一种基于特征约简和广义逆技术的自适应融合线性和非线性效应的表型预测方法及系统技术方案

技术编号:44560616 阅读:24 留言:0更新日期:2025-03-11 14:20
本发明专利技术提供了一种基于特征约简和广义逆技术的自适应融合线性和非线性效应的表型预测方法及系统,对作物表型预测构建了自适应融合预测因子的线性和非线性效应的新模型,并通过自适应调整权重的方法评估不同效应对表型的重要程度,实现了综合考虑作物表型预测中的线性主效应和非线性关系的影响的功能。本发明专利技术求解模型时,对训练数据集进行特征约简并利用广义逆快速有效地求解模型,提高了生物材料表型值的测定效率。本发明专利技术通过多次随机划分实验数据集得到的学习集和测试集进行模型学习,降低了模型的系统误差,提高了表型预测结果的稳定性。本发明专利技术对表型预测的有效性在基于DNA分子标记的基因型数据和基于代谢物的中间组学数据上均得到了验证。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于智能育种,具体涉及一种基于特征约简和广义逆技术的自适应融合线性和非线性效应的表型预测方法及系统


技术介绍

1、作物表型预测是通过分析作物的遗传信息、环境因素或其他相关数据,来预测其表型特征的过程。传统的对作物农艺性状表型值的测定耗时长且效率低。为提高表型值测定效率,目前常采用基于全基因组方法来实现性状预测。

2、全基因组选择(genomic selection,gs)利用分布在全基因组上的高密度分子标记,如:单核苷酸多态(single nucleotide polymorphism,snp),计算性状的基因值估计育种值。gs方法可以捕获导致表型变异的全部遗传效应,利用个体的基因型就能得到表型的评估值,从而可以实现对潜在优势品种的早期选择,提高单位时间的遗传增益,保证种群的快速改进。

3、目前,gs已有的算法主要集中在用遗传统计学方法和机器学习方法上。前者包括最佳线性无偏估计(gblup)、贝叶斯回归、最小绝对收缩与选择算子(lasso)等,后者包括支持向量机(svm)、随机森林(rf)、再生核希尔伯特空间(rkhs)本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基于特征约简和广义逆技术的自适应融合线性和非线性效应的表型预测方法,其特征在于:包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的一种基于特征约简和广义逆技术的自适应融合线性和非线性效应的表型预测方法,其特征在于:所述的步骤S1中,

3.根据权利要求2所述的一种基于特征约简和广义逆技术的自适应融合线性和非线性效应的表型预测方法,其特征在于:所述的步骤S2中,具体步骤为:

4.根据权利要求3所述的一种基于特征约简和广义逆技术的自适应融合线性和非线性效应的表型预测方法,其特征在于:所述的步骤S3中,具体步骤为:

5.根据权利要求4所述的一种基于特...

【技术特征摘要】

1.一种基于特征约简和广义逆技术的自适应融合线性和非线性效应的表型预测方法,其特征在于:包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的一种基于特征约简和广义逆技术的自适应融合线性和非线性效应的表型预测方法,其特征在于:所述的步骤s1中,

3.根据权利要求2所述的一种基于特征约简和广义逆技术的自适应融合线性和非线性效应的表型预测方法,其特征在于:所述的步骤s2中,具体步骤为:

4.根据权利要求3所述的一种基于特征约简和广义逆技术的自适应融合线性和非线性效应的表型预测方法,其特征在于:所述的步骤s3中,具体步骤为:

5.根据权利要求4所述的一种基于特征约简和广义逆技术的自适应融合线性和非线性效应的表型预测方法,其特征在于:所述的步骤s4中,具体步骤为:

6....

【专利技术属性】
技术研发人员:熊慧娟杨文宇黄一丹卓琳
申请(专利权)人:华中农业大学
类型:发明
国别省市:

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