包含逆转录酶的基因编辑系统技术方案

技术编号:45648052 阅读:9 留言:0更新日期:2025-06-27 18:51
本公开总体上涉及包含逆转录酶的基因编辑系统和逆转录酶与切口酶或核酸酶的融合蛋白,制备此类逆转录酶和融合蛋白的方法,以及使用此类逆转录酶和融合蛋白以在细胞中进行定点基因组编辑的方法。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】


技术介绍


技术实现思路

1、本公开部分地基于基因编辑系统的开发,所述基因编辑系统包含逆转录酶、核酸酶或切口酶以及向导rna或pegrna。

2、本文描述了融合蛋白,其包含使用接头与逆转录酶连接的切口酶,其中所述逆转录酶与seq id no:161-629、767-1220、1959-2522和2582-2585中的任一个包含至少约80%序列同一性。

3、本文描述了融合蛋白,其包含使用接头与逆转录酶连接的核酸酶,其中所述逆转录酶与seq id no:161-629、767-1220、1959-2522和2582-2585中的任一个包含至少约80%序列同一性。

4、本文描述了融合蛋白,其包含使用接头与逆转录酶连接的经催化死亡的核酸酶,其中所述逆转录酶与seq id no:161-629、767-1220、1959-2522和2582-2585中的任一个包含至少约80%序列同一性。

5、本文描述了基因编辑系统,其包含:a)切口酶;b)向导核酸,所述向导核酸被配置成与所述切口酶形本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种融合蛋白,其包含使用接头与逆转录酶连接的切口酶,其中所述逆转录酶与SEQID NO:161-629、767-1220、1959-2522和2582-2585中的任一个包含至少约80%序列同一性。

2.一种融合蛋白,其包含使用接头与逆转录酶连接的核酸酶,其中所述逆转录酶与SEQID NO:161-629、767-1220、1959-2522和2582-2585中的任一个包含至少约80%序列同一性。

3.一种融合蛋白,其包含使用接头与逆转录酶连接的经催化死亡的核酸酶,其中所述逆转录酶与SEQ ID NO:161-629、767-1220、1959-2522和2...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】

1.一种融合蛋白,其包含使用接头与逆转录酶连接的切口酶,其中所述逆转录酶与seqid no:161-629、767-1220、1959-2522和2582-2585中的任一个包含至少约80%序列同一性。

2.一种融合蛋白,其包含使用接头与逆转录酶连接的核酸酶,其中所述逆转录酶与seqid no:161-629、767-1220、1959-2522和2582-2585中的任一个包含至少约80%序列同一性。

3.一种融合蛋白,其包含使用接头与逆转录酶连接的经催化死亡的核酸酶,其中所述逆转录酶与seq id no:161-629、767-1220、1959-2522和2582-2585中的任一个包含至少约80%序列同一性。

4.一种基因编辑系统,其包含:

5.根据权利要求4所述的基因编辑系统,其中所述切口酶是经修饰的核酸内切酶。

6.根据权利要求5所述的基因编辑系统,其中所述经修饰的核酸内切酶是ii型crispr核酸内切酶。

7.根据权利要求5所述的基因编辑系统,其中所述经修饰的核酸内切酶是v型crispr核酸内切酶。

8.根据权利要求6至7中任一项所述的基因编辑系统,其中所述ii型crispr核酸内切酶或所述v型crispr核酸内切酶具有切口酶活性。

9.根据权利要求5所述的基因编辑系统,其中所述经修饰的核酸内切酶选自由以下组成的组:spcas9(h840a)、spcas9(d10a)、nmg3-6(d13a)、nmg3-6(h586a)、nmg3-6(n609a)、cas12a和mg29-1。

