一种基于扩散模型的酶序列生成方法技术

技术编号:44565666 阅读:28 留言:0更新日期:2025-03-11 14:23
本发明专利技术公开了一种基于扩散模型的酶序列生成方法,属于生物信息技术领域。为实现在分类指导条件下,首先通过独热编码和ESM‑1b模型构建多模态数据,然后建立了基于Stable Diffusion模型与结合了全局注意力与局部注意力机制去噪模块的深度学习模型。同时,本申请验证了在可控生成蛋白质序列任务中表现,结果显示,在结构预测置信度、结构相似性和序列同源性方面优于其他模型。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种基于扩散模型的酶序列生成方法,可用于在分类指导条件下,特定酶的生成,属于生物信息。


技术介绍

1、在生物学和化学领域,设计具有特定催化功能和结构稳定性的酶是至关重要的任务。生成模型已经展示了其在可靠酶设计方面的巨大潜力。然而,尽管repecka等人在2023年取得了设计生物合理酶序列的成功,这些酶设计模型主要限于无条件生成。在实际应用场景中,研究者通常需要从随机生成的酶中筛选出符合特定标准的序列,这个过程不仅耗时而且效率低下。因此,当前的无条件蛋白生成技术距离实际应用需求还有一定的距离。改进这些技术将有助于加速科学发现并提升生物工程领域的效率。因此,开发一种以分类指导,用于特定酶序列生成的扩散模型,该模型结合了生物物种信息和扩散模型的生成能力,以生成结构稳定的酶序列,对于特定酶的研究具有重要的意义。

2、lin等人在2024年提出了一种以分类指导的扩散模型taxdiff,该模型通过前向扩散过程逐步向数据添加噪声,生成噪声数据,通过结合注意力机制的模块进行去噪。最终,通过解码器将去噪后的数据转换为新的酶序列,实现了对酶序列的分类本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基于扩散模型的酶序列生成方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤S2包括:

3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述S2.1包括:

4.权利要求1-3任意一项所述的基于扩散模型的酶序列生成方法在化学品、药品中的应用。

【技术特征摘要】

1.一种基于扩散模型的酶序列生成方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤s2包括:

3.根据...

【专利技术属性】
技术研发人员:宋智功王军苗爽
申请(专利权)人:无锡纳思生物科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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