基于肽的生物标志物及用于疾病检测的相关方面制造技术

技术编号:44966948 阅读:25 留言:0更新日期:2025-04-12 01:39
本文公开了生物标志物和用于鉴别生物标志物的机器学习技术。在一个特定的实施方式中,本公开涉及用于检测和诊断LD的生物标志物的鉴别。具体而言,本公开涉及基于机器学习的技术,用于发现用于检测和诊断LD的生物标志物,以及这些生物标志物的用途。具体而言,本公开描述了可以用于检测患者样本中的莱姆病的来自伯氏疏螺旋体蛋白质组的短氨基酸序列(即肽)和蛋白质。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】


技术介绍

1、在众多蜱传疾病中,莱姆病(lyme disease,ld)代表着最突出的挑战之一,因为缺乏可靠的早期诊断工具和针对性的治疗选项。现有的用于ld的临床诊断测定基于双层组合测试,涉及针对伯氏疏螺旋体(b.burgdorferi)蛋白质组中几种众所周知的免疫原性蛋白的elisa和免疫印迹方法。尽管它们被广泛使用,但当前的测试能产生很高的假阴性率。此外,由于无法用传统的分子测定方法检测特定的免疫系统反应,慢性莱姆病(cld)(ld的一种亚型,预计有10%至20%的ld患者在接受抗生素方案的初级治疗后会发展为cld)的检测更加麻烦。在这种情况下,cld的诊断仅基于临床疾病表现。然而,cld的临床症状特征与抑郁症或纤维肌痛等其他疾病重叠,使得这种方法在诊断和治疗方面的临床实用性非常复杂。


技术实现思路

1、本公开通常涉及使用机器学习技术来鉴别可以用于检测和诊断疾病(包括蜱传疾病,例如莱姆病(ld))的生物标志物。在完整阅读本公开(包括附图)后,这些方面和其他方面将会显而易见。

<p>2、在一个方面中本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种检测对象的莱姆病的方法,所述方法包括在从所述对象获得的样本中检测表7、表8、表9、表10和/或表11中列出的一种或多种伯氏疏螺旋体抗原肽或蛋白质的存在,和/或检测编码表7、表8、表9、表10和/或表11中列出的一种或多种伯氏疏螺旋体抗原肽或蛋白质的一种或多种氨基酸的存在,从而检测所述对象的莱姆病。

2.根据权利要求1的方法,其中,检测所述表7、表8、表9、表10和/或表11中列出的一种或多种伯氏疏螺旋体抗原肽或蛋白质的存在包括检测所述样本中与所述表7、表8、表9、10和/或表11中列出的一种或多种伯氏疏螺旋体抗原肽或蛋白质结合的一种或多种抗体的存在

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【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】

1.一种检测对象的莱姆病的方法,所述方法包括在从所述对象获得的样本中检测表7、表8、表9、表10和/或表11中列出的一种或多种伯氏疏螺旋体抗原肽或蛋白质的存在,和/或检测编码表7、表8、表9、表10和/或表11中列出的一种或多种伯氏疏螺旋体抗原肽或蛋白质的一种或多种氨基酸的存在,从而检测所述对象的莱姆病。

2.根据权利要求1的方法,其中,检测所述表7、表8、表9、表10和/或表11中列出的一种或多种伯氏疏螺旋体抗原肽或蛋白质的存在包括检测所述样本中与所述表7、表8、表9、10和/或表11中列出的一种或多种伯氏疏螺旋体抗原肽或蛋白质结合的一种或多种抗体的存在。

3.根据权利要求1的方法,其中,检测所述表7、表8、表9、表10和/或表11中列出的一种或多种伯氏疏螺旋体抗原肽或蛋白质的存在包括使用针对所述样本中的所述表7、表8、表9、表10和/或表11中列出的所述一种或多种伯氏疏螺旋体抗原肽或蛋白质而产生的抗体。

4.根据权利要求1的方法,其中,检测所述编码表7、表8、表9、表10和/或表11中列出的一种或多种伯氏疏螺旋体抗原肽或蛋白质的一种或多种氨基酸的存在包括对所述样本中编码所述抗原肽或蛋白质的一种或多种核酸进行测序。

5.根据权利要求1的方法,还包括从所述对象获得所述样本。

6.根据权利要求1的方法,还包括向所述对象施用至少一种治疗性治疗。

7.根据权利要求6的方法,其中,施用所述至少一种治疗性治疗包括施用有效量的抗生素,所述抗生素选自土霉素、多西环素、米诺环素、阿莫西林、青霉素、头孢克洛、头孢拉宗、头孢米诺、头孢噻肟、头孢替坦、头孢美唑、头孢西丁、头孢呋辛酯、头孢呋辛乙酰、新菌灵、头孢曲松、阿奇霉素、克拉霉素、红霉素及其组合。

8.一种反应混合物,包含用于进行权利要求1所述的方法的试剂。

9.一种试剂盒,包含用于进行权利要求1所述的方法的试剂。

10.一种从微阵列肽数据集生成预测结合强度的计算机实施方法,所述方法包括:

11.根据权利要求10所述的计算机实施方法,其中,所述电子神经网...

【专利技术属性】
技术研发人员:莱蒙纳斯·凯尔鲍斯卡斯尼尔·伍德伯里维萨尔·贝里沙约瑟夫·莱古基普拉迪尤姆纳·卡达姆比
申请(专利权)人:代表亚利桑那州立大学的亚利桑那州董事会
类型:发明
国别省市:

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