一种基于泛基因组遗传信息的单倍体建模方法技术

技术编号:44922232 阅读:21 留言:0更新日期:2025-04-08 19:02
一种基于泛基因组遗传信息的单倍体建模方法,涉及基因工程技术领域,针对现有单倍体建模效率低的问题,本申请通过核心序列机制以及滑动窗口机制,旨在尽可能地确保人类基因组中“必须基因”的存在,并且本申请将泛基因组划分为多个核心窗口使单个窗口成为相对独立个体后的并行,实现支持高度并行化的建模,在确保真实性建模的基础上提高了建模效率。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及基因工程,具体为一种基于泛基因组遗传信息的单倍体建模方法


技术介绍

1、单倍体在人类基因组研究中具有重要意义,主要体现在简化基因组分析、提高数据准确性和推动遗传研究进展等方面。由于单倍体基因组仅包含一套染色体,能够避免二倍体中等位基因差异的干扰,有助于准确组装基因组序列,并揭示染色体上等位基因的组合,即单倍型,从而更好地解析遗传变异与复杂疾病之间的关系。此外,单倍体背景简化了基因表达调控和表观遗传学研究,有利于剖析基因功能,特别是在基因编辑和细胞工程中,单倍体细胞的基因操作更加高效。同时,通过单倍体基因组对y染色体和线粒体dna的研究,可以重建人类的遗传传递模式,揭示人类进化和迁徙历史。因此,单倍体基因组在精准医学、遗传学、基因组学和人类进化研究中发挥着不可替代的作用。

2、对于基因组单倍体的建模,能够有效提升单倍体的数据量,有助于构建高精度的遗传图谱,可用于训练和评估机器学习算法在生物数据挖掘中的性能。然而,现有的单倍体建模方法,由于泛基因组数据量庞大,内部连接方式复杂,圈、环较多,因此导致了单倍体建模效率低的问题。

<本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基于泛基因组遗传信息的单倍体建模方法,其特征在于包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的一种基于泛基因组遗传信息的单倍体建模方法,其特征在于所述步骤一的具体步骤为:

3.根据权利要求2所述的一种基于泛基因组遗传信息的单倍体建模方法,其特征在于所述步骤一的具体步骤为:

4.根据权利要求3所述的一种基于泛基因组遗传信息的单倍体建模方法,其特征在于所述步骤一三中,对泛基因组中序列段进行频次统计通过哈希映射进行。

5.根据权利要求4所述的一种基于泛基因组遗传信息的单倍体建模方法,其特征在于所述利用哈希映射对泛基因组中序列段进行频次统计表示为...

【技术特征摘要】

1.一种基于泛基因组遗传信息的单倍体建模方法,其特征在于包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的一种基于泛基因组遗传信息的单倍体建模方法,其特征在于所述步骤一的具体步骤为:

3.根据权利要求2所述的一种基于泛基因组遗传信息的单倍体建模方法,其特征在于所述步骤一的具体步骤为:

4.根据权利要求3所述的一种基于泛基因组遗传信息的单倍体建模方法,其特征在于所述步骤一三中,对泛基因组中序列段进行频次统计通过哈希映射进行。

5.根据权利要求4所述的一种基于泛基因组遗传信息的单倍体建模方法,其特征在于所述利用哈希映射对泛基因组中序列段进行频次统计表示为:

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【专利技术属性】
技术研发人员:姜涛于宏扬刘亚东王亚东
申请(专利权)人:哈尔滨工业大学
类型:发明
国别省市:

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