一种DAP-seq测序建库方法技术

技术编号:44737515 阅读:17 留言:0更新日期:2025-03-21 18:04
本发明专利技术涉及高通量测序建库技术领域,公开了一种DAP‑seq测序建库方法,首先,设计特异性引物,这些引物能够精准识别并结合到目标基因序列上。接着,通过PCR技术扩增想要的基因片段,并进行纯化,以确保获得高纯度的目标DNA作为体外蛋白翻译的基因模板。在体外蛋白表达阶段,利用特定的表达系统,投入模板合成了目标蛋白质。这些蛋白质随后在DNA片段的筛选过程中,与特定DNA结合,利用蛋白质与DNA之间的相互作用,通过亲和纯化技术筛选出这些DNA片段。DNA片段被构建成文库上机测序。这些操作能够精确地识别、提取和利用目标DNA片段,为探索转录因子与DNA的结合开辟了新的道路。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及高通量测序建库,特别涉及一种dap-seq测序建库方法。


技术介绍

1、转录因子(transcription factor,tf)在基因表达调控中扮演着核心角色,通过特异性结合到基因组上的转录因子结合位点(transcriptionfactor binding sites,tfbs)来调控下游基因的表达。探究tfbs对于理解tf的功能具有重要意义。染色质免疫沉淀测序(chip-seq)是一种揭示tfbs的有效手段。然而,chip-seq的成功在很大程度上依赖于抗体的质量。对于稀有或表达水平较低的蛋白质,制备高质量的抗体具有一定难度。此外,对于非模式生物,可用的商业化抗体资源极其有限。这些因素限制了chip-seq技术在非模式生物或不太常见的转录因子中的广泛应用。

2、dna亲和纯化测序(dnaaffinitypurification sequencing,dap-seq)克服了chip-seq在抗体获取和物种方面的限制,允许研究者在体外条件下,利用经过特殊改造的转录因子蛋白直接与基因组dna片段相互作用,对富集的dna片段进行高通本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种DAP-seq测序建库方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的DAP-seq测序建库方法,其特征在于,所述步骤S1具体包括:

3.根据权利要求1所述的DAP-seq测序建库方法,其特征在于,所述步骤S2具体包括:

4.根据权利要求3所述的DAP-seq测序建库方法,其特征在于,所述步骤S3中,DNA片段化及片段筛选具体包括:

5.根据权利要求4所述的DAP-seq测序建库方法,其特征在于,所述第一预设表中包括组分和每个组分的体积,具体为:上一步产物50μl、Rapid Ligation Buffer 325μl、Rapid...

【技术特征摘要】

1.一种dap-seq测序建库方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的dap-seq测序建库方法,其特征在于,所述步骤s1具体包括:

3.根据权利要求1所述的dap-seq测序建库方法,其特征在于,所述步骤s2具体包括:

4.根据权利要求3所述的dap-seq测序建库方法,其特征在于,所述步骤s3中,dna片段化及片段筛选具体包括:

5.根据权利要求4所述的dap-seq测序建库方法,其特征在于,所述第一预设表中包括组分和每个组分的体积,具体为:上一步产物50μl、rapid ligation buffer 325μl、rapiddna ligase 5μl、dapad...

【专利技术属性】
技术研发人员:晏雷魏世鹏吴启家王敏
申请(专利权)人:武汉康测科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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