本发明专利技术公开了一种口腔菌群的失衡状态的识别方法以及系统，根据口腔样本的菌群集合划分口腔菌群平衡组以及口腔菌群失衡组；根据口腔菌群平衡组的相对丰度的过滤而定义过滤后的口腔菌群平衡组；根据过滤后的口腔菌群平衡组以及口腔菌群失衡组定义口腔核心菌群，以便于对过滤后的口腔菌群平衡组以及口腔菌群失衡组进行多维度把控，从而明确了口腔核心菌群，基于口腔核心菌群构建口腔菌群的失衡模型；根据口腔菌群的失衡模型以及口腔核心菌群定义失衡系数；根据失衡系数的识别而定义口腔菌群的失衡状态，以便于针对口腔菌群进行针对性的状态识别，从而引入了口腔菌群的失衡状态，实现了口腔菌群的失衡状态的识别以及进一步的把控。
【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及口腔菌群的，尤其涉及一种口腔菌群的失衡状态的识别方法以及系统。
技术介绍
1、随着科技的发展，口腔微生物群的应用环境在于口腔的内部，通常情况下，口腔微生物群处于动态平衡状态。可是，当口腔微生态平衡被破坏时，潜在的机会性病原体会过度生长，针对口腔菌群的状态无法进行有效的识别，特别是失衡状态的识别，影响了后续的风险预测。
技术实现思路
1、本专利技术的目的在于克服现有技术的不足，本专利技术提供了一种口腔菌群的失衡状态的识别方法以及系统，采集口腔样本的菌群集合，根据口腔样本的菌群集合划分口腔菌群平衡组以及口腔菌群失衡组；定义口腔菌群平衡组的相对丰度，根据口腔菌群平衡组的相对丰度的过滤而定义过滤后的口腔菌群平衡组；根据过滤后的口腔菌群平衡组以及口腔菌群失衡组定义口腔核心菌群，以便于对过滤后的口腔菌群平衡组以及口腔菌群失衡组进行多维度把控，从而明确了口腔核心菌群，保证了口腔核心菌群的精准性。
2、进一步地，基于口腔核心菌群构建口腔菌群的失衡模型；根据口腔菌群的失衡模型以及口腔核心菌群定义失衡系数；根据失衡系数的识别而定义口腔菌群的失衡状态，以便于针对口腔菌群进行针对性的状态识别，从而引入了口腔菌群的失衡状态，实现了口腔菌群的失衡状态的识别以及进一步的把控，为应对口腔菌群失调的发生提供风险预测。
3、本专利技术实施例提供了一种口腔菌群的失衡状态的识别方法，应用于口腔菌群的失衡状态的识别场景；
4、所述口腔菌群的失衡状态的识别方法，包括：
5、采集口腔样本的菌群集合，根据口腔样本的菌群集合划分口腔菌群平衡组以及口腔菌群失衡组；
6、定义口腔菌群平衡组的相对丰度，根据口腔菌群平衡组的相对丰度的过滤而定义过滤后的口腔菌群平衡组；
7、根据过滤后的口腔菌群平衡组以及口腔菌群失衡组定义口腔核心菌群；
8、基于口腔核心菌群构建口腔菌群的失衡模型；
9、根据口腔菌群的失衡模型以及口腔核心菌群定义失衡系数；
10、根据失衡系数的识别而定义口腔菌群的失衡状态。
11、可选的，所述采集口腔样本的菌群集合，根据口腔样本的菌群集合划分口腔菌群平衡组以及口腔菌群失衡组，包括：
12、获取口腔样本的口腔微生物组16s测序数据；
13、基于口腔样本的口腔微生物组16s测序数据定义口腔样本的菌群集合；
14、采集口腔样本的菌群集合，此时，基于口腔样本的菌群集合定义口腔样本中不同菌属的绝对丰度；
15、根据口腔样本的菌群集合匹配对应的状态标记；
16、基于口腔样本的菌群集合以及状态标记划分口腔菌群平衡组以及口腔菌群失衡组。
