一种生物信息数据分析流程的自动生成方法、介质及设备技术

技术编号:43667218 阅读:25 留言:0更新日期:2024-12-18 20:54
本发明专利技术公开了一种生物信息数据分析流程的自动生成方法、介质及设备,涉及生物信息技术领域。获取用户提供的生物信息数据,提供与生物信息数据的数据类型相匹配的结果输出模块供用户选择,将用户选择的若干结果输出模块分别作为目标模块加入到模块库中,针对每个目标模块检测其前置模块和条件模块,将不在模块库中的前置模块和条件模块都加入到模块库中,并与目标模块连接,再把加入的前置模块和条件模块作为目标模块,重复上述操作,直到模块库中不再加入新的前置模块和条件模块,将连接得到的流程作为生物信息数据分析流程。可以根据用户的需求自动生成分析流程,提高生物信息数据的分析效率,减少人力成本。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物信息,尤其涉及一种生物信息数据分析流程的自动生成方法、介质及设备


技术介绍

1、自2007年以来,第二代大规模并行测序技术发展极为迅猛,为人类更深入地理解遗传病、癌症、生物进化、生理特性等多个生命科学重大课题开辟了崭新的道路。然而生物信息的数据量大,测序长度短,对重复区段及低质量序列敏感等特点也给相应的数据分析流程带来了巨大的挑战。目前分析生物信息数据,需要由经验丰富的生物信息人员(以下简称生信人员)专门开发对应的分析流程并合理设置各项参数才能排除数据中的噪音错误,进而产出正确的结果。这些结果后续还需要经过一系列分析流程才能形成能被不具有深厚生物信息知识背景的普通生物和医学工作者(以下简称为普通生物和医学工作者)所能理解的图形表格等结论。

2、由于生物信息数据分析流程的专业性,其编写、修改和维护只能依赖于生信人员,因此对相关的研究和临床工作容易形成阻碍:一方面,有些研究机构和医院没有预算维持专业生物信息人员,因此相关的数据分析流程必须找外部机构合作,大大降低了响应速度,造成研究和临床工作进度延缓,同时,沟通上的障碍也容易造成本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种生物信息数据分析流程的自动生成方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的生物信息数据分析流程的自动生成方法,其特征在于,预先将生物信息数据分析流程按步骤拆分成若干个前置模块和若干个结果输出模块,每个前置模块和结果输出模块包括脚本文件、配置文件和说明文件,其中所述说明文件包括模块名称、前置模块名称、条件模块名称、输入通道、输出通道。

3.根据权利要求1所述的生物信息数据分析流程的自动生成方法,其特征在于,所述S104中,所述前置模块还包括数据处理时间,当所述目标模块存在多个前置模块时,

4.根据权利要求1所述的生物信息数据分析流程...

【技术特征摘要】

1.一种生物信息数据分析流程的自动生成方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的生物信息数据分析流程的自动生成方法,其特征在于,预先将生物信息数据分析流程按步骤拆分成若干个前置模块和若干个结果输出模块,每个前置模块和结果输出模块包括脚本文件、配置文件和说明文件,其中所述说明文件包括模块名称、前置模块名称、条件模块名称、输入通道、输出通道。

3.根据权利要求1所述的生物信息数据分析流程的自动生成方法,其特征在于,所述s104中,所述前置模块还包括数据处理时间,当所述目标模块存在多个前置模块时,

4.根据权利要求1所述的生物信息数据分析流程的自动生成方法,其特征在于,所述s104中,所述条件模块用于判断所述目标模块输出的数据能否进行下一步分析,若判断结果为否,则显示报错指令,用于提示用户数据不能进行下一步分析。

5.根据权利要求2所述的生物信息数据分析流程的自动生成方法,其特征在于,s104...

【专利技术属性】
技术研发人员:陈灏
申请(专利权)人:解码上海生物医药科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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