【技术实现步骤摘要】
技术介绍
1、对象组织内的细胞由于不同细胞内的不同分析物水平(例如，基因和/或蛋白质表达)而在细胞形态和/或功能上存在差异。细胞在组织内的特定位置(例如，细胞相对于邻近细胞的位置或细胞相对于组织微环境的位置)可以影响，例如，细胞的形态、分化、命运、活力、增殖、行为以及与组织中其他细胞的信号传导和串扰。
2、空间异质性先前已被研究过，所述研究使用的技术仅提供完整组织或部分组织接触中的少量分析物的数据，或提供单细胞的大量分析物数据，但无法提供有关单细胞在母体生物样品(例如，组织样品)中位置的信息。
3、染色质结构在生物样品中的细胞之间或来自同一组织的生物样品之间可能不同。分析可及染色质中的差异可以指示特定细胞中转录活性序列，例如基因。进一步了解染色质内的转录活性区域将有助于鉴定哪些基因对细胞的功能和/或表型有贡献。
技术实现思路
1、本专利技术一般描述用于在空间上分析存在于生物样品中的基因组dna的方法。在一个方面，所述方法包括提供具有多个捕获探针的阵列，使得所述多个...
【技术保护点】
1.一种用于空间鉴定组织切片中的细胞或细胞核的方法，所述方法包括：
2.如权利要求1所述的方法，还包括将与所述空间捕获探针的捕获域互补的序列与所述细胞捕获探针的捕获域杂交。
3.如权利要求2所述的方法，还包括使用所述空间捕获探针作为模版延伸所述细胞捕获探针。
4.如权利要求2或3所述的方法，还包括使用所述细胞捕获探针作为模版延伸所述空间捕获探针。
5.如权利要求1-4中任一项所述的方法，还包括确定：(i)所述空间条形码的序列或其互补物和(ii)所述细胞条形码的序列或其互补物。
6.如权利要求5所述的方法，其中...
【技术特征摘要】
1.一种用于空间鉴定组织切片中的细胞或细胞核的方法，所述方法包括：
2.如权利要求1所述的方法，还包括将与所述空间捕获探针的捕获域互补的序列与所述细胞捕获探针的捕获域杂交。
3.如权利要求2所述的方法，还包括使用所述空间捕获探针作为模版延伸所述细胞捕获探针。
4.如权利要求2或3所述的方法，还包括使用所述细胞捕获探针作为模版延伸所述空间捕获探针。
5.如权利要求1-4中任一项所述的方法，还包括确定：(i)所述空间条形码的序列或其互补物和(ii)所述细胞条形码的序列或其互补物。
6.如权利要求5所述的方法，其中所述确定包括测序。
7.如权利要求1-6中任一项所述的方法，其中所述空间捕获探针耦合到珠。
8.如权利要求1-7中任一项所述的方法，其中所述细胞捕获探针耦合到珠。
9.如权利要求8所述的方法，其中所述珠还包括其它捕获探针，其中所述其它捕获探针包括：(1)所述细胞条形码的序列；和(2)多聚(t)捕获域。
10.如权利要求9所述的方法，还包括将来自所述细胞或细胞核的核酸分析物与所述多聚(t)捕获域杂交。
11.如权利要求10所述的方法，其中所述核酸分析物是rna分子。
12.如权利要求10所述的方法，其中所述核酸分析物是dna分子。
13.如权利要求10-12中任一项所述的方法，还包括使用所述核酸分析物作为模版延伸所述其它捕获探针。
14.如权利要求13所述的方法，还包括从所述其它捕获探针释放所述核酸分析物。
15.如权利要求13所述的方法，还包括确定：(i)所述细胞条形码的序列或其互补物和(i)所述核酸分析物的序列或其互补物。
16.如权利要求15所述的方法，其中所述确定包括测序。
17.如权利要求1-16中任一项所述的方法，其中所述空间捕获探针还包括裂解域，并且(b)中将所述空间捕获探针纳入细胞或细胞核...
【专利技术属性】
技术研发人员：M·施那尔拉文，M·Y·鲁希罗，T·S·米克尔森，P·斯托尔，J·弗里森，M·马克伦德，E·罗棱斯波巴迪拉，E·P·拉马察朱安伊也，L·弗兰茨，A·M·滕托利，R·巴得瓦，
申请(专利权)人：一零X基因组学股份有限公司，
类型：发明
国别省市：
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