mlst分型的mngs测序建库方法,其特征在于,包括以下步骤:

6.根据权利要求5所述的方法...

【专利技术属性】
技术研发人员:刘畅周万青孟玲宁李佳王世聪
申请(专利权)人:南京鼓楼医院
类型:发明
国别省市:

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