【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物信息学和计算生物学领域，特别是针对空间转录组学数据的空间域识别方法。
技术介绍
1、空间转录组学(st)技术能够在不同空间位置上研究单个或数个细胞的基因表达水平，为理解生物组织的结构特征和功能提供了重要手段。然而，现有的空间域识别方法主要依赖于空间相邻细胞的基因表达谱，忽视了非局部空间内的基因表达相似性，这限制了空间域识别的准确性。因此，开发一种能够同时考虑局部和全局基因表达相似性的空间域识别方法具有重要意义。
2、现有技术存在的问题
3、目前识别空间域的一些方法如prost、stitch3d、stmda、graphst等，利用点的空间信息构建邻接图，并结合基因表达谱作为图神经网络的输入。然而，这些方法忽略了邻近斑点对给定斑点基因表达的影响。avgn和deepst利用增强的基于邻近点相似性的基因表达数据，结合点坐标实现邻接矩阵的构建。stagate构建了空间邻居图，并基于基因表达邻居图的预聚类来识别空间域。
4、现有的方法仅基于空间相邻细胞具有更多相似基因表达谱的前提来构建图结构。这...
【技术保护点】
1.一种用于解读空间转录组结构的具有全局特征融合的图注意力网络算法，其特征在于包括以下步骤：
2.根据权利要求1所述的一种用于解读空间转录组结构的具有全局特征融合的图注意力网络算法，其特征在于所述步骤一中。预处理包括以下内容：
3.根据权利要求2所述的一种用于解读空间转录组结构的具有全局特征融合的图注意力网络算法，其特征在于所述步骤二中，构建空间邻居图包括以下内容：
4.根据权利要求3所述的一种用于解读空间转录组结构的具有全局特征融合的图注意力网络算法，其特征在于所述步骤三中，构建基因表达相似图包括以下内容：
5.根据权...
【技术特征摘要】
1.一种用于解读空间转录组结构的具有全局特征融合的图注意力网络算法，其特征在于包括以下步骤：
2.根据权利要求1所述的一种用于解读空间转录组结构的具有全局特征融合的图注意力网络算法，其特征在于所述步骤一中。预处理包括以下内容：
3.根据权利要求2所述的一种用于解读空间转录组结构的具有全局特征融合的图注意力网络算法，其特征在于所述步骤二中，构建空间邻居图包括以下内容：
4.根据权利要求3所述的一种用于解读空间转录组结构的具有全局特征融合的图注意力网络算法，其特征在于所述步骤三中，构建基因表达相似图包括以下内容：
5.根据权利要求4所述的一种用于解读空间转录组结构的具有全局特征融合的图注意力网络算法，其特征在于步骤四中，利用图注意力自动编码器进行特征提取，编码器包括以下内容：
6.根...
【专利技术属性】
技术研发人员：江飞燕，陈晓丰，肖雄涛，张凇铭，谭铖，高张阳，
申请(专利权)人：重庆交通大学，
类型：发明
国别省市：
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