一种基于质谱流式数据的质量控制方法及系统技术方案

本发明专利技术公开了一种基于质谱流式数据的质量控制方法及系统。本发明专利技术通过信号分布可视化可以确定不同数据之前信号分布是否具有较好的一致性；MAD能够衡量通道内信号的分布是否集中或者离散；各类统计指标计算则可以知道相同的通道，不同数据之间是否有较大的差距；通过FlowSOM聚类，计算每个数据中每个亚群的比例，再结合批次信息分析不同批次之间相同的亚群占比是否具有统计学差异；结合亚群信息，计算每个数据中每个通道的AOF值，通过AOF值判断通道的marker染色效果是否正常。本发明专利技术通过综合运用多种统计学方法，能够高效、准确地评估不同批次CyTOF数据的质量，识别潜在的系统误差或批次效应，并提供优化建议，从而提高单细胞蛋白质组学研究的可靠性。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物医学，具体涉及一种基于质谱流式数据的质量控制方法及系统。

技术介绍

1、cytof(cytometry by time-of-flight，飞行时间质谱细胞分析)是一种基于质谱的高维单细胞分析技术，广泛应用于免疫学、癌症研究及系统生物学等领域。相比于传统的流式细胞术(facs)，cytof技术可以使用金属同位素标记抗体，大幅降低荧光重叠问题，并使得检测通道数可以扩展到40-50个甚至更多，从而实现更高维度的单细胞表型分析。

2、然而，由于实验条件、仪器检测及样本处理的差异，cytof数据可能存在批次效应或信号漂移，影响数据分析的准确性。因此，需要一种高效、系统化的质量控制方法来评估和优化cytof数据。

技术实现思路

1、本专利技术针对现有技术的不足，提供了一种基于质谱流式数据的质量控制方法及系统。

2、第一方面，本专利技术提供了一种基于质谱流式数据的质量控制方法，包括以下步骤：

3、数据读取：根据指定的文件夹，读取文件夹下的每个fcs文件；

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【技术保护点】

1.一种基于质谱流式数据的质量控制方法，其特征在于，包括以下步骤：

2.根据权利要求1所述的基于质谱流式数据的质量控制方法，其特征在于，所述数据读取步骤中：

3.根据权利要求1或2所述的基于质谱流式数据的质量控制方法，其特征在于，所述信号表达分布分析步骤中：

4.根据权利要求1所述的基于质谱流式数据的质量控制方法，其特征在于，所述离散程度评估步骤中：

5.根据权利要求1或2所述的基于质谱流式数据的质量控制方法，其特征在于，所述批次差异评估步骤中：

6.根据权利要求1所述的基于质谱流式数据的质量控制方法，其特征在于，所述聚类分析步...

【技术特征摘要】

1.一种基于质谱流式数据的质量控制方法，其特征在于，包括以下步骤：

2.根据权利要求1所述的基于质谱流式数据的质量控制方法，其特征在于，所述数据读取步骤中：

3.根据权利要求1或2所述的基于质谱流式数据的质量控制方法，其特征在于，所述信号表达分布分析步骤中：

4.根据权利要求1所述的基于质谱流式数据的质量控制方法，其特征在于，所述离散程度评估步骤中：

5.根据权利要求1或2所述的基于质谱流式数据的质量控制方法，其特征在于，所述批次差异评估步骤中：

6.根据权利要求1所述的基于质谱流式数据的质量控制方法，其特征在于，所述聚类分析步骤中：

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【专利技术属性】
技术研发人员：李鹏，刘锐翔，孔全明，
申请(专利权)人：浙江普罗亭健康科技有限公司，
类型：发明
国别省市：