一种检测弗格森埃希菌的靶基因、引物及方法技术

本发明专利技术涉及弗格森埃希菌检测技术领域，具体涉及一种检测弗格森埃希菌的靶基因、引物及方法。本发明专利技术提供的一种检测弗格森埃希菌的靶基因，所述鉴定弗格森埃希菌的靶基因序列如SEQ ID NO:1所示。通过对622株埃希菌属细菌的全基因组比对，发现弗格森埃希菌存在一个保守基因cheV，对应已知弗格森埃希菌Escherichia fergusonii ATCC 35469全基因组中的cheV，该基因不存在于其他埃希菌属细菌中，因此将核苷酸序列如SEQ ID NO.1作为检测弗格森埃希菌的靶基因。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及弗格森埃希菌检测，具体涉及一种检测弗格森埃希菌的靶基因、引物及方法。

技术介绍

1、弗格森埃希菌（ escherichia fergusonii）属于肠杆菌科埃希菌属，与大肠杆菌同属近源。1985年，首次从临床血液样本中分离出两株弗格森埃希菌，通过分析其生化反应，将其作为一个新菌种并归于埃希菌属。弗格森埃希菌的临床意义尚不明确。然而，已有报道显示该菌可以在人类伤口感染、胆囊液中，以及在灵长类动物和水中被分离出来。弗格森埃希菌流行范围广泛，宿主多样，且可能导致人类疾病。

2、目前，鉴定弗格森埃希菌的方法主要是首先进行基因测序，而后进行16s rdna比对，虽然该方法可以鉴别出弗格森埃希菌，但其成本高且耗时长。此外，lindsey等人通过daydreamer™平台比较了150株肠杆菌科的基因组，包括107株大肠埃希菌、5株志贺菌、21株艾伯特埃希菌、12株弗格森埃希菌和5株其他物种，随后他们在一个棕榈油酰酰基载体蛋白依赖的酰基转移酶编码基因 efer_079本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种检测弗格森埃希菌的靶基因，其特征在于，所述检测弗格森埃希菌的靶基因序列如SEQ ID NO:1所示。

2.一种检测弗格森埃希菌的引物，其特征在于，所述检测弗格森埃希菌的引物序列如SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:4所示。

3.一种检测弗格森埃希菌的试剂盒，其特征在于，包括权利要求2所述的检测弗格森埃希菌的引物。

4.一种检测弗格森埃希菌的方法，其特征在于，包括如下步骤，

5.根据权利要求4所述的检测弗格森埃希菌的方法，其特征在于，以20μL体积计，所述PCR反应体系包括0.8-1.2μL上游引物、0.8-1.2μL下游引物...

【技术特征摘要】

1.一种检测弗格森埃希菌的靶基因，其特征在于，所述检测弗格森埃希菌的靶基因序列如seq id no:1所示。

2.一种检测弗格森埃希菌的引物，其特征在于，所述检测弗格森埃希菌的引物序列如seq id no:2和seq id no:4所示。

3.一种检测弗格森埃希菌的试剂盒，其特征在于，包括权利要求2所述的检测弗格森埃希菌的引物。

4.一种检测弗格森埃希菌的方法，其特征在于，包括如下步骤，

5.根据权利要求4所述的检测弗格森埃希菌的方法，其特征在于，以20μl体积计，所述pcr反应体系包括0.8-1.2μl上游引物、0.8-1.2μl下游引物、0.8-1.2μl dna模板、8-12μl预混液和余量为ddh2o。

【专利技术属性】
技术研发人员：唐标，关椿久，常江，宋宇，时燕，乐敏，滕霖，陈怡飞，赵国屏，
申请(专利权)人：国科大杭州高等研究院，
类型：发明
国别省市：