一种虹鳟全基因组SNP分子标记组合、液相育种芯片及其应用制造技术

技术编号:46592342 阅读:0 留言:0更新日期:2025-10-10 21:26
本发明专利技术属于基因芯片技术与鱼类分子育种技术领域,涉及一种虹鳟全基因组SNP分子标记组合、液相育种芯片及其应用。本发明专利技术构建了一种具有50K位点密度的虹鳟SNP液相育种芯片,该芯片包括由51508个SNP分子标记组成的虹鳟全基因组SNP分子标记组合。该液相育种芯片的标记密度高、自动化适配性强,可支持高通量检测;此外,本发明专利技术还提高了该芯片在不同遗传背景虹鳟群体中的适用性与通用性,使其能够广泛应用于国内外虹鳟的种质资源鉴定、遗传多样性评估、全基因组选择育种、全基因组关联分析和遗传图谱构建等多方面研究工作的需求,满足虹鳟跨区域育种和精准选育的技术需求。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于基因芯片技术与鱼类分子育种,具体涉及一种虹鳟全基因组snp分子标记组合、液相育种芯片及其应用。


技术介绍

1、虹鳟(oncorhynchus mykiss)凭借其优异的生长速度、卓越的肌肉品质,已成为世界冷水养殖鱼类的代表性品种。近年来,我国在工厂化循环水养殖设施和大型钢结构深远海养殖网箱的设计与建造取得关键技术突破,为海水养殖虹鳟产业规模化发展提供了装备基础。然而,目前我国虹鳟养殖产业的苗种大多依赖于美国、加拿大、丹麦和挪威等西方国家,其优质苗种均以“全雌”或“三倍体”的形式出售,种源被严格控制,很大程度上制约着我国鲑鳟鱼类海水养殖产业的规模化发展。因此,如何利用高效的现代分子育种技术和工具快速培育优质的虹鳟苗种,成为突破我国鲑鳟鱼类良种匮乏难题的关键。

2、基因组选择育种是一种利用覆盖全基因组的高密度标记进行遗传选育的新方法,具有周期短、准确性高等优势,目前已被应用至许多重要水产经济物种的良种选育研究工作,其选育效果远优于传统的群体选育和家系选育技术。鲑鳟鱼类由于经历了特异性的第四次全基因组复制事件,导致其基因组大小约为普通硬本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种虹鳟全基因组SNP分子标记组合,其特征在于,所述SNP分子标记组合包含51508个SNP分子标记,所述SNP分子标记的位点信息在虹鳟参考基因组USDA_OmykA_1.1的位置如表1所示。

2.一种虹鳟全基因组SNP靶向捕获探针组,其特征在于,所述探针组的探针是根据权利要求1所述的SNP分子标记合成的5’端带有生物素基团修饰的DNA核甘酸序列;

3.一种虹鳟SNP液相育种芯片,其特征在于,包括权利要求1所述的SNP分子标记组合。

4.根据权利要求3所述的虹鳟SNP液相育种芯片,其特征在于,所述的液相育种芯片负载有权利要求2所述的探针组。

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【技术特征摘要】

1.一种虹鳟全基因组snp分子标记组合,其特征在于,所述snp分子标记组合包含51508个snp分子标记,所述snp分子标记的位点信息在虹鳟参考基因组usda_omyka_1.1的位置如表1所示。

2.一种虹鳟全基因组snp靶向捕获探针组,其特征在于,所述探针组的探针是根据权利要求1所述的snp分子标记合成的5’端带有生物素基团修饰的dna核甘酸序列;

3.一种虹鳟snp液相育种芯片,其特征在于,包括...

【专利技术属性】
技术研发人员:田源高勤峰姜文鑫何景鸿于弋甯汤庆凯田建国陈利国孟祥科牛慧琴曹明月唐顺学
申请(专利权)人:中国海洋大学
类型:发明
国别省市:

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