基因芯片上稀疏分布微珠的自适应亮暗分类方法及系统技术方案

本发明专利技术提供了基因芯片上稀疏分布微珠的自适应亮暗分类方法及系统。该方法包括：将基因芯片荧光图像数据使用快速傅里叶变换，转换到频谱空间中，计算出旋转角度，再反方向旋转得到第一图像；在第一图像上限定关注的微珠区域，得到第二图片；对第二图片进行逆变换得到第三图片，然后对第三图片进行投影和提取行列峰值，最终生成微珠定位点阵列；从第二图片提取前景值和背景值，每一个微珠位置输出一个特征灰度值；根据特征灰度值绘制直方图，确定亮暗划分的阈值，将珠子分成亮珠和暗珠两类，灰度值大于阈值的为亮珠，灰度值小于阈值的为暗珠。本申请的技术方案适用于微珠分布非常稀疏时进行微珠定位和自适应亮暗分类，定位成功率高。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及电数字数据处理，尤其涉及基因芯片的稀疏分布微珠的自适应亮暗分类方法及系统。

技术介绍

1、在高密度基因芯片的解码环节中，需要基于基因芯片上的微珠荧光信号进行微珠亮暗分类，从而才能进行基因芯片的解码。现有技术中对于基因芯片上的稀疏微珠进行定位和亮暗分类的方法有以下两种：

2、（1）投影法：如图1所示，将图片分别沿x，y方向计算像素和(或者均值，方差等操作)，得到一维曲线（如图2所示），计算波峰点为微珠阵列的列/行坐标位置。但是，这种方法存在以下缺点：在稀疏情形时，有的列或者整列都没有亮珠，这时投影曲线无法体现对应的波峰，造成部分行和列的漏识别。

3、（2）迭代法(illumina)：如图3所示，①找出所有亮珠，并计算网格间距；②构建不完备voronoi图，找出暗珠位置；③计算仿射变换，计算与标准网格的映射变换。但是，这种方法存在以下缺点：计算量较大，非常稀疏情形时，亮珠较少，相邻亮珠的组合较少，导致第一步容易出错。

4、综上所述，现有技术中的上述两种方法仅适用于基因芯片上的微珠分布较为稀疏的情况，例如，15%本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.基因芯片上稀疏分布微珠的自适应亮暗分类方法，其特征在于，包括：

2.如权利要求1所述的基因芯片上稀疏分布微珠的自适应亮暗分类方法，其特征在于，在步骤S1中，旋转角度的计算方法包括以下两种情况：

3.如权利要求1所述的基因芯片上稀疏分布微珠的自适应亮暗分类方法，其特征在于，步骤S3包括步骤S3.1-步骤S3.3：

4.如权利要求3所述的基因芯片上稀疏分布微珠的自适应亮暗分类方法，其特征在于，在步骤S3.1中，第三图片的生成方法包括：

5.如权利要求1所述的基因芯片上稀疏分布微珠的自适应亮暗分类方法，其特征在于，所述步骤S5包括步骤S5.1...

【技术特征摘要】

1.基因芯片上稀疏分布微珠的自适应亮暗分类方法，其特征在于，包括：

2.如权利要求1所述的基因芯片上稀疏分布微珠的自适应亮暗分类方法，其特征在于，在步骤s1中，旋转角度的计算方法包括以下两种情况：

3.如权利要求1所述的基因芯片上稀疏分布微珠的自适应亮暗分类方法，其特征在于，步骤s3包括步骤s3.1-步骤s3.3：

4.如权利要求3所述的基因芯片上稀疏分布微珠的自适应亮暗分类方法，其特征在于，在步骤s3.1中，第三图片的生成方法包括：

5.如权利要求1所述的基因芯片上稀疏分布微珠的自适应亮暗分类方法，其特征在于，所述步骤s5包括步骤s5...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘超钧，徐健，许心意，
申请(专利权)人：苏州拉索生物芯片科技有限公司，
类型：发明
国别省市：