【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物,尤其涉及一种基于线粒体d-loop区设计的棉鼠种特异性引物。
技术介绍
1、线粒体dna(mtdna)是一种广泛应用于进化生物学、种群遗传学和法医学研究的分子标记。由于其独特的母系遗传方式、高突变率和相对简单的基因组结构,线粒体dna在物种鉴定和亲缘关系研究中具有重要意义。
2、在线粒体基因组中,d-loop区(控制区)是最具变异性的区域之一,其核苷酸序列和长度的变异为不同物种之间提供了丰富的信息。相比于核基因组,线粒体基因组的序列较短且包含高变区和保守区,使得它成为分类和鉴定不同进化程度物种的理想选择。d-loop区的高变性不仅存在于种间差异,也存在于种内个体间变异,已被多项研究验证其用于物种鉴定的可靠性。
3、棉鼠(sigmodon hispidus)是一种常见的实验动物,其线粒体基因组已在ncbi数据库中完整公布(nc_035572.1)。为了准确鉴定棉鼠及其亚种,有必要开发出能特异性扩增棉鼠线粒体d-loop区的引物。
技术实现思路
1、
...【技术保护点】
1.一种基于线粒体D-loop区设计的棉鼠种特异性引物,其特征在于,所述引物包括以下序列:
2.如权利要求1所述的棉鼠种特异性引物在棉鼠线粒体基因组完整的D-loop区的扩增中的应用。
3.如权利要求2所述的应用,其特征在于,所述应用的应用方法包括以下步骤:
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述步骤S5中,所述棉鼠近缘物种包括小鼠、大鼠、仓鼠、豚鼠、田鼠、睡鼠、松鼠。
5.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,步骤S2中D-loop区序列片段包括,线粒体上从tRNA-Pro至12S rRNA之间的片段。
...【技术特征摘要】
1.一种基于线粒体d-loop区设计的棉鼠种特异性引物,其特征在于,所述引物包括以下序列:
2.如权利要求1所述的棉鼠种特异性引物在棉鼠线粒体基因组完整的d-loop区的扩增中的应用。
3.如权利要求2所述的应用,其特征在于,所述应用的应用方法包括以下步骤:
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述步骤s5中,所述棉鼠近缘物种包...
【专利技术属性】
技术研发人员:陆涛峰,周洁,徐晓昱,徐灵杰,李悦,刘朋飞,
申请(专利权)人:上海懿尚生物科技有限公司,
类型:发明
国别省市:
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