一种不等深度HRD和HRR基因杂交捕获探针组合物及其制备方法和应用技术

本发明专利技术公开了一种不等深度HRD和HRR基因杂交捕获探针组合物及其制备方法和应用，属于分子生物技术领域。本发明专利技术不等深度HRD和HRR基因杂交捕获探针组合物的制备方法包括：将链霉亲和素溶液与靶向HRD区域探针组混合，孵育，得混合液；将所述混合液与靶向HRR基因探针组混合，得不等深度HRD和HRR基因杂交捕获探针组合物；所述靶向HRD区域探针组中每条探针与链霉亲和素的比例为1.6fmol：0.1～1μg。本发明专利技术利用链霉亲和素选择性封闭部分靶向HRD区域探针组中的探针，再和靶向HRR基因探针组混合，在无需物理分隔的条件下，达到两个区域不等深度测序的目的，相比分管杂交捕获成本降低50％。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于分子生物，尤其涉及一种不等深度hrd和hrr基因杂交捕获探针组合物及其制备方法和应用。

技术介绍

1、hrr基因突变和hrd两种生物标志物的分析对平均有效测序深度有不同的需求：为保证hrr基因突变检测的灵敏度，需要较高的测序深度；而hrd是通过对全基因组范围的snp位点(通常是均匀间隔一个距离来选择)分型，可以检测到杂合性缺失(loh)、端粒等位不平衡(tai)和大片段迁移(lst)事件，利用这些数据通过特定算法计算出一个综合的hrd评分来判断hrd状态，只需要较低测序深度即可。

2、针对hrr基因和hrd区域测序深度需求的不同，现有hrr基因和hrd区域不等深杂交捕获主要通过以下两种方式进行：一种是以一定物质的量比例混合靶向hrr基因和hrd区域的探针，hrd区域测序深度低则探针物质的量占比低，hrr基因区域测序深度高则探针物质的量占比高。另一种则是将hrr基因和hrd区域的探针分别进行杂交捕获反应，然后各自进行不同深度的测序，hrr基因区域测序深度高，hrd区域测序深度低。此两种方法各有缺点，第一种方法由于hrr基因和hrd区本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.不等深度HRD和HRR基因杂交捕获探针组合物的制备方法，其特征在于，所述制备方法包括：将链霉亲和素溶液与靶向HRD区域探针组混合，孵育，得混合液；将所述混合液与靶向HRR基因探针组混合，得不等深度HRD和HRR基因杂交捕获探针组合物；所述靶向HRD区域探针组中每条探针与链霉亲和素的混合比例为1.6fmol：0.1～1μg。

2.根据权利要求1所述的制备方法，其特征在于，所述靶向HRR基因探针组和靶向HRD区域探针组中的探针为生物素标记的双链DNA探针。

3.根据权利要求1所述的制备方法，其特征在于，所述链霉亲和素溶液的浓度为0.05～0.5μg/μL；所述靶向...

【技术特征摘要】

1.不等深度hrd和hrr基因杂交捕获探针组合物的制备方法，其特征在于，所述制备方法包括：将链霉亲和素溶液与靶向hrd区域探针组混合，孵育，得混合液；将所述混合液与靶向hrr基因探针组混合，得不等深度hrd和hrr基因杂交捕获探针组合物；所述靶向hrd区域探针组中每条探针与链霉亲和素的混合比例为1.6fmol：0.1～1μg。

2.根据权利要求1所述的制备方法，其特征在于，所述靶向hrr基因探针组和靶向hrd区域探针组中的探针为生物素标记的双链dna探针。

3.根据权利要求1所述的制备方法，其特征在于，所述链霉亲和素溶液的浓度为0.05～0.5μg/μl；所述靶向hrd区域探针组中每条探针的浓度为0.1～1fmol/μl；所述靶向hrr基因探针组中每条探针的浓度为0.1～1fmol/μl。

4.根据权利要求3所述的制备方法，其特征在于，所述靶向hrd区域探针组和所述链霉亲和素溶液的体积比为4:1～10。

5.根据权...

【专利技术属性】
技术研发人员：杨春燕，陈慧娟，郝艳同，蔡丽丽，张怡然，
申请(专利权)人：北京序腾基因科技有限公司，
类型：发明
国别省市：