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小分子生成方法、装置、电子设备及存储介质制造方法及图纸

技术编号:44928132 阅读:29 留言:0更新日期:2025-04-08 19:08
本公开提供了一种小分子生成方法、装置、电子设备及存储介质,涉及小分子生成技术领域,其中方法包括:获取小分子安全知识图谱,在该图谱中,每一节点内存储有一个现有小分子的属性数据,每一第一枝叶内存储有位于该第一枝叶两端的节点对应的现有小分子之间的化学关系数据;对于每一现有小分子,从相应节点内提取与该现有小分子的毒性类型和功能类型相关的属性数据,构建嵌入向量;基于嵌入向量筛选出重要节点;以及,基于重要节点对小分子生成模型进行生成偏好的调整,使其生成符合设定毒性、功能要求的新小分子。该方法通过结合小分子安全知识图谱与知识偏好优化技术,确保生成的新分子符合药效标准,并具备高度的生物安全性。

【技术实现步骤摘要】

本公开涉及小分子生成,具体涉及一种小分子生成方法、装置、电子设备及存储介质


技术介绍

1、近年来,小分子药物的设计和优化已成为生物医药领域的研究热点,尤其是在新药开发和个性化医疗中发挥着重要作用。传统的药物设计方法依赖于经验规则、化学合成和体外实验等手段,成本高,效率低,研发周期较长。

2、基于深度学习的生成模型在小分子药物设计中,生成模型能够自动识别并生成具有特定药理活性和低毒性的分子,被广泛应用于小分子药物的设计。例如,中国专利cn116741309a公开的方案通过将小分子转化为3d分子图,并利用扩散模型生成新小分子,同时,利用图神经网络构建鉴别器,对生成的小分子进行判断,确保生成的分子符合真实分子的结构要求。然而,现有的生成模型,如gans、变分自编码器(vae)等,无法保障生成新小分子的安全性,其推断主要集中在分子结构的合理性和药理特性上,但对于新小分子可能引发的毒性反应和不良生物活性评估的考虑显然不足。

3、新小分子可能具有未知的毒性,或者与人体内的某些受体产生不良反应,进而引发过敏、毒性反应等健康问题。因此,如何在小分本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种小分子生成方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的小分子生成方法,其特征在于,还包括:

3.根据权利要求1或2所述的小分子生成方法,其特征在于,所述属性数据被配置为包括小分子本体术语、化学结构数据、毒性类型数据、作用靶点数据;并且,

4.根据权利要求1或2所述的小分子生成方法,其特征在于,所述获取小分子安全知识图谱,包括:

5.根据权利要求1或2所述的小分子生成方法,其特征在于,所述从所述小分子安全知识图谱中的相应节点内提取与所述现有小分子的毒性类型和功能类型相关的所述属性数据,并基于提取出的所述属性数据构建嵌入向量,包括...

【技术特征摘要】

1.一种小分子生成方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的小分子生成方法,其特征在于,还包括:

3.根据权利要求1或2所述的小分子生成方法,其特征在于,所述属性数据被配置为包括小分子本体术语、化学结构数据、毒性类型数据、作用靶点数据;并且,

4.根据权利要求1或2所述的小分子生成方法,其特征在于,所述获取小分子安全知识图谱,包括:

5.根据权利要求1或2所述的小分子生成方法,其特征在于,所述从所述小分子安全知识图谱中的相应节点内提取与所述现有小分子的毒性类型和功能类型相关的所述属性数据,并基于提取出的所述属性数据构建嵌入向量,包括:

6.根据权利要求5所述的小分子生成方法,其特征在于,所述知识图谱嵌入模型被配置为transe模型;并且,所述基于所述嵌入向量筛选出所述小分子安全知...

【专利技术属性】
技术研发人员:张强王钰皓丁科炎陈华钧
申请(专利权)人:浙江大学
类型:发明
国别省市:

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