【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
技术介绍
1、生物分子分析和表征的技术改进已被证明对于理解生物和病理机制至关重要，这对疾病诊断和建模、治疗剂和治疗的开发以及改善健康结局具有重要意义。在这些技术改进中，核酸测序已成为生物样品基因组和转录组分析的重要工具。
2、蛋白质信号传导是多种细胞过程的基础，在病毒、细胞和活生物体中发挥重要作用。然而，目前研究蛋白质的技术在选择性、灵敏度、通量方面受到限制，或者需要先验知识。因此，需要新的方法来表征和分析蛋白质。
技术实现思路
1、本文认识到需要一种从头研究蛋白质的技术，其准确性更高，并且具有高通量形式。通过常规方法在蛋白质或肽测序中使用纳米孔面临挑战。肽或蛋白质通过纳米孔的易位以及随后的读出受到蛋白质特性的阻碍：蛋白质折叠且不均匀带电，并且氨基酸的紧密分子内间隔意味着许多氨基酸同时进入纳米孔，导致难以相互分辨的叠加信号。本文提供了用于分析蛋白质的系统、组合物、试剂盒和方法，以满足上述需求。本公开的方法可以包括通过分子内扩展过程将多个可聚合分子附接到肽的氨基酸上，并分析可聚...
【技术保护点】
1.一种处理经修饰的氨基酸的方法，所述方法包括：
2.一种方法，包括：
3.根据权利要求1或2所述的方法，其中所述经修饰的氨基酸包括或衍生自与所述可聚合分子偶联的蛋白质原生氨基酸。
4.根据权利要求1-3中任一项所述的方法，其中所述经修饰的氨基酸或其衍生物还包括结合剂。
5.根据权利要求4所述的方法，其中所述结合剂包括抗体、抗体片段、纳米抗体、适配体、肽、聚合物、无机化合物、小分子或其衍生物。
6.根据权利要求1-5中任一项所述的方法，其中所述经修饰的氨基酸包括非天然存在的化学修饰。
7.根据权利...
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】
1.一种处理经修饰的氨基酸的方法，所述方法包括：
2.一种方法，包括：
3.根据权利要求1或2所述的方法，其中所述经修饰的氨基酸包括或衍生自与所述可聚合分子偶联的蛋白质原生氨基酸。
4.根据权利要求1-3中任一项所述的方法，其中所述经修饰的氨基酸或其衍生物还包括结合剂。
5.根据权利要求4所述的方法，其中所述结合剂包括抗体、抗体片段、纳米抗体、适配体、肽、聚合物、无机化合物、小分子或其衍生物。
6.根据权利要求1-5中任一项所述的方法，其中所述经修饰的氨基酸包括非天然存在的化学修饰。
7.根据权利要求6所述的方法，其中所述非天然存在的化学修饰是保护基团。
8.根据权利要求1-7中任一项所述的方法，其中所述纳米孔与解旋酶偶联。
9.根据权利要求8所述的方法，其中所述解旋酶引导所述经修饰的氨基酸或其衍生物通过所述纳米孔。
10.根据权利要求1-9中任一项所述的方法，其中(b)使用拓扑异构酶或聚合酶进行。
11.根据权利要求1-9中任一项所述的方法，其中(b)使用电场或磁场进行。
12.根据权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述可聚合分子包括核酸分子。
13.根据权利要求12所述的方法，其中所述核酸分子包括脱氧核糖核酸(dna)分子、异种核酸(xna)分子、核糖核酸(rna)分子或其经修饰的变体。
14.根据权利要求1-13中任一项所述的方法，其中所述纳米孔包括跨膜蛋白。
15.根据权利要求1-13中任一项所述的方法，其中所述纳米间隙包括无机材料。
16.根据权利要求15所述的方法，其中所述纳米间隙包括氮化硅或硫酸钼。
17.根据权利要求1-16中任一项所述的方法，其中所述可聚合分子与所述经修饰的氨基酸共价连接。
18.根据权利要求1-17中任一项所述的方法，还包括在(a)之前，从肽的氨基酸生成所述经修饰的氨基酸。
19.根据权利要求18所述的方法，其中所述氨基酸位于所述肽的末端。
20.根据权利要求19所述的方法，其中所述末端是n末端。
21.根据权利要求19所述的方法，其中所述经修饰的氨基酸包括与末端氨基酸连接的所述可聚合分子。
22.根据权利要求21所述的方法，其中所述可聚合分子通过异硫氰酸酯部分与所述末端氨基酸连接。
23.根据权利要求1-22中任一项所述的方法，进一步包括在(a)之前(i)提供接头，其中所述接头包括氨基酸反应性部分，以及(ii)使所述氨基酸反应性部分与蛋白质原生氨基酸接触以产生所述经修饰的氨基酸。