17、可选的，所述定义口腔菌群平衡组的相对丰度，根据口腔菌群平衡组的相对丰度的过滤而定义过滤后的口腔菌群平衡组，包括：
18、定格口腔样本中不同菌属的绝对丰度；
19、基于口腔样本中不同菌属的绝对丰度以及口腔菌群平衡组定义口腔菌群平衡组的相对丰度；
20、采集处于合格状态的相对丰度阈值；
21、基于口腔菌群平衡组的相对丰度以及相对丰度阈值触发口腔菌群平衡组的相对丰度的过滤；
22、在口腔菌群平衡组的相对丰度的过滤中，过滤掉口腔菌群平衡组中相对丰度小于0.01％且出现频率小于10％的口腔菌群，以得到过滤后的口腔菌群平衡组。
23、可选的，所述根据过滤后的口腔菌群平衡组以及口腔菌群失衡组定义口腔核心菌群，包括：
24、定格过滤后的口腔菌群平衡组；
25、关联过滤后的口腔菌群平衡组以及口腔菌群失衡组；
26、根据过滤后的口腔菌群平衡组以及口腔菌群失衡组触发对应的差异对比，并输出差异参数；
27、根据差异参数以及差异状态表定义对应的差异状态；
28、若差异状态为显著差异状态，则根据过滤后的口腔菌群平衡组以及口腔菌群失衡组构建差异菌组合；
29、根据差异菌组合定义口腔核心菌群；
30、设差异菌组合里的第i个差异菌的fc值为fcdi，计算方式为：fcdi＝log2(idi/bdi)，idi为口腔菌群失衡组中差异菌di的相对丰度平均值，bdi为过滤后的口腔菌群平衡组中di中的相对丰度平均值；当fc值的绝对值＞0.5，得到口腔核心菌群。
31、可选的，所述基于口腔核心菌群构建口腔菌群的失衡模型，包括：
32、定格口腔核心菌群；
33、将口腔核心菌群作为测试数据；
34、根据口腔核心菌群以及对应的学习模型进行学习训练，并构建口腔菌群的失衡模型，此时，基于口腔样本的菌群集合划分成多份数据，并对多份数据进行交叉验证以及重复验证，直至构建口腔菌群的失衡模型。
35、可选的，所述基于口腔核心菌群构建口腔菌群的失衡模型，还包括：
36、对口腔菌群的失衡模型进行拟合；
37、采集对应的roc曲线；
38、基于roc曲线匹配对应的auc值；
39、根据auc值的识别而定义口腔菌群的失衡模型的识别能力。
40、可选的，所述根据口腔菌群的失衡模型以及口腔核心菌群定义失衡系数，包括：
41、采集口腔菌群的失衡模型；
42、关联口腔菌群的失衡模型以及口腔核心菌群；
43、基于口腔菌群的失衡模型以及口腔核心菌群触发多重认证，并输出失衡系数。
44、可选的，所述根据失衡系数的识别而定义口腔菌群的失衡状态，包括：
45、定格失衡系数；
46、关联失衡系数以及失衡系数识别表；
47、根据失衡系数以及失衡系数识别表触发对应的识别。
48、可选的，所述根据失衡系数的识别而定义口腔菌群的失衡状态，还包括：
49、根据失衡系数的识别而定义口腔菌群的失衡状态的识别而定义口腔菌群的失衡状态。
50、另外，本专利技术实施例还提供了一种口腔菌群的失衡状态的识别系统，所述口腔菌群的失衡状态的识别系统包括：
51、采集模型，用于采集口腔样本的菌群集合，根据口腔样本的菌群集合划分口腔菌群平衡组以及口腔菌群失衡组；
52、过滤模型，用于定义口腔菌群平衡组的相对丰度，根据口腔菌群平衡组的相对丰度的过滤而定义过滤后的口腔菌群平衡组；
53、核心菌群模型，用于根据过滤后的口腔菌群平衡组以及口腔菌群失衡组定义口腔核心菌群；
54、失衡模块，用于基于口腔核心菌群构建口腔菌群的失衡模型；
55、失衡系数模块，用于根据口腔菌群的失衡模型以及口腔核心菌群定义失衡系数；
