一种伪细胞生成方法、装置、存储介质及处理器制造方法及图纸

技术编号:44957999 阅读:25 留言:0更新日期:2025-04-12 01:28
本发明专利技术公开了一种伪细胞生成方法、装置、存储介质和处理器,包括:获取目标对象的染色图,其中,染色图用于提供所述目标对象的细胞组织分布情况;获取染色图的轮廓区域,基于轮廓区域确定需要生成伪细胞的总数量;在目标空间中基于轮廓区域绘制目标区域;在目标空间中投入预设数量刚性小球,在预设数量刚性小球运动停止后,记录预设数量刚性小球的中心点位置;以中心点位置为起点按照期望面积对目标区域进行划分,得到伪细胞图像。上述过程,在目标空间中基于轮廓区域绘制目标区域,实现了基于伪细胞对目标区域的填充,不在基于网格进行填充,提供了有效细胞轮廓。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及转录组测序,尤其涉及一种伪细胞生成方法、装置、存储介质及处理器


技术介绍

1、生命科学研究的目的之一就是为了解决细胞和组织以及该组织如何影响功能这一难题。测序技术可提供特定条件下某些组织中基因的表达信息,不仅可以推断出相应未知基因的功能,揭示特定调节基因的作用机制,而且可以辨别细胞的类型和异质性,为疾病诊断提供理论依据。由于细胞作为机体的基本单元,在特定的空间位置与微环境协同,发挥其特有的生物学功能,所以对于研究和理解细胞生物学、肿瘤生物学、发育生物学等学科的发生机制来说,细胞的空间位置信息尤为重要。而空间转录组可以结合显微成像和测序技术在获得基因表达数据的同时最大程度的保留样本的空间位置信息,所以空间转录组测序技术应运而生。

2、stereo-seq空间转录组测序技术能够利用基因芯片将样本位置信息保留在芯片上,利用两次测序,分别确认mrna序列的空间位置及对应表达量,将读取的内容叠加回组织图像上,从而生成了组织切片上完整的染色图,精确到细胞级别甚至更高的分辨率,但是,染色图使用方形网格填充指定区域,方形网格代表细胞区域,无法提本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种伪细胞生成方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,基于所述轮廓区域确定需要生成伪细胞的总数量,包括:

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,在目标空间中基于所述轮廓区域绘制目标区域,其中,所述目标空间为无重力、无摩擦和无弹性空间,所述目标区域与所述轮廓区域的面积相同,包括:

4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,在所述目标空间中投入预设数量刚性小球,在所述预设数量刚性小球运动停止后,记录所述预设数量刚性小球的中心点位置,其中,所述刚性小球的面积与所述期望面积的面积差满足预设误差范围,所述预设数量与所述总数量相...

【技术特征摘要】

1.一种伪细胞生成方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,基于所述轮廓区域确定需要生成伪细胞的总数量,包括:

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,在目标空间中基于所述轮廓区域绘制目标区域,其中,所述目标空间为无重力、无摩擦和无弹性空间,所述目标区域与所述轮廓区域的面积相同,包括:

4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,在所述目标空间中投入预设数量刚性小球,在所述预设数量刚性小球运动停止后,记录所述预设数量刚性小球的中心点位置,其中,所述刚性小球的面积与所述期望面积的面积差满足预设误差范围,所述预设数量与所述总数量相关联,包括:...

【专利技术属性】
技术研发人员:张博涵秦华杜琳邓子卿刘心
申请(专利权)人:深圳华大生命科学研究院
类型:发明
国别省市:

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