【技术实现步骤摘要】
本申请涉及分子动力学,具体地,涉及一种分子体系动量矫正方法、系统、计算机设备和存储介质。
技术介绍
1、分子动力学计算体系在进行任何计算和模拟时需要保障所有原子的作用力总和为零,从而保证整体的分子动力学计算体系能量守恒。如果整体的分子动力学计算体系中的作用力总和不为零,将引发严重的计算错误,对体系的构象、能量轨迹将造成严重影响。
2、分子动力学计算的体系原子总数往往达到万级、百万级,每个时间步都需要计算原子间的相互作用力,例如原子间的范德华、静电作用,计算量巨大。为了快速实现原子作用力的计算,过程往往采用定点运算的方式实现。而定点运算的截位方式对原子作用力的计算性能和计算精度会造成不同的影响。相较于对作用力进行四舍五入截断,向下取整的截断方式能够更快速地实现,但会造成原子体系合力不为零的情况,使得整体的分子动力学计算体系的能量不守恒,引发严重的计算错误。
3、因此,目前分子动力学体系整体的能量计算精确度较差。
技术实现思路
1、本申请实施例中提供了一种分子体系动量矫
...【技术保护点】
1.一种分子体系动量矫正方法,其特征在于,包括:
2.根据权利要求1所述的分子体系动量矫正方法,其特征在于,所述第一原子量为两个原子之间的拟合参数,所述第二原子量为两个原子之间的相对距离,所述第三原子量为两个原子之间的作用力。
3.根据权利要求2所述的分子体系动量矫正方法,其特征在于,所述对所述第一原子量和所述第二原子量进行定点数运算,得到第三原子量的初始定点运算结果,根据如下公式计算:
4.根据权利要求1所述的分子体系动量矫正方法,其特征在于,所述针对各原子,根据所述初始定点运算结果的符号正负增加对应的预设值,得到矫正后的目标定点
...【技术特征摘要】
1.一种分子体系动量矫正方法,其特征在于,包括:
2.根据权利要求1所述的分子体系动量矫正方法,其特征在于,所述第一原子量为两个原子之间的拟合参数,所述第二原子量为两个原子之间的相对距离,所述第三原子量为两个原子之间的作用力。
3.根据权利要求2所述的分子体系动量矫正方法,其特征在于,所述对所述第一原子量和所述第二原子量进行定点数运算,得到第三原子量的初始定点运算结果,根据如下公式计算:
4.根据权利要求1所述的分子体系动量矫正方法,其特征在于,所述针对各原子,根据所述初始定点运算结果的符号正负增加对应的预设值,得到矫正后的目标定点运算结果,包括:
5.根据权利要求4所述的分子体系动量矫正方法,其特征...
【专利技术属性】
技术研发人员:刘君佩,郭璟,李凯,翟宇卓,
申请(专利权)人:上海思朗科技有限公司,
类型:发明
国别省市:
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