一种豇豆耐盐性主效QTL紧密连锁的分子标记、其引物及应用制造技术

本发明专利技术公开了一种与豇豆耐盐性主效QTL紧密连锁的分子标记及其引物序列。本发明专利技术所述的豇豆耐盐性主效QTL名称SC3_00124，与其紧密连锁的KASP类型分子标记3_00124位于11号染色体上43716091 bp的位置，可利用该标记扩增待测材料，根据其基因型判断样本是否携带控制耐盐性的关键等位变异。利用本发明专利技术提供的分子标记及其引物可以实现对豇豆耐盐性主效QTL的快速筛选，与传统表型鉴定方法相比，具有检测通量高、结果准确可靠等优势，其分型准确率可达99%以上。该技术可显著提升豇豆耐盐品种的选育效率，缩短育种周期。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于植物分子育种，涉及一种豇豆耐盐性主效qtl（sc3_00124）紧密连锁的分子标记、其引物及应用。

技术介绍

1、豇豆（vigna unguiculata（l.）walp.）是豆科（fabaceae）豇豆属（vigna savi）的重要作物，基因组大小约620 mb，染色体数为2n=2x=22。作为热带和亚热带地区广泛栽培的豆类作物，豇豆是重要的食用豆类和蔬菜作物之一。

2、盐碱胁迫是影响豇豆生长和产量的重要环境因素，尤其在沿海地区和内陆盐碱地，土壤盐渍化严重制约着豇豆的种植和产量。研究表明，豇豆对盐胁迫的耐受性存在显著的品种间差异，这种差异主要由遗传因素决定。耐盐性作为复杂的数量性状，受多基因控制且易受环境影响，传统育种方法通过表型筛选效率低下且周期长。

3、随着豇豆基因组测序的完成和分子标记技术的发展，基于snp（单核苷酸多态性）的分子标记辅助选择为豇豆耐盐性育种提供了新的技术手段。其中，竞争性等位基因特异性pcr（kompetitive allele specific pcr，kasp）技术因其高通量、低成本和高本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种与豇豆耐盐性主效QTL紧密连锁的分子标记，其特征在于，所述分子标记为3_00124，所述分子标记为KASP类型；所述分子标记的SNP位点位于豇豆品种G98基因组上11号染色体43716091bp处，多态性为C/T。

2.根据权利要求1所述的分子标记，其特征在于，所述分子标记的核苷酸序列如SEQ IDNO.1所示。

3.一种检测如权利要求1或2所述分子标记的KASP引物，其特征在于，所述KASP引物包括特异性正向引物Primer1、特异性正向引物Primer2和通用反向引物Primer_Common；

4.根据权利要求3所述KASP引物，其特征在...

【技术特征摘要】

1.一种与豇豆耐盐性主效qtl紧密连锁的分子标记，其特征在于，所述分子标记为3_00124，所述分子标记为kasp类型；所述分子标记的snp位点位于豇豆品种g98基因组上11号染色体43716091bp处，多态性为c/t。

2.根据权利要求1所述的分子标记，其特征在于，所述分子标记的核苷酸序列如seq idno.1所示。

3.一种检测如权利要求1或2所述分子标记的kasp引物，其特征在于，所述kasp引物包括特异性正向引物primer1、特异性正向引物primer2和通用反向引物primer_common；

4.根据权利要求3所述kasp引物，其特征在于， 3_00124 primer1连接hex基团，3_00124 primer2连接sam基团。

5.一种根据权利要求3或4所述kasp引物，或含有权利要求3或4所述kasp引物的试剂或试剂盒在检测豇豆耐盐性主效qtl中的应用。

6.一种使用权利要求3或4所述kasp引...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘镠，吴新义，
申请(专利权)人：湘湖实验室农业浙江省实验室，
类型：发明
国别省市：