一种基于扩散模型进行药物分子生成的处理方法和装置制造方法及图纸

技术编号:43925116 阅读:40 留言:0更新日期:2025-01-03 13:30
本发明专利技术实施例涉及一种基于扩散模型进行药物分子生成的处理方法和装置,所述方法包括:设计一个用于根据模型输入的蛋白质口袋构象进行对应的配体质心坐标和配体原子总数预测的模型作为分子预测模型并对其进行训练;并将训练成熟的DiffBP模型、TargetDiff模型和D3FG模型作为对应的配体分子生成模型、原子级优化模型和组件级优化模型;接收用户输入的药物分子生成任务数据集合作为对应的第一数据集合;基于分子预测模型、配体分子生成模型、原子级优化模型和组件级优化模型根据第一数据集合进行配体分子生成任务处理得到对应的第一任务报告向用户反馈。本发明专利技术基于扩散模型的配体分子设计方式可以缩短设计周期、提高设计效率。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及数据处理,特别涉及一种基于扩散模型进行药物分子生成的处理方法和装置


技术介绍

1、在药物研发领域,基于结构的药物设计(structure-based drug design, sbdd)方式是通过分析靶标蛋白质(又称目标蛋白质)分子的三维构象来设计能与其进行有效结合的配体分子。常规的分析方式是通过分子运动模拟和量子化学计算来进行处理,而通过实践应用我们发现这种常规分析方式的模拟/计算周期较长、分析效率并不高。


技术实现思路

1、本专利技术的目的,就是针对现有技术的缺陷,提供一种基于扩散模型进行药物分子生成的处理方法、装置、电子设备及计算机可读存储介质。本专利技术预先设计一个用于根据模型输入的蛋白质口袋构象进行对应的配体质心坐标和配体原子总数预测处理的模型作为分子预测模型并对其进行训练,并将三类基于扩散模型实现并已训练成熟的配体分子生成模型(diffbp模型、targetdiff模型、d3fg模型)作为对应的配体分子生成模型、原子级优化模型和组件级优化模型;然后使用上述四类模型(分子预测模型、配本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基于扩散模型进行药物分子生成的处理方法,其特征在于,所述方法包括:

2.根据权利要求1所述的基于扩散模型进行药物分子生成的处理方法,其特征在于,

3.根据权利要求1所述的基于扩散模型进行药物分子生成的处理方法,其特征在于,

4.根据权利要求2所述的基于扩散模型进行药物分子生成的处理方法,其特征在于,

5.根据权利要求4所述的基于扩散模型进行药物分子生成的处理方法,其特征在于,所述基于预设的第一数据集对所述分子预测模型进行训练,具体包括:

6.根据权利要求2所述的基于扩散模型进行药物分子生成的处理方法,其特征在于,所述基于...

【技术特征摘要】

1.一种基于扩散模型进行药物分子生成的处理方法,其特征在于,所述方法包括:

2.根据权利要求1所述的基于扩散模型进行药物分子生成的处理方法,其特征在于,

3.根据权利要求1所述的基于扩散模型进行药物分子生成的处理方法,其特征在于,

4.根据权利要求2所述的基于扩散模型进行药物分子生成的处理方法,其特征在于,

5.根据权利要求4所述的基于扩散模型进行药物分子生成的处理方法,其特征在于,所述基于预设的第一数据集对所述分子预测模型进行训练,具体包括:

6.根据权利要求2所述的基于扩散模型进行药物分子生成的处理方法,其特征在于,所述基...

【专利技术属性】
技术研发人员:赵国江林海涛高志锋吴立荣柯国霖张林峰
申请(专利权)人:北京深势科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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