56、识别模块，用于根据失衡系数的识别而定义口腔菌群的失衡状态。
57、在本专利技术实施例中，通过本专利技术实施例中的方法，采集口腔样本的菌群集合，根据口腔样本的菌群集合划分口腔菌群平衡组以及口腔菌群失衡组；定本文档来自技高网
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【技术保护点】
1.一种口腔菌群的失衡状态的识别方法，其特征在于，应用于口腔菌群的失衡状态的识别场景；
2.根据权利要求1所述的口腔菌群的失衡状态的识别方法，其特征在于，所述采集口腔样本的菌群集合，根据口腔样本的菌群集合划分口腔菌群平衡组以及口腔菌群失衡组，包括：
3.根据权利要求2所述的口腔菌群的失衡状态的识别方法，其特征在于，所述定义口腔菌群平衡组的相对丰度，根据口腔菌群平衡组的相对丰度的过滤而定义过滤后的口腔菌群平衡组，包括：
4.根据权利要求3所述的口腔菌群的失衡状态的识别方法，其特征在于，所述根据过滤后的口腔菌群平衡组以及口腔菌群失衡组定义口腔核心菌群，包括：
5.根据权利要求4所述的口腔菌群的失衡状态的识别方法，其特征在于，所述基于口腔核心菌群构建口腔菌群的失衡模型，包括：
6.根据权利要求5所述的口腔菌群的失衡状态的识别方法，其特征在于，所述基于口腔核心菌群构建口腔菌群的失衡模型，还包括：
7.根据权利要求6所述的口腔菌群的失衡状态的识别方法，其特征在于，所述根据口腔菌群的失衡模型以及口腔核心菌群定义失衡系数，包括：
8.根据权利要求7所述的口腔菌群的失衡状态的识别方法，其特征在于，所述根据失衡系数的识别而定义口腔菌群的失衡状态，包括：
9.根据权利要求8所述的口腔菌群的失衡状态的识别方法，其特征在于，所述根据失衡系数的识别而定义口腔菌群的失衡状态，还包括：
10.一种口腔菌群的失衡状态的识别系统，其特征在于，所述口腔菌群的失衡状态的识别系统应用于如权利要求1-9中任一所述的口腔菌群的失衡状态的识别方法，所述口腔菌群的失衡状态的识别系统包括：
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【技术特征摘要】
1.一种口腔菌群的失衡状态的识别方法，其特征在于，应用于口腔菌群的失衡状态的识别场景；
2.根据权利要求1所述的口腔菌群的失衡状态的识别方法，其特征在于，所述采集口腔样本的菌群集合，根据口腔样本的菌群集合划分口腔菌群平衡组以及口腔菌群失衡组，包括：
3.根据权利要求2所述的口腔菌群的失衡状态的识别方法，其特征在于，所述定义口腔菌群平衡组的相对丰度，根据口腔菌群平衡组的相对丰度的过滤而定义过滤后的口腔菌群平衡组，包括：
4.根据权利要求3所述的口腔菌群的失衡状态的识别方法，其特征在于，所述根据过滤后的口腔菌群平衡组以及口腔菌群失衡组定义口腔核心菌群，包括：
5.根据权利要求4所述的口腔菌群的失衡状态的识别方法，其特征在于，所述基于口腔核心菌群构建口腔菌群的失衡模型，包括：
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【专利技术属性】
技术研发人员：秦虹琳，覃涛，叶朋朋，陈晓春，
申请(专利权)人：广西爱生生命科技有限公司，
类型：发明
国别省市：
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