10.根据权利要求5所述的基因编辑系统,其中所述经修饰的核酸内切酶与seq id no:152-154中的任一个包含至少约80%序列同一性。

11.根据权利要求4至10中任一项所述的基因编辑系统,其中所述切口酶和所述逆转录酶是融合的。

12.根据权利要求4至10中任一项所述的基因编辑系统,其中所述切口酶和所述逆转录酶是通过接头连接的。

13.根据权利要求12所述的基因编辑系统,其中所述接头包含至少10个、20个或30个氨基酸。

14.根据权利要求12所述的基因编辑系统,其中所述接头包含约30-35个氨基酸。

15.根据权利要求12所述的基因编辑系统,其中所述接头包含约30个氨基酸。

16.根据权利要求12所述的基因编辑系统,其中所述接头与seq id no:103包含至少80%序列同一性。

17.根据权利要求12所述的基因编辑系统,其中所述接头与seq id no:155-160中的任一个包含至少80%序列同一性。

18.根据权利要求4至10中任一项所述的基因编辑系统,其中所述切口酶和所述逆转录酶是不连接的。

19.根据权利要求4至18中任一项所述的基因编辑系统,其中所述向导核酸包含间隔子序列和crrna。

20.根据权利要求4至19中任一项所述的基因编辑系统,其中所述向导核酸进一步包含逆转录酶模板(rtt)。

21.根据权利要求20所述的基因编辑系统,其中所述rtt中的碱基包含选自下组的大体积修饰:复合糖或复合氨基和/或与rna相容的其它修饰。

22.根据权利要求4至21中任一项所述的基因编辑系统,其中所述向导核酸进一步包含引物结合位点。

23.根据权利要求22所述的基因编辑系统,其中所述引物结合位点位于所述向导核酸的3'端上。

24.根据权利要求22至23中任一项所述的基因编辑系统,其中所述引物结合位点包含至少2个、4个、6个、8个、10个、13个、16个、20个、24个、28个、32个、36个、40个、45个、50个、55个、60个或65个核苷酸。

25.根据权利要求4至24中任一项所述的基因编辑系统,其中所述核酸酶与所述向导核酸非共价连接。

26.根据权利要求4至24中任一项所述的基因编辑系统,其中所述核酸酶与所述向导核酸共价连接。

27.根据权利要求4至24中任一项所述的基因编辑系统,其中所述核酸酶与所述向导核酸融合。

28.根据权利要求4至24中任一项所述的基因编辑系统,其进一步包含转座酶、整合酶或归巢核酸内切酶。

29.根据权利要求4至28中任一项所述的基因编辑系统,其进一步包含逆转录转座子。

30.根据权利要求4至29中任一项所述的基因编辑系统,其中所述逆转录酶包含的持续合成能力是莫洛尼鼠白血病病毒(mmlv)逆转录酶的持续合成能力的至少约2倍。

31.根据权利要求4至29中任一项所述的基因编辑系统,其中所述逆转录酶包含的持续合成能力是莫洛尼鼠白血病病毒(mmlv)逆转录酶的持续合成能力的至多约1/2。

32.根据权利要求4至31中任一项所述的基因编辑系统,其中所述逆转录酶包含的错误率小于约2.5%、2.0%、1.5%、1%、0.5%、0.25%、0.10%或0.05%。

33.根据权利要求4至32中任一项所述的基因编辑系统,其中与莫洛尼鼠白血病病毒(mmlv)逆转录酶相比,所述逆转录酶包含的错误率小于约2.5%、2.0%、1.5%、1%、0.5%、0.25%、0.10%或0.05%。

34.一种基因编辑系统,其包含:

35.根据权利要求34所述的基因编辑系统,其中所述核酸酶是双链核酸酶。

36.根据权利要求34至35中任一项所述的基因编辑系统,其中所述核酸酶是ii型crispr核酸内切酶。

37.根据权利要求36所述的基因编辑系统,其中所述crispr核酸内切酶是cas9。

38.根据权利要求37所述的基因编辑系统,其中所述cas9是经催化死亡的cas9(dcas9)。

39.根据权利要求34至38中任一项所述的基因编辑系统,其中所述核酸酶和所述逆转录酶是融合的。

40.根据权利要求34至38中任一项所述的基因编辑系统,其中所述核酸酶和所述逆转录酶是通过接头连接的。

41.根据权利要求40所述的基因编辑系统,其中所述接头包含至少10个、20个或30个氨基酸。

42.根据权利要求40所述的基因编辑系统,其中所述接头包含约30-35个氨基酸。

43.根据权利要求40所述的基因编辑系统,其中所述接头包含约30个氨基酸。

44.根据权利要求40所述的基因编辑系统,其中所述接头与seq id no:103包含至少80%序列同一性。

45.根据权利要求40所述的基因编辑系统,其中所述接头与seq id no:155-160中的任一个包含至少80%序列同一性。

46.根据权利要求34至38中任一项所述的基因编辑系统,其中所述核酸酶和所述逆转录酶是不连接的。

47.根据权利要求34至46中任一项所述的基因编辑系统,其中...

【专利技术属性】
技术研发人员:布莱恩·C·托马斯利萨·亚历山大科塔基·巴尔萨雷克利斯多佛·布朗辛迪·卡斯泰勒丹妮拉·S·A·戈尔茨曼苏拉布·库尔卡尼莎拉·拉佩里埃利安娜·蒙泰莱奥内玛丽亚·约瑟·索托孔特雷拉斯莫拉伊玛·特莫彻迪亚兹安努·托马斯玛丽·凯特琳·赵丽贝卡·拉莫特
申请(专利权)人:宏基因组学公司
类型:发明
国别省市:

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