24.根据权利要求23所述的方法，其中所述接头与所述可聚合分子偶联。
25.根据权利要求23所述的方法，进一步包括将所述接头与所述可聚合分子偶联。
26.根据权利要求25所述的方法，其中所述接头包括第一反应性部分并且所述可聚合分子包括第二反应性部分，并且进一步包括使所述第一反应性部分与所述第二反应性部分反应，从而生成与所述可聚合分子偶联的所述接头。
27.根据权利要求26所述的方法，其中所述第一反应性部分或所述第二反应性部分包括点击化学部分。
28.根据权利要求26所述的方法，其中所述可聚合分子包括核酸接头，其中所述核酸接头包括经修饰的核碱基和点击化学部分。
29.根据权利要求23-27中任一项所述的方法，其中所述氨基酸反应性部分包括苯基异硫氰酸酯(pitc)。
30.根据权利要求23-29中任一项所述的方法，其中所述蛋白质原生氨基酸是肽的末端氨基酸。
31.根据权利要求30所述的方法，进一步包括将所述经修饰的氨基酸拴系于捕获部分并从所述肽上切割所述末端氨基酸以产生剩余肽和氨基酸-接头-捕获部分(aalc)复合物。
32.根据权利要求31所述的方法，其中所述捕获部分与底物偶联。
33.根据权利要求31所述的方法，其中所述捕获部分包括第一核酸分子，并且其中所述可聚合分子包括第二核酸分子。
34.根据权利要求33所述的方法，其中所述第一核酸分子或所述第二核酸分子包括核酸条形码分子。
35.根据权利要求34所述的方法，其中所述核酸条形码分子识别所述肽。
36.根据权利要求33-35中任一项所述的方法，其中所述核酸条形码分子包含时间信息。
37.根据权利要求31-36中任一项所述的方法，其中所述捕获部分包含可切割的部分。
38.根据权利要求33-36中任一项所述的方法，其中所述拴系包括将所述第一核酸分子连接至所述第二核酸分子。
39.根据权利要求38所述的方法，其中所述连接是使用连接酶进行的。
40.根据权利要求38所述的方法，其中所述连接包括(i)提供夹板寡核苷酸，所述夹板寡核苷酸包括与所述第一核酸分子的至少一部分互补的第一序列和与所述第二核酸分子的至少一部分互补的第二序列，以及(ii)使所述第一序列与所述第一核酸分子的所述部分杂交，并且使所述第二序列与所述第二核酸分子的所述部分杂交。
41.根据权利要求33所述的方法，进一步包括：(i)提供与附加核酸分子偶联的附加接头，(ii)使所述附加接头与所述剩余肽的末端氨基酸接触以产生附加经修饰的氨基酸；以及(iii)将所述附加经修饰的氨基酸拴系于所述aalc复合物以产生所述其衍生物。
42.根据权利要求41所述的方法，进一步包括：重复(i)-(iii)以产生所述其衍生物，其中所述其衍生物包含多个经修饰的氨基酸。
43.根据权利要求41所述的方法，其中所述核酸分子或所述附加核酸分子包含条形码序列。
44.根据权利要求41-43中任一项所述的方法，其中所述核酸分子包含第一序列，其中所述附加核酸分子包含第二序列，其中所述第一序列不同于所述第二序列。
45.根据权利要求44所述的方法，其中所述第一序列或所述第二序列包含时间或空间信息。
46.根据权利要求45所述的方法，其中所述时间信息是提供所述接头或所述附加接头的循环或迭代次数的索引。
47.根据权利要求1所述的方法，其中所述经修饰的氨基酸的所述易位速度与没有所述可聚合分子的所述氨基酸的易位速度相比较低。
48.根据权利要求1所述的方法，进一步包括测量所述纳米孔或所述纳米间隙的电流信号以确定所述易位速度。
49.根据权利要求1-48中任一项所述的方法，进一步包括使用所述纳米孔或所述纳米间隙识别所述经修饰的氨基酸或其衍生物。
50.根据权利要求49所述的方法，其中所述识别包括测量来自所述纳米孔或所述纳米间隙的电流信号并确定所述经修饰的氨基酸或其衍生物的氨基酸类型或其翻译后修饰的变体。
51.根据权利要求1或2所述的方法，其中(b)在低于环境温度的温度下发生。
52.一种处理肽的方法，包括：
53.根据权利要求52所述的方法，其中所述接头包含反应性部分。
<...【专利技术属性】
技术研发人员：阿斯马莫·瓦西，丹尼尔·马萨奥·伊斯坦迪安，安德鲁·约翰·普莱斯，华伯洋，约书亚·扬·辛明·杨，大卫·多德，杰拉尔多·法比安·德尔加多，伊莱恩·吉恩·苏，
申请(专利权)人：格里菲克生物技术公司，
类型：发明
国别省市：
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。