分析RNA降解的方法技术

本发明专利技术总体上涉及分析核糖核酸(RNA)的方法。特别地，本发明专利技术涉及分析RNA以评估RNA样品中RNA分子降解水平的方法。该方法使用核酸外切酶和用于检测核苷酸和/或核苷的手段。本发明专利技术提供了一种分析样品中ssRNA的方法，所述方法包括：(a)将所述样品与探针接触，其中所述探针与所述样品中ssRNA的靶标区域结合；(b)将所述样品与单链特异性核糖核酸外切酶一起温育；以及(c)检测通过步骤(b)生成的核苷酸和/或核苷，其中所述核苷酸和/或核苷源自位于所述样品中ssRNA的所述靶标区域外部的一个或多个RNA区域。本发明专利技术还提供了用于进行所述方法的试剂盒。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】

技术介绍

技术实现思路

【技术保护点】

1.一种分析样品中ssRNA的方法，所述方法包括：

2.根据权利要求1所述的方法，其中，所述核苷酸和/或核苷是腺苷、腺苷一磷酸、腺苷二磷酸或其组合，优选腺苷一磷酸、腺苷二磷酸或其组合。

3.根据权利要求1或权利要求2所述的方法，其中，检测步骤依赖于光输出。

4.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中，所述检测步骤使用酶-试剂混合物，优选地，其中所述酶-试剂混合物包括荧光素酶，更优选地还包括丙酮酸磷酸双激酶和/或丙酮酸激酶。

5.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中，所述探针是寡核苷酸探针，优选地是DNA或RNA寡核苷酸探针，更优选地是...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】

1.一种分析样品中ssrna的方法，所述方法包括：

2.根据权利要求1所述的方法，其中，所述核苷酸和/或核苷是腺苷、腺苷一磷酸、腺苷二磷酸或其组合，优选腺苷一磷酸、腺苷二磷酸或其组合。

3.根据权利要求1或权利要求2所述的方法，其中，检测步骤依赖于光输出。

4.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中，所述检测步骤使用酶-试剂混合物，优选地，其中所述酶-试剂混合物包括荧光素酶，更优选地还包括丙酮酸磷酸双激酶和/或丙酮酸激酶。

5.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中，所述探针是寡核苷酸探针，优选地是dna或rna寡核苷酸探针，更优选地是dna寡核苷酸探针。

6.根据权利要求5所述的方法，其中，所述寡核苷酸具有的长度为15至100个核苷酸，优选地为20至60个核苷酸。

7.根据权利要求1至4中任一项所述的方法，其中，所述探针是rna结合蛋白。

8.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中，所述核糖核酸外切酶是3'->5'核糖核酸外切酶。

9.根据权利要求8所述的方法，其中，所述ssrna包括多聚(a)尾，并且ssrna的靶标区域是所述多聚(a)尾。

10.根据权利要求8所述的方法，其中，所述ssrna包括多聚(a)尾，并且ssrna的靶标区域紧邻所述多聚(a)尾的上游或跨越所述多聚(a)尾的...

【专利技术属性】
技术研发人员：F·孔贝斯，
申请(专利权)人：斯特凡TTO有限公司，
类型：发明
国别省市：