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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及病毒检测,尤其涉及一种sars-cov-2假病毒载体构建验证方法。
技术介绍
1、目前,新型冠状病毒(sars-cov-2)的检测方法主要依赖于核酸检测,特别是实时荧光定量pcr(rt-qpcr)。这一检测方法利用病毒的特定基因序列作为靶标,如n基因、e基因和orf1a/b基因,进行扩增和检测。现有的核酸检测技术具有高度的灵敏度和特异性,已经在全球范围内广泛应用于新冠病毒的诊断。
2、但现有新型冠状病毒(sars-cov-2)的检测方法在实际应用中,真实的病毒样本具有高度传染性,实验室操作存在较高的生物安全风险。
技术实现思路
1、本专利技术的目的在于提供一种sars-cov-2假病毒载体构建验证方法,旨在解决真实的新型冠状病毒样本具有高度传染性,实验室操作新型冠状病毒的检测存在较高的生物安全风险的问题。
2、为实现上述目的,本专利技术提供了一种sars-cov-2假病毒载体构建验证方法,包括以下步骤:
3、基于新型冠状病毒选定3个靶标基因,将3个所述靶标基因的核苷酸序列串联,并克隆至慢病毒包装表达载体上,得到质粒;
4、将所述质粒与二代慢病毒包装质粒转化大肠杆菌克隆菌株,扩大培养,提取无内毒素质粒;
5、基于额定比例将所述无内毒素质粒共转染细胞,96小时后从所述转染细胞上清液中收集含有目的基因rna的假病毒颗粒;
6、使用聚乙二醇8000溶液对所述假病毒颗粒进行沉淀,弃掉细胞上清液后,使用病毒溶
7、基于所述无内毒素质粒分别对3个所述靶标基因绘制标准曲线,对所述假病毒颗粒进行rna提取、逆转录和荧光定量pcr,通过所述标准曲线计算假病毒滴度,得到假病毒。
8、其中,所述新型冠状病毒选定3个靶标基因包括n基因、e基因和orf1a/b基因。
9、其中,所述将所述质粒与二代慢病毒包装质粒转化大肠杆菌克隆菌株,扩大培养,提取无内毒素质粒的具体方式:
10、从-80℃超低温冰箱取出大肠杆菌trans10克隆菌株,置于冰上融化,加入1μl质粒,使用枪头轻轻吹打混匀,冰浴30min;
11、42℃的条件下热激45s,转移至冰浴2min;
12、加入500μl不含抗生素的lb培养基,在37℃的条件下,搅拌220rpm,培养30min;
13、在超净工作台中,取50μl菌液滴加到lb平板上,用涂布棒均匀涂开将平板放入37℃培养箱中,待菌液干后倒置培养过夜;
14、在平皿上挑取一个大小合适、边缘圆滑的单菌落至5ml lb培养基试管中,在37℃的条件下,搅拌180rpm,培养12h;
15、使用高纯度质粒小提试剂盒进行高纯度质粒提取,获取无内毒素质粒,琼脂糖凝聚电泳检测所述无内毒素质粒纯度以及形式,检测后,将所述无内毒素质粒放于-20℃备用。
16、其中,所述使用聚乙二醇8000溶液对所述假病毒颗粒进行沉淀,弃掉细胞上清液后,使用病毒溶解液重悬浓缩的具体方式:
17、称取nacl 8.766g和聚乙二醇50g溶解在200ml超纯水中,并在121摄氏度条件下,湿热灭绝30min,保存在4℃的环境中待用,得到聚乙二醇8000溶液;
18、收集细胞上清,使用0.45μm滤头过滤细胞上清液;
19、每30ml过滤后的病毒初始液,加入所述聚乙二醇8000溶液7.5ml,每20~30min混合一次,共进行3-5次,并将混合液在4℃环境中放置过夜;
20、在4℃的条件下,取4000g所述混合液,离心20min;
21、吸弃上清,静置管子1~2分钟,吸走残余液体;
22、加入适量的慢病毒溶解液溶解慢病毒沉淀;
23、集中后的病毒悬液分装成50μl每份,保存在成品管中,用碎干冰速冻后储存在-80℃。
24、其中,所述假病毒最终获得滴度>10^8copies/ml。
25、本专利技术的一种sars-cov-2假病毒载体构建验证方法,基于新型冠状病毒选定3个靶标基因,将3个所述靶标基因的核苷酸序列串联,并克隆至慢病毒包装表达载体上,得到质粒;将所述质粒与二代慢病毒包装质粒转化大肠杆菌克隆菌株,扩大培养,提取无内毒素质粒;基于额定比例将所述无内毒素质粒共转染细胞,96小时后从所述转染细胞上清液中收集含有目的基因rna的假病毒颗粒;使用聚乙二醇8000溶液对所述假病毒颗粒进行沉淀,弃掉细胞上清液后,使用病毒溶解液重悬浓缩;基于所述无内毒素质粒分别对3个所述靶标基因绘制标准曲线,对所述假病毒颗粒进行rna提取、逆转录和荧光定量pcr,通过所述标准曲线计算假病毒滴度,得到假病毒,该方法筛选确认sars-cov-2检测靶标基因;构建带有检测目的基因的表达质粒;通过慢病毒包装系统转染hek293t细胞;经细胞培养后收集上清,获取含有靶标基因的假病毒;对假病毒进行纯化浓缩;通过荧光定量pcr进行假病毒滴度检测,由于假病毒不具有传染性,但其基因组与真实病毒相似,该方法可以安全地在实验室中使用,减少了操作中的生物安全风险,具有安全性,rna假病毒标准品可以作为质控品,用于评估核酸提取、逆转录和扩增等步骤的效率和准确性,确保检测方法的准确性和可靠性;通过定期使用标准品,可以监控检测过程中的变化,确保检测结果的稳定性和一致性;解决了真实的新型冠状病毒样本具有高度传染性,实验室操作新型冠状病毒的检测存在较高的生物安全风险的问题。
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1.一种SARS-CoV-2假病毒载体构建验证方法,其特征在于,包括以下步骤:
2.如权利要求1所述的一种SARS-CoV-2假病毒载体构建验证方法,其特征在于;
3.如权利要求1所述的一种SARS-CoV-2假病毒载体构建验证方法,其特征在于;
4.如权利要求1所述的一种SARS-CoV-2假病毒载体构建验证方法,其特征在于;
5.如权利要求1所述的一种SARS-CoV-2假病毒载体构建验证方法,其特征在于;
【技术特征摘要】
1.一种sars-cov-2假病毒载体构建验证方法,其特征在于,包括以下步骤:
2.如权利要求1所述的一种sars-cov-2假病毒载体构建验证方法,其特征在于;
3.如权利要求1所述的一种sars-cov-...
【专利技术属性】
技术研发人员:黄为,唐文革,顾万江,孙全,赵华,王明月,谢武娟,
申请(专利权)人:重庆市疾病预防控制中心重庆市预防医学科学院,
类型:发明
国别省市:
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